MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C

Total Repeats: 2103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017150	GGGCA	2	10	2664829	2664838	20 %	0 %	60 %	20 %	384120319
2002	NC_017150	TAAGT	2	10	2664966	2664975	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_017150	CGCCA	2	10	2666367	2666376	20 %	0 %	20 %	60 %	384120321
2004	NC_017150	TGCCG	2	10	2668285	2668294	0 %	20 %	40 %	40 %	384120322
2005	NC_017150	ATGGA	2	10	2668898	2668907	40 %	20 %	40 %	0 %	384120322
2006	NC_017150	TACGC	2	10	2669029	2669038	20 %	20 %	20 %	40 %	384120322
2007	NC_017150	GCACC	2	10	2669047	2669056	20 %	0 %	20 %	60 %	384120322
2008	NC_017150	CTGCA	2	10	2671657	2671666	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2009	NC_017150	GGGAT	2	10	2671959	2671968	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_017150	GCCCA	2	10	2675971	2675980	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2011	NC_017150	CACGA	2	10	2676038	2676047	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2012	NC_017150	CCCAT	2	10	2677368	2677377	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2013	NC_017150	TTCCA	2	10	2679921	2679930	20 %	40 %	0 %	40 %	384120327
2014	NC_017150	GATCA	2	10	2680797	2680806	40 %	20 %	20 %	20 %	384120328
2015	NC_017150	TGCCC	2	10	2681128	2681137	0 %	20 %	20 %	60 %	384120328
2016	NC_017150	CCAGC	2	10	2683180	2683189	20 %	0 %	20 %	60 %	384120329
2017	NC_017150	TGCAC	2	10	2683399	2683408	20 %	20 %	20 %	40 %	384120330
2018	NC_017150	TGTGG	2	10	2684195	2684204	0 %	40 %	60 %	0 %	384120331
2019	NC_017150	ACAGG	2	10	2684606	2684615	40 %	0 %	40 %	20 %	384120331
2020	NC_017150	ATCAG	2	10	2685533	2685542	40 %	20 %	20 %	20 %	384120331
2021	NC_017150	GGAAC	2	10	2686386	2686395	40 %	0 %	40 %	20 %	384120332
2022	NC_017150	TCTTT	2	10	2686649	2686658	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2023	NC_017150	AAAAG	2	10	2687499	2687508	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_017150	CAAGC	2	10	2688199	2688208	40 %	0 %	20 %	40 %	384120334
2025	NC_017150	GGAAA	2	10	2688822	2688831	60 %	0 %	40 %	0 %	384120334
2026	NC_017150	GCAAA	2	10	2692177	2692186	60 %	0 %	20 %	20 %	384120339
2027	NC_017150	CAGCG	2	10	2692905	2692914	20 %	0 %	40 %	40 %	384120340
2028	NC_017150	TCCGC	2	10	2693894	2693903	0 %	20 %	20 %	60 %	384120341
2029	NC_017150	TTACC	2	10	2694541	2694550	20 %	40 %	0 %	40 %	384120342
2030	NC_017150	TAGAA	2	10	2696747	2696756	60 %	20 %	20 %	0 %	384120344
2031	NC_017150	TCTGC	2	10	2697603	2697612	0 %	40 %	20 %	40 %	384120345
2032	NC_017150	TCCTT	2	10	2698418	2698427	0 %	60 %	0 %	40 %	384120346
2033	NC_017150	AGAAA	2	10	2698722	2698731	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_017150	TGTCC	2	10	2700055	2700064	0 %	40 %	20 %	40 %	384120347
2035	NC_017150	ATGTT	2	10	2701105	2701114	20 %	60 %	20 %	0 %	384120348
2036	NC_017150	TTGTA	2	10	2701386	2701395	20 %	60 %	20 %	0 %	384120348
2037	NC_017150	AGTGT	2	10	2701610	2701619	20 %	40 %	40 %	0 %	384120348
2038	NC_017150	AAAAG	2	10	2702213	2702222	80 %	0 %	20 %	0 %	384120348
2039	NC_017150	GCCCT	2	10	2706914	2706923	0 %	20 %	20 %	60 %	384120354
2040	NC_017150	CTGTG	2	10	2708848	2708857	0 %	40 %	40 %	20 %	384120355
2041	NC_017150	GAAAA	2	10	2709624	2709633	80 %	0 %	20 %	0 %	384120356
2042	NC_017150	TTATT	2	10	2715417	2715426	20 %	80 %	0 %	0 %	384120361
2043	NC_017150	GCCAG	2	10	2717824	2717833	20 %	0 %	40 %	40 %	384120362
2044	NC_017150	TTTGC	2	10	2721859	2721868	0 %	60 %	20 %	20 %	384120366
2045	NC_017150	CCTGC	2	10	2722437	2722446	0 %	20 %	20 %	60 %	384120366
2046	NC_017150	CCACC	2	10	2722554	2722563	20 %	0 %	0 %	80 %	384120366
2047	NC_017150	TGTTC	2	10	2722889	2722898	0 %	60 %	20 %	20 %	384120367
2048	NC_017150	TGTGC	2	10	2724060	2724069	0 %	40 %	40 %	20 %	384120368
2049	NC_017150	CAAGG	2	10	2724276	2724285	40 %	0 %	40 %	20 %	384120369
2050	NC_017150	CTGCA	2	10	2724791	2724800	20 %	20 %	20 %	40 %	384120369
2051	NC_017150	TCAGC	2	10	2729524	2729533	20 %	20 %	20 %	40 %	384120373
2052	NC_017150	GGGCA	2	10	2731411	2731420	20 %	0 %	60 %	20 %	384120375
2053	NC_017150	TTACC	2	10	2731536	2731545	20 %	40 %	0 %	40 %	384120375
2054	NC_017150	TTTCT	2	10	2736049	2736058	0 %	80 %	0 %	20 %	384120377
2055	NC_017150	CAAAG	2	10	2736332	2736341	60 %	0 %	20 %	20 %	384120377
2056	NC_017150	AACAG	2	10	2737313	2737322	60 %	0 %	20 %	20 %	384120377
2057	NC_017150	CAATA	2	10	2738371	2738380	60 %	20 %	0 %	20 %	384120377
2058	NC_017150	CACCC	2	10	2738528	2738537	20 %	0 %	0 %	80 %	384120378
2059	NC_017150	CATCC	2	10	2738660	2738669	20 %	20 %	0 %	60 %	384120378
2060	NC_017150	CATTC	2	10	2741565	2741574	20 %	40 %	0 %	40 %	384120380
2061	NC_017150	TACAA	2	10	2747010	2747019	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2062	NC_017150	CACAT	2	10	2747842	2747851	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2063	NC_017150	CAGAT	2	10	2748394	2748403	40 %	20 %	20 %	20 %	384120386
2064	NC_017150	TGTGT	2	10	2750943	2750952	0 %	60 %	40 %	0 %	384120389
2065	NC_017150	ACGCC	2	10	2753917	2753926	20 %	0 %	20 %	60 %	384120393
2066	NC_017150	TTCAC	2	10	2754762	2754771	20 %	40 %	0 %	40 %	384120394
2067	NC_017150	CAGCC	2	10	2755604	2755613	20 %	0 %	20 %	60 %	384120395
2068	NC_017150	GCCGG	2	10	2757021	2757030	0 %	0 %	60 %	40 %	384120395
2069	NC_017150	TTTTC	2	10	2761121	2761130	0 %	80 %	0 %	20 %	384120399
2070	NC_017150	GTGCT	2	10	2763256	2763265	0 %	40 %	40 %	20 %	384120399
2071	NC_017150	GCATG	2	10	2763967	2763976	20 %	20 %	40 %	20 %	384120400
2072	NC_017150	CGCTA	2	10	2764961	2764970	20 %	20 %	20 %	40 %	384120402
2073	NC_017150	TTCCC	2	10	2765395	2765404	0 %	40 %	0 %	60 %	384120403
2074	NC_017150	GCTGG	2	10	2766060	2766069	0 %	20 %	60 %	20 %	384120404
2075	NC_017150	CATTA	2	10	2766273	2766282	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2076	NC_017150	CTGTT	2	10	2770005	2770014	0 %	60 %	20 %	20 %	384120409
2077	NC_017150	AAAAG	2	10	2774844	2774853	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2078	NC_017150	TCGCG	2	10	2776993	2777002	0 %	20 %	40 %	40 %	384120414
2079	NC_017150	CGCTT	2	10	2777170	2777179	0 %	40 %	20 %	40 %	384120414
2080	NC_017150	GATTA	2	10	2779653	2779662	40 %	40 %	20 %	0 %	384120414
2081	NC_017150	ACATT	2	10	2781460	2781469	40 %	40 %	0 %	20 %	384120415
2082	NC_017150	AACTG	2	10	2784663	2784672	40 %	20 %	20 %	20 %	384120418
2083	NC_017150	GTTAT	2	10	2786718	2786727	20 %	60 %	20 %	0 %	384120422
2084	NC_017150	TGCAC	2	10	2786947	2786956	20 %	20 %	20 %	40 %	384120422
2085	NC_017150	CAAAT	2	10	2794669	2794678	60 %	20 %	0 %	20 %	384120430
2086	NC_017150	CATGG	2	10	2798873	2798882	20 %	20 %	40 %	20 %	384120435
2087	NC_017150	TACAT	2	10	2799595	2799604	40 %	40 %	0 %	20 %	384120436
2088	NC_017150	CACCC	2	10	2799749	2799758	20 %	0 %	0 %	80 %	384120436
2089	NC_017150	CAAAA	2	10	2800635	2800644	80 %	0 %	0 %	20 %	384120437
2090	NC_017150	CCATA	2	10	2800757	2800766	40 %	20 %	0 %	40 %	384120437
2091	NC_017150	CAAAG	2	10	2801368	2801377	60 %	0 %	20 %	20 %	384120437
2092	NC_017150	GCAAA	2	10	2801531	2801540	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2093	NC_017150	GAAAT	2	10	2802064	2802073	60 %	20 %	20 %	0 %	384120438
2094	NC_017150	ATGCC	2	10	2803140	2803149	20 %	20 %	20 %	40 %	384120440
2095	NC_017150	AATAG	2	10	2804167	2804176	60 %	20 %	20 %	0 %	384120441
2096	NC_017150	ACAGA	2	10	2804801	2804810	60 %	0 %	20 %	20 %	384120442
2097	NC_017150	TGTGC	2	10	2805140	2805149	0 %	40 %	40 %	20 %	384120442
2098	NC_017150	CAGCA	2	10	2806271	2806280	40 %	0 %	20 %	40 %	384120443
2099	NC_017150	CCAAG	2	10	2809441	2809450	40 %	0 %	20 %	40 %	384120447
2100	NC_017150	CTTTG	2	10	2810051	2810060	0 %	60 %	20 %	20 %	384120448
2101	NC_017150	GCGGG	2	10	2811127	2811136	0 %	0 %	80 %	20 %	384120449
2102	NC_017150	TGCCC	2	10	2811429	2811438	0 %	20 %	20 %	60 %	384120449
2103	NC_017150	CTGCA	2	10	2812430	2812439	20 %	20 %	20 %	40 %	384120450

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.