MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p1

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017139	TTAAT	2	10	2232	2241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017139	CAATT	2	10	5968	5977	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017139	CCTTT	2	10	10912	10921	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017139	CCTCT	2	10	12094	12103	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_017139	AAAAT	2	10	14244	14253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017139	TAAAA	2	10	14267	14276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017139	GCAAG	2	10	15404	15413	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017139	TTTTA	2	10	17380	17389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017139	TTTAT	2	10	17695	17704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017139	CTTTT	2	10	32164	32173	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017139	ATTGT	2	10	35979	35988	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017139	GAATA	2	10	42319	42328	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017139	TAAAA	2	10	43175	43184	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017139	AACTC	2	10	44062	44071	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017139	ATTAT	2	10	44572	44581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017139	TATAA	2	10	63382	63391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017139	ATTTA	2	10	66094	66103	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017139	CTATA	2	10	67224	67233	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017139	AGAAA	2	10	68818	68827	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017139	ATAGA	2	10	69265	69274	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017139	TAAAA	2	10	69478	69487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017139	TCGTG	2	10	70790	70799	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.