MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p1

Total Repeats: 260

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017139	TAT	2	6	53	58	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017139	TTA	2	6	77	82	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017139	GGA	2	6	104	109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017139	CGG	2	6	151	156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017139	TCC	2	6	170	175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017139	CGG	2	6	293	298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017139	CCA	2	6	346	351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017139	AGT	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017139	ACC	2	6	652	657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017139	GGC	2	6	713	718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017139	GCC	2	6	777	782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017139	GTG	2	6	805	810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017139	TAA	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017139	CTC	2	6	956	961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017139	AGG	2	6	1100	1105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017139	CCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017139	GGA	2	6	1146	1151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017139	TCC	2	6	1229	1234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017139	GTG	2	6	1256	1261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017139	TCA	2	6	1396	1401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017139	GGT	2	6	1472	1477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017139	CAT	2	6	1495	1500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017139	CGG	2	6	1576	1581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017139	TCA	2	6	1608	1613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017139	AGG	2	6	1666	1671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017139	AGG	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017139	TTC	2	6	1768	1773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017139	CAG	2	6	1779	1784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017139	GCT	2	6	1787	1792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017139	GAT	2	6	1873	1878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017139	TGA	2	6	1892	1897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017139	CCA	2	6	1972	1977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017139	TAA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017139	TAA	2	6	2174	2179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017139	AAT	2	6	2192	2197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017139	TCT	2	6	2219	2224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017139	ATA	2	6	2249	2254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017139	TAA	2	6	2331	2336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017139	AGA	2	6	2491	2496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017139	ATT	2	6	3179	3184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017139	TTC	2	6	3214	3219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017139	AAT	2	6	3512	3517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017139	TCT	2	6	4042	4047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017139	GAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017139	CTT	2	6	4977	4982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017139	ATA	2	6	5000	5005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017139	AGT	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017139	TAG	2	6	5990	5995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017139	AAG	2	6	6689	6694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017139	TCG	2	6	6765	6770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017139	ATA	2	6	6795	6800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017139	TAA	2	6	7074	7079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017139	TAA	2	6	7126	7131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017139	TTA	2	6	7193	7198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017139	GTG	2	6	7612	7617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017139	TTA	2	6	8182	8187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017139	GAG	2	6	9245	9250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017139	AGG	2	6	9520	9525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017139	ATT	2	6	12137	12142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017139	AAT	2	6	12203	12208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017139	TGA	2	6	12314	12319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017139	AAG	2	6	12395	12400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017139	AAT	2	6	12559	12564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017139	TCT	2	6	12570	12575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017139	AGC	2	6	12634	12639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017139	CTG	2	6	12667	12672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017139	ATT	2	6	13367	13372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017139	TTC	2	6	13463	13468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017139	AAC	2	6	13656	13661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017139	ATA	2	6	13809	13814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017139	TCT	2	6	13834	13839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017139	TTA	2	6	13844	13849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017139	CTT	2	6	13866	13871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017139	ATT	2	6	13896	13901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017139	CTT	2	6	14014	14019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017139	AAT	2	6	14036	14041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017139	GAT	2	6	14060	14065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017139	TGT	2	6	14079	14084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017139	GCC	2	6	14102	14107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017139	GTT	2	6	14136	14141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017139	TAT	3	9	15298	15306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017139	TCC	2	6	16832	16837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017139	TTA	2	6	16990	16995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017139	ACA	2	6	17357	17362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017139	TAG	2	6	17371	17376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017139	TAA	2	6	17403	17408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017139	GTG	2	6	17607	17612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017139	ATA	2	6	18723	18728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017139	GTT	2	6	18760	18765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017139	TTG	2	6	30540	30545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017139	TAA	2	6	30614	30619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017139	CTT	2	6	31292	31297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017139	ATG	2	6	31318	31323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017139	TGT	2	6	31391	31396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017139	TAA	2	6	31443	31448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017139	GTA	2	6	31464	31469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017139	TAC	2	6	31528	31533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017139	CAA	2	6	31563	31568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017139	TTA	2	6	31582	31587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017139	CCT	2	6	32100	32105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017139	TAT	2	6	32117	32122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017139	AGG	2	6	32139	32144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017139	ATT	2	6	32919	32924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017139	TAT	2	6	33596	33601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017139	GAA	2	6	33649	33654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017139	AGA	2	6	33697	33702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017139	ATA	2	6	33703	33708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017139	GTT	2	6	33723	33728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017139	AAG	2	6	33765	33770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017139	AGA	2	6	33791	33796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017139	AAT	2	6	33811	33816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017139	AAG	2	6	33818	33823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017139	GGA	2	6	33824	33829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017139	CCT	2	6	34758	34763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017139	AAG	2	6	34815	34820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017139	AGA	2	6	34827	34832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017139	AGT	2	6	34863	34868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017139	GAA	2	6	34911	34916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017139	TCT	2	6	34961	34966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017139	GTT	2	6	35028	35033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017139	CAT	2	6	35150	35155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017139	CCA	2	6	35205	35210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017139	TTA	2	6	35214	35219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017139	ACT	3	9	36026	36034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017139	AAT	2	6	36105	36110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017139	GTT	2	6	36122	36127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017139	AAT	2	6	36148	36153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017139	TAT	2	6	36175	36180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017139	TAA	2	6	36760	36765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017139	TTA	2	6	36806	36811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017139	AGT	2	6	36825	36830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017139	ATT	2	6	36906	36911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017139	AGC	2	6	37576	37581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017139	CTT	2	6	41930	41935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017139	TAG	2	6	41950	41955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017139	AGG	2	6	42340	42345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017139	CAA	2	6	43131	43136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017139	ATT	2	6	43155	43160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017139	TTG	2	6	44096	44101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017139	TAT	2	6	44153	44158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017139	CAA	2	6	44260	44265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017139	TGT	2	6	44314	44319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017139	TGT	2	6	44609	44614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017139	ATT	2	6	45765	45770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.