MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p1

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017139	GCCT	2	8	1085	1092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017139	TGCC	2	8	1274	1281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017139	TAAA	2	8	1655	1662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017139	TTAG	2	8	1729	1736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017139	AACA	2	8	1882	1889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017139	TAAA	2	8	2004	2011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017139	TCGT	2	8	2410	2417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017139	TAAG	2	8	2419	2426	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017139	AAAT	2	8	3171	3178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017139	CTAC	2	8	4023	4030	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017139	GAAT	2	8	6773	6780	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017139	AATA	2	8	6842	6849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017139	TAAC	2	8	7043	7050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017139	TAAA	3	12	7111	7122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017139	ATTC	2	8	8205	8212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017139	ATTA	2	8	8230	8237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017139	TTCT	2	8	8270	8277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017139	ATAA	2	8	9165	9172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017139	TATT	2	8	9188	9195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017139	TAAT	2	8	9204	9211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017139	ATTA	2	8	9230	9237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017139	AACT	2	8	11307	11314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017139	ATCA	2	8	12297	12304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017139	TATT	2	8	12606	12613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017139	ATTA	2	8	13400	13407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017139	TAGA	2	8	13528	13535	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017139	ATTT	2	8	17716	17723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017139	TTAT	2	8	18729	18736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017139	ATTT	2	8	18860	18867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017139	GTTA	2	8	31498	31505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017139	AGAA	2	8	33551	33558	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017139	CTAT	2	8	33573	33580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017139	ATAA	2	8	33800	33807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017139	CAAC	2	8	36055	36062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017139	TACA	2	8	36097	36104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017139	ATTT	2	8	42305	42312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017139	ATTT	2	8	44145	44152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017139	TTTA	2	8	44221	44228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017139	ATTG	2	8	44657	44664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017139	ATAC	2	8	44681	44688	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017139	TAAC	2	8	45729	45736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017139	AAGG	2	8	45754	45761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017139	CGTG	2	8	45840	45847	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017139	TAAA	2	8	45854	45861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017139	TAAA	2	8	45909	45916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017139	CATA	2	8	46524	46531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017139	CTAT	2	8	52339	52346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017139	GTTT	2	8	52439	52446	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017139	TGTA	2	8	52468	52475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017139	TTCA	2	8	53535	53542	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017139	AGAA	2	8	53632	53639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017139	GTAG	2	8	56017	56024	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017139	ACTT	2	8	57859	57866	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017139	TTAT	2	8	61385	61392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017139	TTAT	2	8	61430	61437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017139	GTTA	2	8	62549	62556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017139	TAAA	2	8	63446	63453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017139	TTTA	2	8	64813	64820	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017139	AGAA	2	8	64944	64951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017139	TTAT	2	8	65141	65148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017139	ATGA	2	8	65170	65177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017139	TATT	2	8	65240	65247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017139	TAAA	2	8	65264	65271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017139	AGTA	2	8	66997	67004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017139	TCCT	2	8	67061	67068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017139	AGAA	2	8	67248	67255	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017139	TTCT	2	8	67282	67289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017139	TTGA	2	8	67321	67328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017139	TTGT	2	8	68796	68803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017139	AATA	2	8	68804	68811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017139	TGAA	2	8	68923	68930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017139	TTAA	2	8	69355	69362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017139	GCTT	2	8	69789	69796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017139	CCTG	2	8	69838	69845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017139	GTGA	2	8	70121	70128	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017139	ATGG	2	8	70958	70965	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017139	ACGT	2	8	71281	71288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017139	AATA	2	8	71447	71454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017139	CACG	2	8	72271	72278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017139	TAGG	2	8	73643	73650	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017139	CTGA	2	8	74391	74398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017139	ATCG	2	8	74404	74411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.