MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 plasmid pAPA32-020

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017149	TGTCC	2	10	886	895	0 %	40 %	20 %	40 %	384064457
2	NC_017149	CCAAT	2	10	4003	4012	40 %	20 %	0 %	40 %	384064463
3	NC_017149	GCGGA	2	10	4420	4429	20 %	0 %	60 %	20 %	384064464
4	NC_017149	TGAGA	2	10	5929	5938	40 %	20 %	40 %	0 %	384064465
5	NC_017149	GGCAC	2	10	8920	8929	20 %	0 %	40 %	40 %	384064467
6	NC_017149	CACCC	2	10	9786	9795	20 %	0 %	0 %	80 %	384064468
7	NC_017149	TGATA	2	10	9944	9953	40 %	40 %	20 %	0 %	384064468
8	NC_017149	GGACA	2	10	10765	10774	40 %	0 %	40 %	20 %	384064469
9	NC_017149	TTTCT	2	10	12097	12106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017149	AAAAG	2	10	13311	13320	80 %	0 %	20 %	0 %	384064471
11	NC_017149	TTTTA	2	10	13991	14000	20 %	80 %	0 %	0 %	384064472
12	NC_017149	GGAAA	2	10	15512	15521	60 %	0 %	40 %	0 %	384064473
13	NC_017149	CAATG	2	10	17635	17644	40 %	20 %	20 %	20 %	384064474
14	NC_017149	CCTGC	2	10	19626	19635	0 %	20 %	20 %	60 %	384064476
15	NC_017149	CAGCA	2	10	20035	20044	40 %	0 %	20 %	40 %	384064476
16	NC_017149	ATAGG	2	10	20290	20299	40 %	20 %	40 %	0 %	384064476
17	NC_017149	CATGC	2	10	21389	21398	20 %	20 %	20 %	40 %	384064477
18	NC_017149	CACAC	2	10	21974	21983	40 %	0 %	0 %	60 %	384064478
19	NC_017149	CCAGC	2	10	23410	23419	20 %	0 %	20 %	60 %	384064480
20	NC_017149	GTGGC	2	10	23919	23928	0 %	20 %	60 %	20 %	384064480
21	NC_017149	AAGGC	2	10	27123	27132	40 %	0 %	40 %	20 %	384064483
22	NC_017149	CATTC	2	10	27215	27224	20 %	40 %	0 %	40 %	384064483
23	NC_017149	GGCCC	2	10	28995	29004	0 %	0 %	40 %	60 %	384064483
24	NC_017149	AGGAT	2	10	30340	30349	40 %	20 %	40 %	0 %	384064486
25	NC_017149	TGTGG	2	10	33958	33967	0 %	40 %	60 %	0 %	384064489
26	NC_017149	GGAAA	2	10	34169	34178	60 %	0 %	40 %	0 %	384064489
27	NC_017149	GAAAA	2	10	35455	35464	80 %	0 %	20 %	0 %	384064489
28	NC_017149	GGAAG	2	10	35496	35505	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017149	ACGAT	2	10	36891	36900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017149	TAAAA	2	10	37109	37118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017149	CTGAT	2	10	39730	39739	20 %	40 %	20 %	20 %	384064494
32	NC_017149	AGGCA	2	10	40730	40739	40 %	0 %	40 %	20 %	384064495
33	NC_017149	GTTGG	2	10	43343	43352	0 %	40 %	60 %	0 %	384064496
34	NC_017149	GCCAT	2	10	43394	43403	20 %	20 %	20 %	40 %	384064496
35	NC_017149	ACCAT	2	10	43592	43601	40 %	20 %	0 %	40 %	384064496
36	NC_017149	CCCTG	2	10	45133	45142	0 %	20 %	20 %	60 %	384064497
37	NC_017149	AAATC	2	10	49246	49255	60 %	20 %	0 %	20 %	384064502
38	NC_017149	TGCGC	2	10	50463	50472	0 %	20 %	40 %	40 %	384064503
39	NC_017149	AGGCA	2	10	51467	51476	40 %	0 %	40 %	20 %	384064504
40	NC_017149	ACGAC	2	10	53050	53059	40 %	0 %	20 %	40 %	384064506
41	NC_017149	CGGGT	2	10	55158	55167	0 %	20 %	60 %	20 %	384064509
42	NC_017149	TGCCG	2	10	55770	55779	0 %	20 %	40 %	40 %	384064510
43	NC_017149	GGTCG	2	10	55882	55891	0 %	20 %	60 %	20 %	384064510
44	NC_017149	GCGCC	2	10	57008	57017	0 %	0 %	40 %	60 %	384064511
45	NC_017149	CAGAC	2	10	58278	58287	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017149	CCATC	2	10	58345	58354	20 %	20 %	0 %	60 %	384064513
47	NC_017149	GCGTT	2	10	58683	58692	0 %	40 %	40 %	20 %	384064513
48	NC_017149	GCAGG	2	10	60057	60066	20 %	0 %	60 %	20 %	384064514
49	NC_017149	CCGTC	2	10	60828	60837	0 %	20 %	20 %	60 %	384064514
50	NC_017149	ATTTT	2	10	63376	63385	20 %	80 %	0 %	0 %	384064515
51	NC_017149	GCTGG	2	10	65314	65323	0 %	20 %	60 %	20 %	384064517
52	NC_017149	GTCCA	2	10	65541	65550	20 %	20 %	20 %	40 %	384064517
53	NC_017149	GCCAC	2	10	66228	66237	20 %	0 %	20 %	60 %	384064518
54	NC_017149	GCTGG	2	10	66737	66746	0 %	20 %	60 %	20 %	384064518
55	NC_017149	GGCGC	2	10	68688	68697	0 %	0 %	60 %	40 %	384064522
56	NC_017149	CATGA	2	10	71467	71476	40 %	20 %	20 %	20 %	384064526
57	NC_017149	GCATT	2	10	71970	71979	20 %	40 %	20 %	20 %	384064526
58	NC_017149	GACTG	2	10	72835	72844	20 %	20 %	40 %	20 %	384064527
59	NC_017149	GTCCT	2	10	74718	74727	0 %	40 %	20 %	40 %	384064529
60	NC_017149	TGATC	2	10	75423	75432	20 %	40 %	20 %	20 %	384064530
61	NC_017149	TGCTC	2	10	76204	76213	0 %	40 %	20 %	40 %	384064531
62	NC_017149	TATTG	2	10	76431	76440	20 %	60 %	20 %	0 %	384064531
63	NC_017149	AGCTC	2	10	77560	77569	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017149	CCAGC	2	10	79259	79268	20 %	0 %	20 %	60 %	384064535
65	NC_017149	GAGAT	2	10	80260	80269	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017149	TTTCC	2	10	80722	80731	0 %	60 %	0 %	40 %	384064536
67	NC_017149	GCTGG	2	10	82687	82696	0 %	20 %	60 %	20 %	384064537
68	NC_017149	GCCCG	2	10	83988	83997	0 %	0 %	40 %	60 %	384064540
69	NC_017149	TGAGG	2	10	85064	85073	20 %	20 %	60 %	0 %	384064541
70	NC_017149	AGAAA	2	10	85969	85978	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017149	TGTCC	2	10	87302	87311	0 %	40 %	20 %	40 %	384064543
72	NC_017149	GGACA	2	10	89046	89055	40 %	0 %	40 %	20 %	384064546
73	NC_017149	TTTCT	2	10	90379	90388	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017149	AGCGG	2	10	90658	90667	20 %	0 %	60 %	20 %	384064547
75	NC_017149	TCGCC	2	10	90767	90776	0 %	20 %	20 %	60 %	384064547
76	NC_017149	GCATG	2	10	90953	90962	20 %	20 %	40 %	20 %	384064547
77	NC_017149	ATTCC	2	10	91458	91467	20 %	40 %	0 %	40 %	384064547
78	NC_017149	AGCGA	2	10	93876	93885	40 %	0 %	40 %	20 %	384064549
79	NC_017149	CAAAG	2	10	96047	96056	60 %	0 %	20 %	20 %	384064552
80	NC_017149	CAGCC	2	10	96867	96876	20 %	0 %	20 %	60 %	384064553
81	NC_017149	AGACA	2	10	98248	98257	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017149	GTTGG	2	10	100432	100441	0 %	40 %	60 %	0 %	384064557
83	NC_017149	TTTTC	2	10	101545	101554	0 %	80 %	0 %	20 %	384064557
84	NC_017149	GTGCC	2	10	102071	102080	0 %	20 %	40 %	40 %	384064557
85	NC_017149	CCAGC	2	10	102558	102567	20 %	0 %	20 %	60 %	384064559
86	NC_017149	GTGGC	2	10	103067	103076	0 %	20 %	60 %	20 %	384064559
87	NC_017149	CACTG	2	10	103983	103992	20 %	20 %	20 %	40 %	384064561
88	NC_017149	TGGAC	2	10	104346	104355	20 %	20 %	40 %	20 %	384064561
89	NC_017149	GGACA	2	10	105552	105561	40 %	0 %	40 %	20 %	384064563
90	NC_017149	TGCGC	2	10	110147	110156	0 %	20 %	40 %	40 %	384064568
91	NC_017149	GGACA	2	10	112712	112721	40 %	0 %	40 %	20 %	384064570
92	NC_017149	GATAA	2	10	114225	114234	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017149	CCATG	2	10	114613	114622	20 %	20 %	20 %	40 %	384064571
94	NC_017149	GATAC	2	10	116689	116698	40 %	20 %	20 %	20 %	384064573
95	NC_017149	GCTGG	2	10	117551	117560	0 %	20 %	60 %	20 %	384064574
96	NC_017149	CTGAC	2	10	118186	118195	20 %	20 %	20 %	40 %	384064577
97	NC_017149	TTTTC	2	10	118980	118989	0 %	80 %	0 %	20 %	384064578
98	NC_017149	CGTTT	2	10	119631	119640	0 %	60 %	20 %	20 %	384064579
99	NC_017149	CACTG	2	10	121386	121395	20 %	20 %	20 %	40 %	384064579
100	NC_017149	TTATT	2	10	126656	126665	20 %	80 %	0 %	0 %	384064584
101	NC_017149	CGTTC	2	10	127203	127212	0 %	40 %	20 %	40 %	384064585
102	NC_017149	CGGTC	2	10	128949	128958	0 %	20 %	40 %	40 %	384064586
103	NC_017149	GAAGC	2	10	132093	132102	40 %	0 %	40 %	20 %	384064587
104	NC_017149	TCAAG	2	10	133131	133140	40 %	20 %	20 %	20 %	384064588
105	NC_017149	CAGGA	2	10	134251	134260	40 %	0 %	40 %	20 %	384064589
106	NC_017149	CGGAC	2	10	135105	135114	20 %	0 %	40 %	40 %	384064589
107	NC_017149	GAGCA	2	10	137241	137250	40 %	0 %	40 %	20 %	384064591
108	NC_017149	GACAG	2	10	138415	138424	40 %	0 %	40 %	20 %	384064593
109	NC_017149	GCTGT	2	10	142569	142578	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017149	AGCGG	2	10	142650	142659	20 %	0 %	60 %	20 %	384064595
111	NC_017149	CGCGA	2	10	146926	146935	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017149	AGGTC	2	10	147737	147746	20 %	20 %	40 %	20 %	384064599
113	NC_017149	CATCG	2	10	149288	149297	20 %	20 %	20 %	40 %	384064600
114	NC_017149	GGCAG	2	10	149790	149799	20 %	0 %	60 %	20 %	384064601
115	NC_017149	CGGCA	2	10	150231	150240	20 %	0 %	40 %	40 %	384064601
116	NC_017149	CCTCA	2	10	152774	152783	20 %	20 %	0 %	60 %	384064604
117	NC_017149	CCGGG	2	10	153849	153858	0 %	0 %	60 %	40 %	384064605
118	NC_017149	CGTTT	2	10	154790	154799	0 %	60 %	20 %	20 %	384064607
119	NC_017149	AGAAA	2	10	155636	155645	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017149	TGTCC	2	10	156969	156978	0 %	40 %	20 %	40 %	384064609
121	NC_017149	GCCAT	2	10	159119	159128	20 %	20 %	20 %	40 %	384064611
122	NC_017149	TCTTT	2	10	159638	159647	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017149	TGAAT	2	10	159976	159985	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017149	AGCTG	2	10	160166	160175	20 %	20 %	40 %	20 %	384064612
125	NC_017149	CGTTC	2	10	162714	162723	0 %	40 %	20 %	40 %	384064616
126	NC_017149	CCCTG	2	10	166572	166581	0 %	20 %	20 %	60 %	384064617
127	NC_017149	CTGCT	2	10	168244	168253	0 %	40 %	20 %	40 %	384064617
128	NC_017149	GAGGG	2	10	168396	168405	20 %	0 %	80 %	0 %	384064617
129	NC_017149	GGAGC	2	10	168700	168709	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017149	AGCAA	2	10	169606	169615	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017149	ATTAA	2	10	171299	171308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017149	TTGAA	2	10	172596	172605	40 %	40 %	20 %	0 %	384064620
133	NC_017149	GCGTT	2	10	172737	172746	0 %	40 %	40 %	20 %	384064620
134	NC_017149	GGGCA	2	10	174165	174174	20 %	0 %	60 %	20 %	384064621
135	NC_017149	GGCAC	2	10	175804	175813	20 %	0 %	40 %	40 %	384064622

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.