MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p1

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017139	TTTGCA	2	12	1623	1634	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017139	TGTTTT	2	12	8943	8954	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384044115
3	NC_017139	TTTTTC	2	12	13434	13445	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017139	ATCAGT	2	12	14927	14938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384044125
5	NC_017139	GAGTAA	2	12	18287	18298	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384044127
6	NC_017139	AATGCA	2	12	19379	19390	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384044128
7	NC_017139	AACGGT	2	12	21358	21369	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384044128
8	NC_017139	ATTACA	2	12	24371	24382	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384044128
9	NC_017139	AGCTAT	2	12	24827	24838	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384044128
10	NC_017139	AGCTAT	2	12	25376	25387	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384044128
11	NC_017139	AGCTAT	2	12	25925	25936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384044128
12	NC_017139	AGCTAT	2	12	26474	26485	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384044128
13	NC_017139	CAATTA	2	12	26565	26576	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384044128
14	NC_017139	CTAATT	2	12	27039	27050	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384044128
15	NC_017139	AAATTC	2	12	33033	33044	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384044132
16	NC_017139	GTTGCT	2	12	33448	33459	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384044133
17	NC_017139	GCAGGA	2	12	33884	33895	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384044134
18	NC_017139	CAAAAG	2	12	35378	35389	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384044136
19	NC_017139	ATGCCT	2	12	39029	39040	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384044140
20	NC_017139	CATATA	2	12	40740	40751	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384044141
21	NC_017139	AAATGT	2	12	45625	45636	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384044148
22	NC_017139	TACTAT	2	12	46390	46401	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017139	CCATAT	2	12	47997	48008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044151
24	NC_017139	AGTTGT	2	12	48485	48496	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384044152
25	NC_017139	AGTCAT	2	12	49019	49030	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384044153
26	NC_017139	TCATTG	2	12	49913	49924	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384044154
27	NC_017139	TGATAT	2	12	51570	51581	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384044155
28	NC_017139	TGGAGA	2	12	55534	55545	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384044159
29	NC_017139	AGAATA	2	12	58294	58305	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017139	TATTCT	2	12	58344	58355	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017139	TTTAGT	2	12	59809	59820	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384044164
32	NC_017139	CCTAGC	2	12	62404	62415	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384044166
33	NC_017139	TCATTT	2	12	66142	66153	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017139	TATAAA	2	12	66731	66742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044174
35	NC_017139	ATTTTT	2	12	69676	69687	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.