MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p1

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017139	TTAAT	2	10	2232	2241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017139	GAAAT	2	10	3031	3040	60 %	20 %	20 %	0 %	384044107
3	NC_017139	AATAT	2	10	4712	4721	60 %	40 %	0 %	0 %	384044110
4	NC_017139	AACAT	2	10	5087	5096	60 %	20 %	0 %	20 %	384044111
5	NC_017139	ACAAT	2	10	5570	5579	60 %	20 %	0 %	20 %	384044111
6	NC_017139	CAATT	2	10	5968	5977	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017139	CCTTT	2	10	10912	10921	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017139	CCTCT	2	10	12094	12103	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017139	TGTTT	2	10	13114	13123	0 %	80 %	20 %	0 %	384044124
10	NC_017139	AAAAT	2	10	14244	14253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017139	TAAAA	2	10	14267	14276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017139	ATTTT	2	10	14324	14333	20 %	80 %	0 %	0 %	384044125
13	NC_017139	GCAAG	2	10	15404	15413	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017139	ACTTT	2	10	15455	15464	20 %	60 %	0 %	20 %	384044126
15	NC_017139	TACTT	2	10	16231	16240	20 %	60 %	0 %	20 %	384044126
16	NC_017139	TTTTA	2	10	17380	17389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017139	TTTAT	2	10	17695	17704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017139	AGTGC	2	10	19088	19097	20 %	20 %	40 %	20 %	384044128
19	NC_017139	AACCA	2	10	19814	19823	60 %	0 %	0 %	40 %	384044128
20	NC_017139	AACGG	2	10	20480	20489	40 %	0 %	40 %	20 %	384044128
21	NC_017139	CAAAT	2	10	23355	23364	60 %	20 %	0 %	20 %	384044128
22	NC_017139	AAACG	2	10	28450	28459	60 %	0 %	20 %	20 %	384044128
23	NC_017139	TCTTG	2	10	31932	31941	0 %	60 %	20 %	20 %	384044130
24	NC_017139	CTTTT	2	10	32164	32173	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017139	TTTAA	2	10	32200	32209	40 %	60 %	0 %	0 %	384044131
26	NC_017139	ATTGT	2	10	35979	35988	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017139	ATTAT	2	10	36286	36295	40 %	60 %	0 %	0 %	384044137
28	NC_017139	GTTTT	2	10	39473	39482	0 %	80 %	20 %	0 %	384044140
29	NC_017139	CTTTT	2	10	40384	40393	0 %	80 %	0 %	20 %	384044141
30	NC_017139	ACGAA	2	10	40480	40489	60 %	0 %	20 %	20 %	384044141
31	NC_017139	GAATA	2	10	42319	42328	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017139	TAAAA	2	10	43175	43184	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017139	AACTC	2	10	44062	44071	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017139	GAAGA	2	10	44473	44482	60 %	0 %	40 %	0 %	384044146
35	NC_017139	ATTAT	2	10	44572	44581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017139	AAGGA	2	10	47640	47649	60 %	0 %	40 %	0 %	384044150
37	NC_017139	AGTTT	2	10	50135	50144	20 %	60 %	20 %	0 %	384044154
38	NC_017139	TATTT	2	10	50815	50824	20 %	80 %	0 %	0 %	384044155
39	NC_017139	CTCAT	2	10	52723	52732	20 %	40 %	0 %	40 %	384044157
40	NC_017139	TTTTC	2	10	53182	53191	0 %	80 %	0 %	20 %	384044157
41	NC_017139	GATAT	2	10	55356	55365	40 %	40 %	20 %	0 %	384044159
42	NC_017139	TTTTG	2	10	55654	55663	0 %	80 %	20 %	0 %	384044159
43	NC_017139	TTTAG	2	10	57181	57190	20 %	60 %	20 %	0 %	384044161
44	NC_017139	CTTTT	2	10	59545	59554	0 %	80 %	0 %	20 %	384044164
45	NC_017139	TTGAT	2	10	60154	60163	20 %	60 %	20 %	0 %	384044164
46	NC_017139	CTTTT	2	10	61106	61115	0 %	80 %	0 %	20 %	384044165
47	NC_017139	TGAAC	2	10	61849	61858	40 %	20 %	20 %	20 %	384044166
48	NC_017139	CAGTC	2	10	62096	62105	20 %	20 %	20 %	40 %	384044166
49	NC_017139	TATAA	2	10	62984	62993	60 %	40 %	0 %	0 %	384044167
50	NC_017139	TATAA	2	10	63382	63391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017139	ATTTA	2	10	66094	66103	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017139	CTATA	2	10	67224	67233	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017139	GAAAT	2	10	67367	67376	60 %	20 %	20 %	0 %	384044175
54	NC_017139	AGAAA	2	10	68818	68827	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017139	ATAGA	2	10	69265	69274	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017139	TAAAA	2	10	69478	69487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017139	TCGTG	2	10	70790	70799	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.