MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-26

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017146	TATTTT	2	12	157463	157474	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017146	TTTTGC	2	12	163909	163920	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017146	TGTGTA	2	12	185229	185240	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017146	TATTTA	2	12	185346	185357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017146	GTCGGA	2	12	196772	196783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017146	ACCTTT	2	12	230042	230053	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017146	CGACCG	2	12	278785	278796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017146	TGCCAC	2	12	291046	291057	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017146	GGGCGG	2	12	309571	309582	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017146	AGAAAA	2	12	318237	318248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017146	TTCTGG	2	12	349051	349062	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017146	GGCGCG	2	12	419525	419536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017146	TATGCA	2	12	473968	473979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017146	AAACCA	2	12	521863	521874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017146	AAAATT	2	12	530972	530983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017146	TAAAAA	2	12	533157	533168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017146	TGCCAA	2	12	645192	645203	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017146	GTGCGT	2	12	723388	723399	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017146	AAAAGG	2	12	753042	753053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017146	TGAACG	2	12	766363	766374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017146	TAAAGC	2	12	774378	774389	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017146	GCGCAA	2	12	791217	791228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017146	TGCGCG	2	12	866628	866639	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017146	GAAGGT	2	12	867500	867511	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017146	AGACGG	2	12	963622	963633	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017146	CCTTTC	2	12	1022636	1022647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017146	GCCGGG	2	12	1042778	1042789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017146	TTTTCT	2	12	1055346	1055357	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017146	GGGGAT	2	12	1089924	1089935	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017146	TGTTGG	2	12	1090502	1090513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017146	GGGCAG	2	12	1192174	1192185	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017146	ACGGAA	2	12	1220214	1220225	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017146	GGAACG	2	12	1244204	1244215	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017146	TATTCG	2	12	1318954	1318965	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017146	AAACAT	2	12	1335039	1335050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017146	TTCAGG	2	12	1335112	1335123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017146	CAAAAA	2	12	1348820	1348831	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017146	CAAAAA	2	12	1369744	1369755	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017146	TTGGGG	2	12	1370278	1370289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017146	TTTTTG	2	12	1463492	1463503	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017146	CTCGCC	2	12	1539154	1539165	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017146	TTTGAT	2	12	1729472	1729483	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017146	CTCGCC	2	12	1732237	1732248	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017146	CCGAAA	2	12	1804488	1804499	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017146	TTTTTA	2	12	1836341	1836352	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017146	GAGCCC	2	12	1845720	1845731	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017146	CGGTTC	2	12	1851230	1851241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017146	TATGGA	2	12	1918361	1918372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017146	CGATCC	2	12	1920805	1920816	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017146	GATGCC	2	12	1920854	1920865	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017146	TGAAGA	2	12	1923534	1923545	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017146	AGCTAT	2	12	1932659	1932670	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017146	GTTTTT	2	12	1985118	1985129	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017146	ATCACG	2	12	2019163	2019174	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017146	TATTTT	2	12	2029129	2029140	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017146	TGATCA	2	12	2033246	2033257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017146	CTACGC	2	12	2097297	2097308	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017146	AACCCT	2	12	2226336	2226347	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017146	AATATA	2	12	2256286	2256297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017146	CTCGCC	2	12	2286094	2286105	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017146	TGCGGT	2	12	2311845	2311856	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017146	GAAAAA	2	12	2352536	2352547	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017146	ATCCTT	2	12	2413028	2413039	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017146	TCGTTA	2	12	2417865	2417876	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017146	AAAATA	2	12	2428711	2428722	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017146	AATTGG	2	12	2480838	2480849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017146	GCGCCA	2	12	2504416	2504427	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017146	CAGAAA	2	12	2540817	2540828	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017146	AGCTTC	2	12	2589108	2589119	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017146	ACGTCA	2	12	2608005	2608016	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017146	CTCGCC	2	12	2610523	2610534	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017146	ACCTGC	2	12	2645678	2645689	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017146	CCGGAT	2	12	2677449	2677460	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017146	TCGCTG	2	12	2700878	2700889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017146	GCTTGC	2	12	2701024	2701035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017146	CTCGCC	2	12	2765568	2765579	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017146	TCTTAC	2	12	2786467	2786478	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017146	ATTTTA	2	12	2788581	2788592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017146	CTTTTT	2	12	2805571	2805582	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017146	GCTTCT	2	12	2843612	2843623	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017146	TCCTTT	2	12	2868408	2868419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.