MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-26

Total Repeats: 274

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017146	GCTTG	2	10	169	178	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017146	GTACG	2	10	937	946	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017146	AATAA	2	10	2603	2612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017146	TTTGA	2	10	59031	59040	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017146	CTGAA	2	10	67913	67922	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017146	CAAGG	2	10	71136	71145	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017146	AAGGT	2	10	79292	79301	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017146	TTTTC	2	10	83188	83197	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017146	GCTCT	2	10	84520	84529	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017146	AGGGA	2	10	84576	84585	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017146	CAGAA	2	10	87578	87587	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017146	GCGTT	2	10	89967	89976	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017146	AGGGC	2	10	96648	96657	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017146	AAAAC	2	10	112799	112808	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017146	AACAG	2	10	120933	120942	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017146	GCATA	2	10	126079	126088	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017146	CAGGA	2	10	136034	136043	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017146	CCTAT	2	10	140554	140563	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017146	TAGAT	2	10	150647	150656	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017146	ATTTT	2	10	150715	150724	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017146	CAAAA	2	10	157372	157381	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017146	TAAAG	2	10	163736	163745	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017146	TAGAG	2	10	163998	164007	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017146	GTAAA	2	10	181423	181432	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017146	TTCCA	2	10	205975	205984	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017146	GAATG	2	10	223657	223666	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017146	AAAAG	2	10	230260	230269	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017146	ACCGC	2	10	280863	280872	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017146	CTGTC	2	10	291036	291045	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017146	ATCCT	2	10	300749	300758	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017146	CTTTA	2	10	303636	303645	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017146	ATAGT	2	10	345646	345655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017146	TATAT	2	10	345705	345714	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017146	GGGCA	2	10	348105	348114	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017146	ACGGC	2	10	349097	349106	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017146	AAAGG	2	10	350886	350895	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017146	TTGCG	2	10	352880	352889	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017146	TCAAC	2	10	354742	354751	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017146	TCTAC	2	10	354752	354761	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017146	TTTCT	2	10	358157	358166	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017146	CTTTA	2	10	363580	363589	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017146	CACCC	2	10	368165	368174	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
43	NC_017146	ATTAA	2	10	368180	368189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017146	AACAC	2	10	379215	379224	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017146	ATGGC	2	10	391759	391768	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017146	AAACA	2	10	413282	413291	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017146	TGAAC	2	10	413490	413499	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017146	GGGGC	2	10	419584	419593	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017146	GGGCA	2	10	424163	424172	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017146	AGGGT	2	10	433021	433030	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017146	ACAGA	2	10	458354	458363	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017146	AACAG	2	10	465430	465439	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017146	GGGGT	2	10	473915	473924	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017146	AACAA	2	10	477225	477234	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017146	GCCAC	2	10	487189	487198	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_017146	CGGAA	2	10	491295	491304	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017146	GCCGG	2	10	501956	501965	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017146	GGGTG	2	10	503237	503246	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017146	TTGCG	2	10	505184	505193	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017146	GGGGA	2	10	533460	533469	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017146	GGCGT	2	10	535003	535012	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017146	GAAAA	2	10	565219	565228	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017146	AGAAA	2	10	583122	583131	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017146	AAAGA	2	10	606446	606455	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017146	GTCTG	2	10	616563	616572	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017146	TGCGG	2	10	618021	618030	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017146	CATGT	2	10	636254	636263	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017146	GGCAG	2	10	637375	637384	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017146	GTGGC	2	10	643177	643186	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017146	TGTGG	2	10	645085	645094	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017146	TTTGT	2	10	650000	650009	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017146	TTTTC	2	10	655999	656008	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017146	CAGGG	2	10	662784	662793	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017146	GGAAG	2	10	680883	680892	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017146	GTTAC	2	10	699800	699809	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017146	CGTTT	2	10	725046	725055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017146	ACGTA	2	10	732335	732344	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017146	GGGAA	2	10	771681	771690	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017146	GCTGT	2	10	771881	771890	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017146	TTTCT	2	10	785432	785441	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017146	CGAGA	2	10	799654	799663	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017146	GGTGT	2	10	821561	821570	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017146	CTTGC	2	10	851506	851515	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017146	TTTCT	2	10	855113	855122	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017146	GGGTG	2	10	866430	866439	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017146	CAAGC	2	10	867601	867610	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017146	AATTT	2	10	867974	867983	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017146	AAAGG	2	10	868288	868297	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017146	TTTTC	2	10	875879	875888	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017146	AGATA	2	10	888808	888817	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017146	CTGAA	2	10	889171	889180	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017146	AAGGA	2	10	912519	912528	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017146	AGCTA	2	10	937318	937327	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017146	TCTCA	2	10	950830	950839	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017146	GCACA	2	10	1051336	1051345	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017146	GTTGT	2	10	1068945	1068954	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017146	TGCAC	2	10	1093813	1093822	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017146	AAAAG	2	10	1097085	1097094	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017146	GTGAA	2	10	1109236	1109245	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017146	GAAAA	2	10	1156099	1156108	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017146	AAAAT	2	10	1178002	1178011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017146	TCTGT	2	10	1178057	1178066	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017146	TAAAA	2	10	1178157	1178166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017146	TTCCT	2	10	1187078	1187087	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017146	GCAAG	2	10	1239038	1239047	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017146	TCCTG	2	10	1244034	1244043	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017146	TCTTT	2	10	1249574	1249583	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017146	GTTTT	2	10	1254631	1254640	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017146	TCTTT	2	10	1258732	1258741	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017146	CACAA	2	10	1307309	1307318	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017146	CTGCC	2	10	1335101	1335110	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_017146	ACGAT	2	10	1348779	1348788	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017146	CCTTG	2	10	1367810	1367819	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017146	AACGA	2	10	1369840	1369849	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017146	CACAA	2	10	1391649	1391658	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017146	AACAG	2	10	1404877	1404886	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017146	TAATA	2	10	1405516	1405525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017146	ACGCA	2	10	1420586	1420595	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017146	AAGGA	2	10	1463407	1463416	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017146	TAAAA	2	10	1463428	1463437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017146	AGGAA	2	10	1474620	1474629	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017146	AAAAC	2	10	1475839	1475848	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017146	AAAAT	2	10	1478913	1478922	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017146	GCTAG	2	10	1489394	1489403	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017146	AATAA	2	10	1518210	1518219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017146	ATTTC	2	10	1520039	1520048	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017146	TTTCT	2	10	1524156	1524165	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017146	TTTCT	2	10	1528477	1528486	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017146	TGGTG	2	10	1532354	1532363	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017146	TGTTC	2	10	1532367	1532376	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017146	GGGAT	2	10	1537613	1537622	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017146	GCCCA	2	10	1541625	1541634	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_017146	CACGA	2	10	1541692	1541701	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_017146	CCCAT	2	10	1543022	1543031	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
135	NC_017146	CCTTT	2	10	1548828	1548837	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_017146	TATTT	2	10	1563851	1563860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017146	CACAA	2	10	1567430	1567439	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017146	ATAGC	2	10	1567556	1567565	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017146	TTATT	2	10	1586438	1586447	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017146	TTAAA	2	10	1597885	1597894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017146	ATTAA	2	10	1597897	1597906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017146	TAAAT	2	10	1605598	1605607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017146	TACGC	2	10	1618749	1618758	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017146	TATAT	2	10	1631246	1631255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017146	AAATT	2	10	1664630	1664639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017146	ATTTT	2	10	1674771	1674780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017146	TAAAT	2	10	1674845	1674854	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017146	TATTT	2	10	1674966	1674975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017146	TAAAA	2	10	1675201	1675210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017146	CGATA	2	10	1681245	1681254	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017146	ATAAA	2	10	1681255	1681264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017146	ATTTT	2	10	1684272	1684281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017146	ATTTT	2	10	1688847	1688856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017146	CTTAC	2	10	1718429	1718438	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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158	NC_017146	CCCAT	2	10	1736105	1736114	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
159	NC_017146	AGAAA	2	10	1755023	1755032	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017146	GAAAA	2	10	1785264	1785273	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017146	CCCCG	2	10	1788468	1788477	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
162	NC_017146	TGCCT	2	10	1830981	1830990	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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165	NC_017146	CTTTT	2	10	1889548	1889557	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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168	NC_017146	TCGGA	2	10	1914074	1914083	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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174	NC_017146	ACGGT	2	10	1924560	1924569	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_017146	TAACG	2	10	1930462	1930471	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_017146	ACGAC	2	10	1964373	1964382	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_017146	CACTA	2	10	1966283	1966292	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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183	NC_017146	ATATA	2	10	1972220	1972229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017146	CAACA	2	10	1983011	1983020	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
185	NC_017146	GCCCT	2	10	1996271	1996280	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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189	NC_017146	CCCTG	2	10	2019312	2019321	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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192	NC_017146	ACATA	2	10	2029047	2029056	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
193	NC_017146	CGGCG	2	10	2034712	2034721	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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197	NC_017146	CCTTT	2	10	2050790	2050799	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
198	NC_017146	CCGCT	2	10	2056421	2056430	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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222	NC_017146	ATGAA	2	10	2349456	2349465	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_017146	TACAA	2	10	2839078	2839087	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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272	NC_017146	CATTA	2	10	2858341	2858350	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_017146	AAAAG	2	10	2866912	2866921	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017146	GCAAA	2	10	2893599	2893608	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.