MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-26 plasmid pAPA26-030

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017147	ATGG	2	8	217	224	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017147	TAAT	2	8	446	453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017147	TTGT	2	8	685	692	0 %	75 %	25 %	0 %	384061153
4	NC_017147	AGAA	2	8	889	896	75 %	0 %	25 %	0 %	384061153
5	NC_017147	CCAT	2	8	1089	1096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017147	TGAA	2	8	1399	1406	50 %	25 %	25 %	0 %	384061154
7	NC_017147	GGCG	2	8	1515	1522	0 %	0 %	75 %	25 %	384061155
8	NC_017147	CGAT	2	8	1595	1602	25 %	25 %	25 %	25 %	384061155
9	NC_017147	TTGA	2	8	1848	1855	25 %	50 %	25 %	0 %	384061155
10	NC_017147	GGCA	2	8	1877	1884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017147	GTAA	2	8	2733	2740	50 %	25 %	25 %	0 %	384061157
12	NC_017147	TCTG	2	8	3038	3045	0 %	50 %	25 %	25 %	384061157
13	NC_017147	CTCA	2	8	3269	3276	25 %	25 %	0 %	50 %	384061158
14	NC_017147	GATG	2	8	3378	3385	25 %	25 %	50 %	0 %	384061158
15	NC_017147	GTCC	2	8	4177	4184	0 %	25 %	25 %	50 %	384061160
16	NC_017147	GCCA	2	8	4893	4900	25 %	0 %	25 %	50 %	384061160
17	NC_017147	ACCC	2	8	4945	4952	25 %	0 %	0 %	75 %	384061160
18	NC_017147	AGAA	2	8	5068	5075	75 %	0 %	25 %	0 %	384061160
19	NC_017147	AACT	2	8	6159	6166	50 %	25 %	0 %	25 %	384061160
20	NC_017147	CAAT	2	8	6727	6734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017147	TGGC	2	8	6952	6959	0 %	25 %	50 %	25 %	384061162
22	NC_017147	AGCG	2	8	7805	7812	25 %	0 %	50 %	25 %	384061164
23	NC_017147	TGAC	2	8	8169	8176	25 %	25 %	25 %	25 %	384061165
24	NC_017147	TCCA	2	8	8342	8349	25 %	25 %	0 %	50 %	384061165
25	NC_017147	CTTC	2	8	8757	8764	0 %	50 %	0 %	50 %	384061166
26	NC_017147	CTGA	2	8	8839	8846	25 %	25 %	25 %	25 %	384061166
27	NC_017147	TGCT	2	8	9217	9224	0 %	50 %	25 %	25 %	384061167
28	NC_017147	TGTC	2	8	10276	10283	0 %	50 %	25 %	25 %	384061168
29	NC_017147	TGAT	2	8	10540	10547	25 %	50 %	25 %	0 %	384061169
30	NC_017147	AATC	2	8	10835	10842	50 %	25 %	0 %	25 %	384061169
31	NC_017147	CTCG	2	8	11087	11094	0 %	25 %	25 %	50 %	384061169
32	NC_017147	GATG	2	8	11472	11479	25 %	25 %	50 %	0 %	384061169
33	NC_017147	AGAA	2	8	11792	11799	75 %	0 %	25 %	0 %	384061169
34	NC_017147	CAGC	2	8	11847	11854	25 %	0 %	25 %	50 %	384061169
35	NC_017147	TCGA	2	8	12399	12406	25 %	25 %	25 %	25 %	384061170
36	NC_017147	TGCC	2	8	12770	12777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017147	AGCG	2	8	13231	13238	25 %	0 %	50 %	25 %	384061171
38	NC_017147	ATTG	2	8	14735	14742	25 %	50 %	25 %	0 %	384061174
39	NC_017147	CATT	2	8	15015	15022	25 %	50 %	0 %	25 %	384061174
40	NC_017147	AGAT	2	8	15586	15593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017147	CGTC	2	8	16292	16299	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017147	GCTG	2	8	16574	16581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017147	ACTC	2	8	17141	17148	25 %	25 %	0 %	50 %	384061176
44	NC_017147	GCCG	3	12	17947	17958	0 %	0 %	50 %	50 %	384061178
45	NC_017147	CCAG	2	8	18331	18338	25 %	0 %	25 %	50 %	384061179
46	NC_017147	AGGG	2	8	19143	19150	25 %	0 %	75 %	0 %	384061182
47	NC_017147	TTGC	2	8	19234	19241	0 %	50 %	25 %	25 %	384061182
48	NC_017147	GTGC	2	8	19975	19982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017147	GCCT	2	8	20095	20102	0 %	25 %	25 %	50 %	384061185
50	NC_017147	TCGA	2	8	20198	20205	25 %	25 %	25 %	25 %	384061185
51	NC_017147	AATC	2	8	20402	20409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017147	CCGG	2	8	20534	20541	0 %	0 %	50 %	50 %	384061186
53	NC_017147	GGAC	2	8	20880	20887	25 %	0 %	50 %	25 %	384061186
54	NC_017147	GATC	2	8	21054	21061	25 %	25 %	25 %	25 %	384061186
55	NC_017147	CCGG	2	8	21115	21122	0 %	0 %	50 %	50 %	384061186
56	NC_017147	TCGC	2	8	21439	21446	0 %	25 %	25 %	50 %	384061186
57	NC_017147	TCTG	2	8	21834	21841	0 %	50 %	25 %	25 %	384061186
58	NC_017147	CAGG	2	8	22806	22813	25 %	0 %	50 %	25 %	384061186
59	NC_017147	GCCG	2	8	23034	23041	0 %	0 %	50 %	50 %	384061186
60	NC_017147	GCGG	2	8	23226	23233	0 %	0 %	75 %	25 %	384061186
61	NC_017147	GCGG	2	8	23352	23359	0 %	0 %	75 %	25 %	384061186
62	NC_017147	GATC	2	8	23962	23969	25 %	25 %	25 %	25 %	384061188
63	NC_017147	GGGC	2	8	24179	24186	0 %	0 %	75 %	25 %	384061188
64	NC_017147	CTGT	2	8	24671	24678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017147	GACG	2	8	24775	24782	25 %	0 %	50 %	25 %	384061190
66	NC_017147	GCGG	2	8	25583	25590	0 %	0 %	75 %	25 %	384061190
67	NC_017147	GCCA	2	8	25718	25725	25 %	0 %	25 %	50 %	384061190
68	NC_017147	TCTG	2	8	26058	26065	0 %	50 %	25 %	25 %	384061190
69	NC_017147	CCTT	2	8	26190	26197	0 %	50 %	0 %	50 %	384061191
70	NC_017147	GAAT	2	8	26259	26266	50 %	25 %	25 %	0 %	384061191
71	NC_017147	ACTG	2	8	26316	26323	25 %	25 %	25 %	25 %	384061191
72	NC_017147	GAAC	2	8	27226	27233	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017147	TAAG	2	8	27255	27262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017147	AGAA	2	8	27480	27487	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017147	AGCA	2	8	28629	28636	50 %	0 %	25 %	25 %	384061194
76	NC_017147	GCTG	2	8	29049	29056	0 %	25 %	50 %	25 %	384061195
77	NC_017147	CCCA	2	8	29411	29418	25 %	0 %	0 %	75 %	384061196
78	NC_017147	GGCA	2	8	30017	30024	25 %	0 %	50 %	25 %	384061196
79	NC_017147	TGAC	2	8	30386	30393	25 %	25 %	25 %	25 %	384061197
80	NC_017147	TCCA	2	8	30559	30566	25 %	25 %	0 %	50 %	384061197
81	NC_017147	CTTC	2	8	30974	30981	0 %	50 %	0 %	50 %	384061198
82	NC_017147	CTGA	2	8	31056	31063	25 %	25 %	25 %	25 %	384061198
83	NC_017147	ATCA	2	8	32777	32784	50 %	25 %	0 %	25 %	384061200
84	NC_017147	CTGC	2	8	32875	32882	0 %	25 %	25 %	50 %	384061200
85	NC_017147	CCTT	2	8	33525	33532	0 %	50 %	0 %	50 %	384061200
86	NC_017147	GGAC	2	8	33727	33734	25 %	0 %	50 %	25 %	384061200
87	NC_017147	GTTC	2	8	34324	34331	0 %	50 %	25 %	25 %	384061200
88	NC_017147	CCGA	2	8	34703	34710	25 %	0 %	25 %	50 %	384061201
89	NC_017147	TTGT	2	8	35031	35038	0 %	75 %	25 %	0 %	384061201
90	NC_017147	AGGA	2	8	35054	35061	50 %	0 %	50 %	0 %	384061201
91	NC_017147	TTTC	2	8	35344	35351	0 %	75 %	0 %	25 %	384061201
92	NC_017147	CCGC	2	8	36163	36170	0 %	0 %	25 %	75 %	384061201
93	NC_017147	GCCT	2	8	36320	36327	0 %	25 %	25 %	50 %	384061201
94	NC_017147	GATG	2	8	37126	37133	25 %	25 %	50 %	0 %	384061201
95	NC_017147	TCCG	2	8	37575	37582	0 %	25 %	25 %	50 %	384061202
96	NC_017147	GATG	2	8	37855	37862	25 %	25 %	50 %	0 %	384061202
97	NC_017147	CCCG	2	8	37969	37976	0 %	0 %	25 %	75 %	384061202
98	NC_017147	ATCA	2	8	38288	38295	50 %	25 %	0 %	25 %	384061202
99	NC_017147	TCAG	2	8	38583	38590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017147	GTTT	2	8	39389	39396	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017147	ATGA	2	8	39916	39923	50 %	25 %	25 %	0 %	384061204
102	NC_017147	CCAA	2	8	40274	40281	50 %	0 %	0 %	50 %	384061205
103	NC_017147	ACCG	2	8	40628	40635	25 %	0 %	25 %	50 %	384061205
104	NC_017147	CGCT	2	8	40801	40808	0 %	25 %	25 %	50 %	384061206
105	NC_017147	GGCA	2	8	41051	41058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017147	CTGT	2	8	41741	41748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017147	GACG	2	8	41845	41852	25 %	0 %	50 %	25 %	384061208
108	NC_017147	CTTC	2	8	42484	42491	0 %	50 %	0 %	50 %	384061208
109	NC_017147	CGGG	2	8	42654	42661	0 %	0 %	75 %	25 %	384061208
110	NC_017147	CTGC	2	8	42745	42752	0 %	25 %	25 %	50 %	384061208
111	NC_017147	GCCA	2	8	42788	42795	25 %	0 %	25 %	50 %	384061208
112	NC_017147	TCTG	2	8	43128	43135	0 %	50 %	25 %	25 %	384061208
113	NC_017147	AGGA	2	8	43290	43297	50 %	0 %	50 %	0 %	384061209
114	NC_017147	GTCC	2	8	43959	43966	0 %	25 %	25 %	50 %	384061210
115	NC_017147	GCCA	2	8	44675	44682	25 %	0 %	25 %	50 %	384061210
116	NC_017147	ACCC	2	8	44727	44734	25 %	0 %	0 %	75 %	384061210
117	NC_017147	AGAA	2	8	44850	44857	75 %	0 %	25 %	0 %	384061210
118	NC_017147	CAAT	2	8	46074	46081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017147	GAAG	2	8	46552	46559	50 %	0 %	50 %	0 %	384061211
120	NC_017147	TGGA	2	8	46967	46974	25 %	25 %	50 %	0 %	384061212
121	NC_017147	GTCA	2	8	47140	47147	25 %	25 %	25 %	25 %	384061212
122	NC_017147	TTTC	2	8	48808	48815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017147	CTTA	2	8	49034	49041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017147	GTTC	2	8	49063	49070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.