MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p2

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017140	TAA	2	6	17	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017140	TTC	2	6	88	93	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017140	AAG	2	6	115	120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044080
4	NC_017140	TAC	2	6	196	201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044080
5	NC_017140	GAA	2	6	316	321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044080
6	NC_017140	AAG	2	6	368	373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044080
7	NC_017140	TTC	2	6	418	423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044080
8	NC_017140	ATA	2	6	449	454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017140	TAT	2	6	530	535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017140	TAG	2	6	585	590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017140	ATA	3	9	635	643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017140	TAT	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017140	TAA	4	12	762	773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017140	TAA	2	6	798	803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017140	TAC	2	6	813	818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017140	CTA	2	6	884	889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017140	TCA	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017140	GGA	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017140	ATA	2	6	1242	1247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017140	TAT	2	6	1436	1441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017140	GAA	2	6	1525	1530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
22	NC_017140	TTA	2	6	1607	1612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044081
23	NC_017140	TCA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044081
24	NC_017140	GAA	2	6	1786	1791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
25	NC_017140	AAT	2	6	1792	1797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044081
26	NC_017140	CAA	2	6	1879	1884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044081
27	NC_017140	GCT	2	6	1927	1932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044081
28	NC_017140	AGA	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
29	NC_017140	GAA	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
30	NC_017140	ATG	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044081
31	NC_017140	TTC	2	6	2070	2075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044081
32	NC_017140	ACA	2	6	2082	2087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044081
33	NC_017140	AGC	2	6	2109	2114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044081
34	NC_017140	ACA	2	6	2118	2123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044081
35	NC_017140	GAA	3	9	2128	2136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044081
36	NC_017140	ATT	2	6	2160	2165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044081
37	NC_017140	TGA	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017140	GGC	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017140	TAA	2	6	2373	2378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017140	TAA	2	6	2421	2426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017140	ATG	2	6	2521	2526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017140	AAT	2	6	2547	2552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044082
43	NC_017140	TTA	2	6	2625	2630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044082
44	NC_017140	TCT	2	6	2815	2820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044082
45	NC_017140	CAA	2	6	2830	2835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044082
46	NC_017140	TAA	2	6	2873	2878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044082
47	NC_017140	TTC	2	6	2883	2888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044082
48	NC_017140	TCC	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044083
49	NC_017140	GAA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017140	AAG	2	6	3341	3346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044084
51	NC_017140	ATC	2	6	3350	3355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044084
52	NC_017140	TCA	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044084
53	NC_017140	ATT	2	6	3689	3694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044084
54	NC_017140	TCA	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044084
55	NC_017140	TTC	2	6	3744	3749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017140	GCT	3	9	3766	3774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044085
57	NC_017140	CAT	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044085
58	NC_017140	CTT	3	9	3865	3873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044085
59	NC_017140	GTC	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044085
60	NC_017140	TGT	2	6	3972	3977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384044085
61	NC_017140	TTC	2	6	3978	3983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044085
62	NC_017140	TCT	2	6	4005	4010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044085
63	NC_017140	GAA	2	6	4018	4023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044085
64	NC_017140	CTT	2	6	4040	4045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044085
65	NC_017140	ATG	3	9	4328	4336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017140	TCA	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017140	TCA	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017140	AGG	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017140	GCT	2	6	4494	4499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044086
70	NC_017140	GTG	2	6	4507	4512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384044086
71	NC_017140	ATG	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044086
72	NC_017140	CAA	2	6	4722	4727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044086
73	NC_017140	TGG	2	6	4777	4782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384044086
74	NC_017140	CAT	2	6	4829	4834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044086
75	NC_017140	TTC	2	6	5059	5064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044086
76	NC_017140	GAA	2	6	5102	5107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
77	NC_017140	CCG	2	6	5186	5191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044086
78	NC_017140	AAG	2	6	5299	5304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
79	NC_017140	GAA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
80	NC_017140	CAA	3	9	5394	5402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044086
81	NC_017140	ATA	2	6	5524	5529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044086
82	NC_017140	TGA	2	6	5530	5535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044086
83	NC_017140	CGT	2	6	5538	5543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044086
84	NC_017140	AGC	2	6	5592	5597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044086
85	NC_017140	GAA	3	9	5634	5642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
86	NC_017140	TCA	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044086
87	NC_017140	ACA	2	6	5711	5716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044086
88	NC_017140	AGA	2	6	5750	5755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
89	NC_017140	GAA	2	6	6108	6113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
90	NC_017140	GAT	2	6	6174	6179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044086
91	NC_017140	CAA	2	6	6300	6305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044086
92	NC_017140	GAA	2	6	6318	6323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044086
93	NC_017140	CAA	2	6	6330	6335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044086
94	NC_017140	GGT	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017140	ATT	2	6	6527	6532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017140	TTA	2	6	6540	6545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044087
97	NC_017140	CTA	2	6	6596	6601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044087
98	NC_017140	ATA	2	6	6618	6623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044087
99	NC_017140	CAA	3	9	6698	6706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044087
100	NC_017140	ATT	2	6	6741	6746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044087
101	NC_017140	AAG	2	6	6768	6773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044087
102	NC_017140	TAA	2	6	6786	6791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044087
103	NC_017140	TAT	2	6	6795	6800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044087
104	NC_017140	TCC	2	6	6855	6860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044087
105	NC_017140	TCT	2	6	6958	6963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044087
106	NC_017140	GGT	2	6	6976	6981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384044087
107	NC_017140	TTG	2	6	7086	7091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384044087
108	NC_017140	ATA	2	6	7109	7114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044087
109	NC_017140	AAT	2	6	7142	7147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044087
110	NC_017140	CCT	2	6	7194	7199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044088
111	NC_017140	CTC	2	6	7271	7276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384044088
112	NC_017140	AAC	2	6	7499	7504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044088
113	NC_017140	CTA	2	6	7715	7720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044089
114	NC_017140	TAT	2	6	7904	7909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044089
115	NC_017140	ACT	2	6	7933	7938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044089
116	NC_017140	TAA	2	6	7962	7967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044089
117	NC_017140	TAC	2	6	7977	7982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044089
118	NC_017140	AAT	2	6	8048	8053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044089
119	NC_017140	TAA	2	6	8112	8117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044089
120	NC_017140	TCA	2	6	8140	8145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044089
121	NC_017140	ATC	2	6	8151	8156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044089
122	NC_017140	ACT	2	6	8370	8375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017140	TAT	2	6	8498	8503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017140	TAT	2	6	8584	8589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044090
125	NC_017140	AAT	2	6	8602	8607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044090
126	NC_017140	GTT	2	6	8613	8618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384044090
127	NC_017140	TGA	2	6	8686	8691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044090
128	NC_017140	TAA	2	6	8709	8714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044090
129	NC_017140	AAT	2	6	8758	8763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044090
130	NC_017140	CTT	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044090
131	NC_017140	TAA	2	6	8833	8838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044090
132	NC_017140	ATA	2	6	8862	8867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044090
133	NC_017140	TTC	2	6	9016	9021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044090
134	NC_017140	AAT	2	6	9058	9063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044090
135	NC_017140	CAA	2	6	9136	9141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044090
136	NC_017140	GAA	2	6	9153	9158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044090
137	NC_017140	CTG	2	6	9303	9308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044090
138	NC_017140	ATG	2	6	9357	9362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044090
139	NC_017140	AAC	2	6	9426	9431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044090
140	NC_017140	AAT	2	6	9436	9441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044090
141	NC_017140	TAA	3	9	9475	9483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044090
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144	NC_017140	ATT	2	6	9661	9666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044090

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.