MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 plasmid pAPA32-020

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017149	TTTCT	2	10	12097	12106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017149	GGAAG	2	10	35496	35505	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017149	ACGAT	2	10	36891	36900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017149	TAAAA	2	10	37109	37118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017149	CAGAC	2	10	58278	58287	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017149	AGCTC	2	10	77560	77569	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017149	GAGAT	2	10	80260	80269	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017149	AGAAA	2	10	85969	85978	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017149	TTTCT	2	10	90379	90388	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017149	AGACA	2	10	98248	98257	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017149	GATAA	2	10	114225	114234	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017149	GCTGT	2	10	142569	142578	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017149	CGCGA	2	10	146926	146935	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017149	AGAAA	2	10	155636	155645	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017149	TCTTT	2	10	159638	159647	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017149	TGAAT	2	10	159976	159985	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017149	GGAGC	2	10	168700	168709	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017149	AGCAA	2	10	169606	169615	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017149	ATTAA	2	10	171299	171308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.