MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 plasmid pAPA32-020

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017149	CATCCA	2	12	67	78	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384064455
2	NC_017149	AGATCA	2	12	4106	4117	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384064463
3	NC_017149	GCCTTG	2	12	6177	6188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384064465
4	NC_017149	GATGCC	2	12	8361	8372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384064467
5	NC_017149	CATCCA	2	12	11568	11579	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384064469
6	NC_017149	TCACCA	2	12	27401	27412	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384064483
7	NC_017149	CATCTG	2	12	31441	31452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384064487
8	NC_017149	CAATGC	2	12	33604	33615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384064488
9	NC_017149	AGATGA	2	12	37376	37387	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384064492
10	NC_017149	TGCCAC	2	12	38748	38759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384064493
11	NC_017149	CTGCGG	2	12	43815	43826	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384064496
12	NC_017149	GAAGAT	2	12	44917	44928	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384064497
13	NC_017149	TGTACG	2	12	46395	46406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384064499
14	NC_017149	GGCATC	2	12	47605	47616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384064500
15	NC_017149	CCATGA	2	12	50738	50749	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384064503
16	NC_017149	TATCGC	2	12	52583	52594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384064505
17	NC_017149	TGCCCG	2	12	61100	61111	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384064514
18	NC_017149	GCGATG	2	12	74903	74914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384064529
19	NC_017149	GCTGAT	2	12	80495	80506	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384064536
20	NC_017149	AGTTCC	2	12	82425	82436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384064537
21	NC_017149	GGATGG	2	12	84327	84338	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384064540
22	NC_017149	TGGATG	2	12	86497	86508	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384064543
23	NC_017149	CATCCA	2	12	89849	89860	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384064546
24	NC_017149	TCAAGG	2	12	93859	93870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384064549
25	NC_017149	TGCAGG	2	12	94063	94074	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384064549
26	NC_017149	AGCCTG	2	12	103742	103753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384064560
27	NC_017149	CATCCA	2	12	106355	106366	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384064563
28	NC_017149	CATCCA	2	12	113515	113526	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384064570
29	NC_017149	TGCGCC	2	12	116503	116514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384064573
30	NC_017149	GCAAAG	2	12	116546	116557	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384064573
31	NC_017149	AGTTCC	2	12	117289	117300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384064574
32	NC_017149	GTGATT	2	12	120140	120151	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384064579
33	NC_017149	CGTCAG	2	12	128127	128138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384064585
34	NC_017149	GGACAT	2	12	137954	137965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384064592
35	NC_017149	TTCCAG	2	12	140624	140635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384064594
36	NC_017149	TCTCGG	2	12	141094	141105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384064594
37	NC_017149	CCTTTG	2	12	141243	141254	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384064594
38	NC_017149	CGCCGT	2	12	147423	147434	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384064598
39	NC_017149	TCTTCA	2	12	147517	147528	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384064598
40	NC_017149	TGGATG	2	12	156164	156175	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384064609
41	NC_017149	GGCATC	2	12	158012	158023	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384064610
42	NC_017149	GGATGG	2	12	160850	160861	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384064613
43	NC_017149	TTCGCC	2	12	161895	161906	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384064615
44	NC_017149	GACATG	2	12	168506	168517	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384064617
45	NC_017149	GATGCC	2	12	175245	175256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384064622
46	NC_017149	AAACGT	2	12	176890	176901	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384064623
47	NC_017149	GATGCC	2	12	178197	178208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384064625

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.