MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 plasmid pAPA32-020

Total Repeats: 405

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017149	CGGG	2	8	87	94	0 %	0 %	75 %	25 %	384064455
2	NC_017149	TCTG	2	8	561	568	0 %	50 %	25 %	25 %	384064456
3	NC_017149	CGTC	2	8	874	881	0 %	25 %	25 %	50 %	384064457
4	NC_017149	AACA	2	8	1292	1299	75 %	0 %	0 %	25 %	384064458
5	NC_017149	TGGC	2	8	2514	2521	0 %	25 %	50 %	25 %	384064460
6	NC_017149	TCGT	2	8	3343	3350	0 %	50 %	25 %	25 %	384064462
7	NC_017149	CCAT	2	8	3600	3607	25 %	25 %	0 %	50 %	384064462
8	NC_017149	ATAA	2	8	3657	3664	75 %	25 %	0 %	0 %	384064462
9	NC_017149	TGGG	2	8	4569	4576	0 %	25 %	75 %	0 %	384064464
10	NC_017149	CCTT	2	8	4594	4601	0 %	50 %	0 %	50 %	384064464
11	NC_017149	CATG	2	8	4908	4915	25 %	25 %	25 %	25 %	384064465
12	NC_017149	CGGC	2	8	7116	7123	0 %	0 %	50 %	50 %	384064466
13	NC_017149	GCCT	2	8	7360	7367	0 %	25 %	25 %	50 %	384064466
14	NC_017149	GGGC	2	8	7433	7440	0 %	0 %	75 %	25 %	384064466
15	NC_017149	GCCA	2	8	7656	7663	25 %	0 %	25 %	50 %	384064466
16	NC_017149	GATG	2	8	8287	8294	25 %	25 %	50 %	0 %	384064467
17	NC_017149	ACGC	2	8	8768	8775	25 %	0 %	25 %	50 %	384064467
18	NC_017149	GTGC	2	8	9582	9589	0 %	25 %	50 %	25 %	384064468
19	NC_017149	CACC	2	8	10017	10024	25 %	0 %	0 %	75 %	384064468
20	NC_017149	CCAT	2	8	10099	10106	25 %	25 %	0 %	50 %	384064468
21	NC_017149	GACG	2	8	10779	10786	25 %	0 %	50 %	25 %	384064469
22	NC_017149	CTTC	2	8	11418	11425	0 %	50 %	0 %	50 %	384064469
23	NC_017149	CGGG	2	8	11588	11595	0 %	0 %	75 %	25 %	384064469
24	NC_017149	GCCA	2	8	11722	11729	25 %	0 %	25 %	50 %	384064469
25	NC_017149	TCGA	2	8	12627	12634	25 %	25 %	25 %	25 %	384064470
26	NC_017149	ATGG	2	8	13366	13373	25 %	25 %	50 %	0 %	384064471
27	NC_017149	TATC	2	8	13486	13493	25 %	50 %	0 %	25 %	384064471
28	NC_017149	ACCC	2	8	13601	13608	25 %	0 %	0 %	75 %	384064471
29	NC_017149	AGAC	2	8	13721	13728	50 %	0 %	25 %	25 %	384064471
30	NC_017149	TCCT	2	8	14307	14314	0 %	50 %	0 %	50 %	384064472
31	NC_017149	TGCG	2	8	14597	14604	0 %	25 %	50 %	25 %	384064472
32	NC_017149	AGTG	2	8	14704	14711	25 %	25 %	50 %	0 %	384064472
33	NC_017149	CAAT	2	8	15055	15062	50 %	25 %	0 %	25 %	384064472
34	NC_017149	AGAT	2	8	15129	15136	50 %	25 %	25 %	0 %	384064472
35	NC_017149	CAGC	2	8	15743	15750	25 %	0 %	25 %	50 %	384064473
36	NC_017149	AACC	2	8	15848	15855	50 %	0 %	0 %	50 %	384064473
37	NC_017149	AAAC	2	8	16914	16921	75 %	0 %	0 %	25 %	384064474
38	NC_017149	CAGA	2	8	17163	17170	50 %	0 %	25 %	25 %	384064474
39	NC_017149	ACAT	2	8	17816	17823	50 %	25 %	0 %	25 %	384064474
40	NC_017149	GTCA	2	8	18151	18158	25 %	25 %	25 %	25 %	384064474
41	NC_017149	GGGC	2	8	18324	18331	0 %	0 %	75 %	25 %	384064475
42	NC_017149	AGAT	2	8	18582	18589	50 %	25 %	25 %	0 %	384064475
43	NC_017149	CAGA	2	8	19019	19026	50 %	0 %	25 %	25 %	384064476
44	NC_017149	CCGC	2	8	19208	19215	0 %	0 %	25 %	75 %	384064476
45	NC_017149	GTAT	2	8	20679	20686	25 %	50 %	25 %	0 %	384064477
46	NC_017149	GACA	2	8	20979	20986	50 %	0 %	25 %	25 %	384064477
47	NC_017149	TGAA	2	8	21102	21109	50 %	25 %	25 %	0 %	384064477
48	NC_017149	GAAC	2	8	21813	21820	50 %	0 %	25 %	25 %	384064478
49	NC_017149	GAAG	2	8	23380	23387	50 %	0 %	50 %	0 %	384064479
50	NC_017149	GATG	2	8	23793	23800	25 %	25 %	50 %	0 %	384064480
51	NC_017149	GTCA	2	8	23968	23975	25 %	25 %	25 %	25 %	384064480
52	NC_017149	TTTG	2	8	24102	24109	0 %	75 %	25 %	0 %	384064480
53	NC_017149	CATC	2	8	24507	24514	25 %	25 %	0 %	50 %	384064481
54	NC_017149	CGCA	2	8	25688	25695	25 %	0 %	25 %	50 %	384064482
55	NC_017149	ATCA	2	8	25916	25923	50 %	25 %	0 %	25 %	384064482
56	NC_017149	TGCC	2	8	25988	25995	0 %	25 %	25 %	50 %	384064482
57	NC_017149	TCAC	2	8	26123	26130	25 %	25 %	0 %	50 %	384064483
58	NC_017149	AGCC	3	12	26574	26585	25 %	0 %	25 %	50 %	384064483
59	NC_017149	TCCA	2	8	27262	27269	25 %	25 %	0 %	50 %	384064483
60	NC_017149	TGGC	2	8	27494	27501	0 %	25 %	50 %	25 %	384064483
61	NC_017149	GTCC	2	8	27542	27549	0 %	25 %	25 %	50 %	384064483
62	NC_017149	CGGA	2	8	29386	29393	25 %	0 %	50 %	25 %	384064483
63	NC_017149	TGGC	2	8	29654	29661	0 %	25 %	50 %	25 %	384064484
64	NC_017149	CATC	2	8	31929	31936	25 %	25 %	0 %	50 %	384064487
65	NC_017149	AACC	2	8	32208	32215	50 %	0 %	0 %	50 %	384064487
66	NC_017149	AGCC	2	8	33025	33032	25 %	0 %	25 %	50 %	384064487
67	NC_017149	CTGC	2	8	34244	34251	0 %	25 %	25 %	50 %	384064489
68	NC_017149	CCAA	2	8	34290	34297	50 %	0 %	0 %	50 %	384064489
69	NC_017149	TTGT	2	8	34645	34652	0 %	75 %	25 %	0 %	384064489
70	NC_017149	ATCC	2	8	34709	34716	25 %	25 %	0 %	50 %	384064489
71	NC_017149	TGCC	2	8	34783	34790	0 %	25 %	25 %	50 %	384064489
72	NC_017149	CAGC	2	8	35597	35604	25 %	0 %	25 %	50 %	384064490
73	NC_017149	AAGC	2	8	35822	35829	50 %	0 %	25 %	25 %	384064490
74	NC_017149	ACGA	2	8	35937	35944	50 %	0 %	25 %	25 %	384064490
75	NC_017149	AAAT	2	8	36012	36019	75 %	25 %	0 %	0 %	384064491
76	NC_017149	AGCC	2	8	36032	36039	25 %	0 %	25 %	50 %	384064491
77	NC_017149	AAGC	2	8	36262	36269	50 %	0 %	25 %	25 %	384064491
78	NC_017149	AACA	2	8	36440	36447	75 %	0 %	0 %	25 %	384064491
79	NC_017149	AAAG	2	8	36661	36668	75 %	0 %	25 %	0 %	384064491
80	NC_017149	GCAA	2	8	36672	36679	50 %	0 %	25 %	25 %	384064491
81	NC_017149	ATTT	2	8	37196	37203	25 %	75 %	0 %	0 %	384064492
82	NC_017149	CTGC	2	8	37669	37676	0 %	25 %	25 %	50 %	384064492
83	NC_017149	CCAG	2	8	37740	37747	25 %	0 %	25 %	50 %	384064492
84	NC_017149	TTTC	2	8	37873	37880	0 %	75 %	0 %	25 %	384064492
85	NC_017149	TGGA	2	8	38696	38703	25 %	25 %	50 %	0 %	384064493
86	NC_017149	CACG	2	8	39350	39357	25 %	0 %	25 %	50 %	384064494
87	NC_017149	GCCT	2	8	39607	39614	0 %	25 %	25 %	50 %	384064494
88	NC_017149	TTCA	2	8	39663	39670	25 %	50 %	0 %	25 %	384064494
89	NC_017149	TCAC	2	8	40248	40255	25 %	25 %	0 %	50 %	384064495
90	NC_017149	CCAT	2	8	40713	40720	25 %	25 %	0 %	50 %	384064495
91	NC_017149	GGCT	2	8	41097	41104	0 %	25 %	50 %	25 %	384064495
92	NC_017149	TGCG	3	12	41172	41183	0 %	25 %	50 %	25 %	384064495
93	NC_017149	CAGC	2	8	41461	41468	25 %	0 %	25 %	50 %	384064495
94	NC_017149	GTGC	2	8	42249	42256	0 %	25 %	50 %	25 %	384064495
95	NC_017149	CCAC	2	8	42398	42405	25 %	0 %	0 %	75 %	384064495
96	NC_017149	CTCA	2	8	42446	42453	25 %	25 %	0 %	50 %	384064495
97	NC_017149	GCAT	2	8	43157	43164	25 %	25 %	25 %	25 %	384064496
98	NC_017149	TATC	2	8	43212	43219	25 %	50 %	0 %	25 %	384064496
99	NC_017149	CAGA	2	8	43518	43525	50 %	0 %	25 %	25 %	384064496
100	NC_017149	CTGC	2	8	43734	43741	0 %	25 %	25 %	50 %	384064496
101	NC_017149	CCTG	2	8	43752	43759	0 %	25 %	25 %	50 %	384064496
102	NC_017149	ACCA	2	8	43789	43796	50 %	0 %	0 %	50 %	384064496
103	NC_017149	GCAG	2	8	44295	44302	25 %	0 %	50 %	25 %	384064497
104	NC_017149	CTGC	2	8	44309	44316	0 %	25 %	25 %	50 %	384064497
105	NC_017149	AAGC	2	8	44504	44511	50 %	0 %	25 %	25 %	384064497
106	NC_017149	CTGG	2	8	44804	44811	0 %	25 %	50 %	25 %	384064497
107	NC_017149	CCCT	2	8	45165	45172	0 %	25 %	0 %	75 %	384064497
108	NC_017149	CGAA	2	8	45401	45408	50 %	0 %	25 %	25 %	384064497
109	NC_017149	CCGG	2	8	45658	45665	0 %	0 %	50 %	50 %	384064498
110	NC_017149	GGCA	2	8	45743	45750	25 %	0 %	50 %	25 %	384064498
111	NC_017149	GCGT	2	8	47202	47209	0 %	25 %	50 %	25 %	384064500
112	NC_017149	CATC	2	8	47683	47690	25 %	25 %	0 %	50 %	384064500
113	NC_017149	AGCG	2	8	47798	47805	25 %	0 %	50 %	25 %	384064500
114	NC_017149	GACA	2	8	48781	48788	50 %	0 %	25 %	25 %	384064501
115	NC_017149	TGGT	2	8	48824	48831	0 %	50 %	50 %	0 %	384064501
116	NC_017149	CTGA	2	8	48857	48864	25 %	25 %	25 %	25 %	384064501
117	NC_017149	GAAC	2	8	48912	48919	50 %	0 %	25 %	25 %	384064501
118	NC_017149	CATC	2	8	49130	49137	25 %	25 %	0 %	50 %	384064501
119	NC_017149	CAAC	2	8	49859	49866	50 %	0 %	0 %	50 %	384064502
120	NC_017149	CTGA	2	8	49936	49943	25 %	25 %	25 %	25 %	384064502
121	NC_017149	GCCA	2	8	49986	49993	25 %	0 %	25 %	50 %	384064502
122	NC_017149	ATCA	2	8	50310	50317	50 %	25 %	0 %	25 %	384064502
123	NC_017149	CGGG	2	8	50494	50501	0 %	0 %	75 %	25 %	384064503
124	NC_017149	AATG	2	8	51414	51421	50 %	25 %	25 %	0 %	384064504
125	NC_017149	GATC	2	8	52992	52999	25 %	25 %	25 %	25 %	384064506
126	NC_017149	CAGT	2	8	53754	53761	25 %	25 %	25 %	25 %	384064508
127	NC_017149	GCCC	2	8	54389	54396	0 %	0 %	25 %	75 %	384064509
128	NC_017149	CGTC	2	8	54765	54772	0 %	25 %	25 %	50 %	384064509
129	NC_017149	CACC	2	8	54871	54878	25 %	0 %	0 %	75 %	384064509
130	NC_017149	ACAA	2	8	54945	54952	75 %	0 %	0 %	25 %	384064509
131	NC_017149	GGGT	2	8	55844	55851	0 %	25 %	75 %	0 %	384064510
132	NC_017149	CGGG	2	8	56177	56184	0 %	0 %	75 %	25 %	384064511
133	NC_017149	CAGG	2	8	56655	56662	25 %	0 %	50 %	25 %	384064511
134	NC_017149	CAGC	2	8	56840	56847	25 %	0 %	25 %	50 %	384064511
135	NC_017149	CGGA	2	8	57511	57518	25 %	0 %	50 %	25 %	384064512
136	NC_017149	ACGC	2	8	58813	58820	25 %	0 %	25 %	50 %	384064513
137	NC_017149	TTCC	2	8	59185	59192	0 %	50 %	0 %	50 %	384064514
138	NC_017149	CTGG	2	8	59622	59629	0 %	25 %	50 %	25 %	384064514
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.