MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 chromosome

Total Repeats: 308

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017138	TCCCCT	2	12	68041	68052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017138	GGCCTT	2	12	88515	88526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017138	ATAAGA	2	12	117408	117419	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017138	AAGGTG	2	12	135668	135679	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017138	ATTGAC	2	12	155580	155591	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017138	AAATAA	2	12	161161	161172	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017138	ACTTTC	2	12	260555	260566	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017138	AATAAA	2	12	261912	261923	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017138	TATGAA	2	12	261963	261974	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017138	TAATGA	2	12	264249	264260	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017138	AATAAA	2	12	268915	268926	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017138	TTGTAT	2	12	305502	305513	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017138	CAAAAA	2	12	305529	305540	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017138	TTTTGT	2	12	308711	308722	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017138	AAAAGA	2	12	313664	313675	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017138	GAAAAA	2	12	319412	319423	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017138	AAATAA	2	12	322721	322732	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017138	TAAAAG	2	12	338678	338689	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017138	TAAAAA	2	12	352804	352815	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017138	AAGTAG	2	12	352816	352827	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017138	ATTTTT	2	12	356407	356418	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017138	TCATAT	2	12	362430	362441	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017138	TTTAAA	2	12	363117	363128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017138	ATTGGA	2	12	365618	365629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017138	CGAGTG	2	12	418018	418029	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017138	TCCTTA	2	12	421052	421063	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017138	AAGTAG	2	12	492063	492074	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017138	TTCCTT	2	12	511225	511236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017138	TGTTTT	2	12	599532	599543	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017138	TGGAGA	2	12	618808	618819	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017138	AGGTGA	2	12	625372	625383	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017138	GATGTA	2	12	675227	675238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017138	AGAAGT	2	12	685604	685615	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017138	AGTCAA	2	12	702612	702623	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017138	AATATG	2	12	720775	720786	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017138	TGTAAG	2	12	746619	746630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017138	AGAAAA	2	12	755612	755623	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017138	TACATA	2	12	758654	758665	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017138	AATCAA	2	12	771477	771488	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017138	ACGGTA	2	12	772029	772040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017138	AGTAGA	2	12	783618	783629	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017138	TATTTT	2	12	805400	805411	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017138	GTAATG	2	12	825013	825024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017138	TTCTGG	2	12	825175	825186	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017138	TGCGTG	2	12	825288	825299	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017138	GTTTGT	2	12	844111	844122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017138	ATTAAA	2	12	876250	876261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017138	ATTCTC	2	12	922240	922251	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017138	GCTTTG	2	12	927474	927485	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017138	TTTTAT	2	12	932041	932052	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017138	TTCTTT	2	12	938815	938826	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017138	AAGTAA	2	12	941035	941046	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017138	GAAATG	2	12	970312	970323	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017138	TTTAAA	2	12	1047311	1047322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017138	GAAAAT	2	12	1054151	1054162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017138	ACCGTT	2	12	1078321	1078332	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017138	AAAATA	2	12	1093642	1093653	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017138	ACAGTA	2	12	1105607	1105618	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017138	GTCTTC	2	12	1122348	1122359	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017138	GAAAAA	2	12	1128356	1128367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017138	AAAAAG	2	12	1134733	1134744	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017138	GCATAA	2	12	1139556	1139567	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017138	ATGGTG	2	12	1180494	1180505	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017138	AAGAAA	2	12	1183989	1184000	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017138	ATCATT	2	12	1189502	1189513	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017138	CGAACA	2	12	1191116	1191127	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017138	GCATGA	2	12	1194991	1195002	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017138	AAATCG	2	12	1198890	1198901	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017138	ATTCCC	2	12	1219957	1219968	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017138	GAAACA	2	12	1220244	1220255	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017138	ACTTTA	2	12	1264333	1264344	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017138	ATCAAA	2	12	1279400	1279411	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017138	AATAGT	2	12	1303708	1303719	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017138	TTATGA	2	12	1311944	1311955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017138	ATTATG	2	12	1322557	1322568	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017138	ACCCGA	2	12	1346378	1346389	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017138	AAAACC	2	12	1349181	1349192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017138	AGGGAA	2	12	1371147	1371158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017138	TGAAGA	2	12	1371664	1371675	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017138	ATAGAA	2	12	1411590	1411601	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017138	AATGTA	2	12	1447625	1447636	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017138	AACAGC	2	12	1447761	1447772	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017138	GAAAAA	2	12	1448527	1448538	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017138	CTGGTT	2	12	1474537	1474548	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017138	TTATAT	2	12	1491066	1491077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017138	AAGCAA	2	12	1507216	1507227	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017138	ATATTA	2	12	1518643	1518654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017138	TAGTAA	2	12	1521869	1521880	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017138	AAAATT	2	12	1532689	1532700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017138	TACTTC	2	12	1553042	1553053	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017138	GCTTAT	2	12	1567398	1567409	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017138	AATAGA	2	12	1585568	1585579	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017138	AACTTT	2	12	1589660	1589671	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017138	CATGAT	2	12	1589812	1589823	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017138	TATAAG	2	12	1596102	1596113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017138	AAAAGA	2	12	1598907	1598918	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017138	TTTACA	2	12	1607345	1607356	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017138	AAAAGA	2	12	1611223	1611234	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017138	CGATGG	2	12	1611705	1611716	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017138	AATTGA	2	12	1612312	1612323	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017138	TATGAT	2	12	1664912	1664923	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017138	TTTATA	2	12	1693694	1693705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017138	TGAGAA	2	12	1693804	1693815	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017138	ATGCCA	2	12	1694200	1694211	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017138	TTGTAT	2	12	1698538	1698549	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017138	AAAGAG	2	12	1698594	1698605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017138	AAAATA	3	18	1700277	1700294	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017138	AAAAAT	2	12	1704564	1704575	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017138	AAGGAA	2	12	1707798	1707809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017138	TTAGGT	2	12	1742379	1742390	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017138	GTATAT	2	12	1786750	1786761	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017138	AAGCAA	2	12	1817426	1817437	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017138	GAATTT	2	12	1818109	1818120	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017138	GTCTAT	2	12	1825587	1825598	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017138	CAAAAA	2	12	1841208	1841219	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017138	TTTTCA	2	12	1841276	1841287	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017138	TGATAA	2	12	1888651	1888662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017138	ATCAAT	2	12	1890778	1890789	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017138	AAAAGA	2	12	1953753	1953764	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017138	ATATTC	2	12	1961515	1961526	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017138	ACAGTG	2	12	1990498	1990509	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017138	ACGAAA	2	12	2001235	2001246	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017138	CTTTTA	2	12	2001764	2001775	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017138	CAAAAA	2	12	2026830	2026841	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017138	TTTACA	2	12	2088611	2088622	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017138	AAGTGG	2	12	2095503	2095514	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017138	CATATG	2	12	2095607	2095618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017138	TAGCAG	2	12	2099823	2099834	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.