MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p3

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017141	CAA	2	6	63	68	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017141	TCC	2	6	166	171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017141	CCT	2	6	182	187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017141	AAT	2	6	200	205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017141	TAG	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017141	ATG	2	6	496	501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017141	TAA	2	6	526	531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017141	TTA	2	6	548	553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017141	TAA	2	6	587	592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017141	AGA	2	6	742	747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017141	TCC	2	6	818	823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017141	ACT	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017141	CAG	2	6	852	857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017141	TTA	2	6	1005	1010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044092
15	NC_017141	CTT	2	6	1015	1020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044092
16	NC_017141	ATT	2	6	1049	1054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017141	TAA	2	6	1116	1121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017141	AAG	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044093
19	NC_017141	AAG	2	6	1272	1277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044093
20	NC_017141	AGG	2	6	1315	1320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384044093
21	NC_017141	CTG	2	6	1416	1421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044093
22	NC_017141	AAG	2	6	1494	1499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044094
23	NC_017141	ACA	2	6	1770	1775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017141	ATT	2	6	1791	1796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017141	ACA	2	6	1843	1848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017141	TAA	2	6	1900	1905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017141	AGT	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044095
28	NC_017141	CAG	2	6	2077	2082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044095
29	NC_017141	AGC	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044095
30	NC_017141	CAT	2	6	2130	2135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044095
31	NC_017141	ACA	2	6	2142	2147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044095
32	NC_017141	CAT	2	6	2260	2265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044096
33	NC_017141	ATC	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044096
34	NC_017141	TCA	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044096
35	NC_017141	ATA	2	6	2717	2722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044097
36	NC_017141	CCT	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017141	TTA	2	6	2960	2965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044098
38	NC_017141	TTC	2	6	2980	2985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044098
39	NC_017141	CAT	2	6	3009	3014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044098
40	NC_017141	AAT	2	6	3095	3100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044098
41	NC_017141	CTG	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044098
42	NC_017141	ACA	2	6	3114	3119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044098
43	NC_017141	CTC	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044098
44	NC_017141	AAT	2	6	3228	3233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044098
45	NC_017141	CAT	2	6	3298	3303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017141	CAG	2	6	3358	3363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044099
47	NC_017141	AAT	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044099
48	NC_017141	CTG	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044099
49	NC_017141	CTT	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044099
50	NC_017141	CAA	2	6	3574	3579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044099
51	NC_017141	TTA	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044099
52	NC_017141	TAA	2	6	3595	3600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044099
53	NC_017141	TCA	2	6	3603	3608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044099
54	NC_017141	CTC	2	6	3656	3661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044099
55	NC_017141	AAT	2	6	3697	3702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044099
56	NC_017141	ATC	3	9	3793	3801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044100
57	NC_017141	ATC	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044100
58	NC_017141	CTT	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044100
59	NC_017141	TTG	2	6	4212	4217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384044100
60	NC_017141	TCT	2	6	4266	4271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044100
61	NC_017141	TAA	2	6	4278	4283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044100
62	NC_017141	TAA	2	6	4425	4430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044100
63	NC_017141	CTC	2	6	4495	4500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044100
64	NC_017141	CTC	2	6	4582	4587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044100
65	NC_017141	ATC	2	6	4642	4647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044100
66	NC_017141	CTT	2	6	4709	4714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044101
67	NC_017141	TCA	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044101
68	NC_017141	TCC	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017141	CTT	2	6	5060	5065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044102
70	NC_017141	ACT	2	6	5290	5295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017141	TCT	2	6	5329	5334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044104
72	NC_017141	TGT	2	6	5553	5558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384044104
73	NC_017141	TCA	2	6	5601	5606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044104
74	NC_017141	CTT	2	6	5656	5661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044104
75	NC_017141	CAT	3	9	5674	5682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044104
76	NC_017141	TAT	2	6	5693	5698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044104
77	NC_017141	GAT	2	6	5761	5766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044104
78	NC_017141	TCT	2	6	5786	5791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044104
79	NC_017141	TGA	2	6	5799	5804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044104
80	NC_017141	ACC	2	6	5869	5874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044104
81	NC_017141	CAC	2	6	5879	5884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044104
82	NC_017141	AAT	2	6	5899	5904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017141	ACC	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044105
84	NC_017141	CTC	2	6	6536	6541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044105
85	NC_017141	CTT	2	6	6644	6649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044105
86	NC_017141	CAT	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044105
87	NC_017141	CCT	2	6	6979	6984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.