MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p1

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017139	GCCT	2	8	1085	1092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017139	TGCC	2	8	1274	1281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017139	TAAA	2	8	1655	1662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017139	TTAG	2	8	1729	1736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017139	AACA	2	8	1882	1889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017139	TAAA	2	8	2004	2011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017139	TCGT	2	8	2410	2417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017139	TAAG	2	8	2419	2426	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017139	CATT	2	8	2711	2718	25 %	50 %	0 %	25 %	384044107
10	NC_017139	GAAA	2	8	2777	2784	75 %	0 %	25 %	0 %	384044107
11	NC_017139	GAAG	2	8	3059	3066	50 %	0 %	50 %	0 %	384044107
12	NC_017139	AAAT	2	8	3171	3178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017139	AAGC	2	8	3656	3663	50 %	0 %	25 %	25 %	384044109
14	NC_017139	CTAC	2	8	4023	4030	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017139	GATT	2	8	4206	4213	25 %	50 %	25 %	0 %	384044110
16	NC_017139	TTAA	2	8	5823	5830	50 %	50 %	0 %	0 %	384044111
17	NC_017139	AAAT	2	8	6179	6186	75 %	25 %	0 %	0 %	384044112
18	NC_017139	AACT	2	8	6217	6224	50 %	25 %	0 %	25 %	384044112
19	NC_017139	TATT	2	8	6436	6443	25 %	75 %	0 %	0 %	384044112
20	NC_017139	AATT	2	8	6563	6570	50 %	50 %	0 %	0 %	384044112
21	NC_017139	GAAT	2	8	6773	6780	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017139	AATA	2	8	6842	6849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017139	TAAC	2	8	7043	7050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017139	TAAA	3	12	7111	7122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017139	TCAT	2	8	7422	7429	25 %	50 %	0 %	25 %	384044113
26	NC_017139	TATT	2	8	7443	7450	25 %	75 %	0 %	0 %	384044113
27	NC_017139	TGGA	2	8	7722	7729	25 %	25 %	50 %	0 %	384044114
28	NC_017139	ATTC	2	8	8205	8212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017139	ATTA	2	8	8230	8237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017139	TTCT	2	8	8270	8277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017139	CAAT	2	8	8658	8665	50 %	25 %	0 %	25 %	384044115
32	NC_017139	GGGT	2	8	8846	8853	0 %	25 %	75 %	0 %	384044115
33	NC_017139	ATAA	2	8	9165	9172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017139	TATT	2	8	9188	9195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017139	TAAT	2	8	9204	9211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017139	ATTA	2	8	9230	9237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017139	AAAG	2	8	11127	11134	75 %	0 %	25 %	0 %	384044122
38	NC_017139	ATTA	2	8	11266	11273	50 %	50 %	0 %	0 %	384044122
39	NC_017139	AACT	2	8	11307	11314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017139	ATTT	2	8	11420	11427	25 %	75 %	0 %	0 %	384044123
41	NC_017139	TTTC	2	8	11653	11660	0 %	75 %	0 %	25 %	384044123
42	NC_017139	CAAT	2	8	11733	11740	50 %	25 %	0 %	25 %	384044123
43	NC_017139	ATCA	2	8	12297	12304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017139	TATT	2	8	12606	12613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017139	TTGA	2	8	13000	13007	25 %	50 %	25 %	0 %	384044124
46	NC_017139	ATTA	2	8	13400	13407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017139	TAGA	2	8	13528	13535	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017139	TTTA	2	8	14543	14550	25 %	75 %	0 %	0 %	384044125
49	NC_017139	AAAT	2	8	14593	14600	75 %	25 %	0 %	0 %	384044125
50	NC_017139	TTTC	2	8	15944	15951	0 %	75 %	0 %	25 %	384044126
51	NC_017139	GATT	2	8	16064	16071	25 %	50 %	25 %	0 %	384044126
52	NC_017139	TTTG	2	8	16553	16560	0 %	75 %	25 %	0 %	384044126
53	NC_017139	TAAG	2	8	16582	16589	50 %	25 %	25 %	0 %	384044126
54	NC_017139	ATTT	2	8	17716	17723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017139	ATCA	2	8	17899	17906	50 %	25 %	0 %	25 %	384044127
56	NC_017139	ATCG	2	8	18081	18088	25 %	25 %	25 %	25 %	384044127
57	NC_017139	TAAA	2	8	18343	18350	75 %	25 %	0 %	0 %	384044127
58	NC_017139	TTAT	2	8	18729	18736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017139	ATTT	2	8	18860	18867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017139	AAGC	2	8	18962	18969	50 %	0 %	25 %	25 %	384044128
61	NC_017139	CAGG	2	8	19322	19329	25 %	0 %	50 %	25 %	384044128
62	NC_017139	CAGT	2	8	19536	19543	25 %	25 %	25 %	25 %	384044128
63	NC_017139	AAGT	2	8	19974	19981	50 %	25 %	25 %	0 %	384044128
64	NC_017139	ACTT	2	8	20658	20665	25 %	50 %	0 %	25 %	384044128
65	NC_017139	TGGA	2	8	20922	20929	25 %	25 %	50 %	0 %	384044128
66	NC_017139	AATC	2	8	21169	21176	50 %	25 %	0 %	25 %	384044128
67	NC_017139	TGGA	2	8	21468	21475	25 %	25 %	50 %	0 %	384044128
68	NC_017139	AATC	2	8	21715	21722	50 %	25 %	0 %	25 %	384044128
69	NC_017139	TGGA	2	8	22014	22021	25 %	25 %	50 %	0 %	384044128
70	NC_017139	AATC	2	8	22261	22268	50 %	25 %	0 %	25 %	384044128
71	NC_017139	TGGA	2	8	22560	22567	25 %	25 %	50 %	0 %	384044128
72	NC_017139	AATC	2	8	22807	22814	50 %	25 %	0 %	25 %	384044128
73	NC_017139	TGGA	2	8	23106	23113	25 %	25 %	50 %	0 %	384044128
74	NC_017139	AGAT	2	8	23593	23600	50 %	25 %	25 %	0 %	384044128
75	NC_017139	CATT	2	8	23730	23737	25 %	50 %	0 %	25 %	384044128
76	NC_017139	AATC	2	8	26912	26919	50 %	25 %	0 %	25 %	384044128
77	NC_017139	ATTT	2	8	27063	27070	25 %	75 %	0 %	0 %	384044128
78	NC_017139	AACC	2	8	27413	27420	50 %	0 %	0 %	50 %	384044128
79	NC_017139	ATTC	2	8	27609	27616	25 %	50 %	0 %	25 %	384044128
80	NC_017139	AAGT	2	8	28020	28027	50 %	25 %	25 %	0 %	384044128
81	NC_017139	GTTT	2	8	28663	28670	0 %	75 %	25 %	0 %	384044128
82	NC_017139	TCCA	2	8	28897	28904	25 %	25 %	0 %	50 %	384044128
83	NC_017139	GTCA	2	8	29280	29287	25 %	25 %	25 %	25 %	384044128
84	NC_017139	GCAA	2	8	29591	29598	50 %	0 %	25 %	25 %	384044128
85	NC_017139	TGGT	2	8	29652	29659	0 %	50 %	50 %	0 %	384044128
86	NC_017139	ACTT	2	8	30121	30128	25 %	50 %	0 %	25 %	384044128
87	NC_017139	ACCT	2	8	30321	30328	25 %	25 %	0 %	50 %	384044128
88	NC_017139	TTTA	2	8	30395	30402	25 %	75 %	0 %	0 %	384044128
89	NC_017139	TAGT	2	8	30450	30457	25 %	50 %	25 %	0 %	384044128
90	NC_017139	AAAG	2	8	30806	30813	75 %	0 %	25 %	0 %	384044129
91	NC_017139	GTTA	2	8	31498	31505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017139	CTTT	2	8	32069	32076	0 %	75 %	0 %	25 %	384044130
93	NC_017139	ACGT	2	8	32455	32462	25 %	25 %	25 %	25 %	384044131
94	NC_017139	TTAT	2	8	33014	33021	25 %	75 %	0 %	0 %	384044132
95	NC_017139	ATTA	2	8	33120	33127	50 %	50 %	0 %	0 %	384044132
96	NC_017139	AGAA	2	8	33551	33558	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017139	CTAT	2	8	33573	33580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017139	ATAA	2	8	33800	33807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017139	ACTA	2	8	34116	34123	50 %	25 %	0 %	25 %	384044134
100	NC_017139	TAAT	2	8	34306	34313	50 %	50 %	0 %	0 %	384044135
101	NC_017139	ATGG	2	8	34617	34624	25 %	25 %	50 %	0 %	384044135
102	NC_017139	AATT	2	8	35652	35659	50 %	50 %	0 %	0 %	384044136
103	NC_017139	AACT	2	8	35810	35817	50 %	25 %	0 %	25 %	384044136
104	NC_017139	CAAC	2	8	36055	36062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017139	TACA	2	8	36097	36104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017139	ATTT	2	8	36975	36982	25 %	75 %	0 %	0 %	384044138
107	NC_017139	GTTT	2	8	37754	37761	0 %	75 %	25 %	0 %	384044139
108	NC_017139	CAAT	2	8	37920	37927	50 %	25 %	0 %	25 %	384044139
109	NC_017139	GAAA	2	8	38032	38039	75 %	0 %	25 %	0 %	384044139
110	NC_017139	TTAA	2	8	38061	38068	50 %	50 %	0 %	0 %	384044139
111	NC_017139	CATA	2	8	38644	38651	50 %	25 %	0 %	25 %	384044139
112	NC_017139	ATTG	2	8	39216	39223	25 %	50 %	25 %	0 %	384044140
113	NC_017139	TTTC	2	8	39331	39338	0 %	75 %	0 %	25 %	384044140
114	NC_017139	CTAT	2	8	39416	39423	25 %	50 %	0 %	25 %	384044140
115	NC_017139	TTAA	2	8	39629	39636	50 %	50 %	0 %	0 %	384044140
116	NC_017139	ATTG	2	8	40123	40130	25 %	50 %	25 %	0 %	384044141
117	NC_017139	TTTA	2	8	40153	40160	25 %	75 %	0 %	0 %	384044141
118	NC_017139	CCAC	2	8	40946	40953	25 %	0 %	0 %	75 %	384044141
119	NC_017139	TAAT	2	8	41390	41397	50 %	50 %	0 %	0 %	384044142
120	NC_017139	TTTC	2	8	41534	41541	0 %	75 %	0 %	25 %	384044142
121	NC_017139	TAAT	2	8	41903	41910	50 %	50 %	0 %	0 %	384044142
122	NC_017139	ATTT	2	8	42305	42312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017139	GAAA	2	8	42408	42415	75 %	0 %	25 %	0 %	384044144
124	NC_017139	TTAT	2	8	42620	42627	25 %	75 %	0 %	0 %	384044144
125	NC_017139	AGGG	2	8	43277	43284	25 %	0 %	75 %	0 %	384044145
126	NC_017139	TGGG	2	8	43640	43647	0 %	25 %	75 %	0 %	384044145
127	NC_017139	GCTG	2	8	43890	43897	0 %	25 %	50 %	25 %	384044145
128	NC_017139	ATCC	2	8	43936	43943	25 %	25 %	0 %	50 %	384044145
129	NC_017139	ATTT	2	8	44145	44152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017139	TTTA	2	8	44221	44228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017139	ACAA	2	8	44541	44548	75 %	0 %	0 %	25 %	384044146
132	NC_017139	ATTG	2	8	44657	44664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017139	ATAC	2	8	44681	44688	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017139	GTTA	2	8	44703	44710	25 %	50 %	25 %	0 %	384044147
135	NC_017139	CTTT	2	8	44926	44933	0 %	75 %	0 %	25 %	384044147
136	NC_017139	AATT	2	8	44954	44961	50 %	50 %	0 %	0 %	384044147
137	NC_017139	CAAA	2	8	45133	45140	75 %	0 %	0 %	25 %	384044147
138	NC_017139	TTAA	2	8	45267	45274	50 %	50 %	0 %	0 %	384044147
139	NC_017139	GAAA	2	8	45302	45309	75 %	0 %	25 %	0 %	384044148
140	NC_017139	TAAC	2	8	45729	45736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017139	AAGG	2	8	45754	45761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017139	CGTG	2	8	45840	45847	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017139	TAAA	2	8	45854	45861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017139	TAAA	2	8	45909	45916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017139	CATA	2	8	46524	46531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017139	ACTT	2	8	46817	46824	25 %	50 %	0 %	25 %	384044150
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207	NC_017139	AGAA	2	8	67248	67255	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.