MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 chromosome

Total Repeats: 1640

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017138	GCAGGA	2	12	6442	6453	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384044183
2	NC_017138	AAAAGA	2	12	7095	7106	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384044184
3	NC_017138	CTCCTG	2	12	9930	9941	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384044187
4	NC_017138	GTTTTT	2	12	10785	10796	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384044188
5	NC_017138	GAATGG	2	12	12493	12504	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384044190
6	NC_017138	AAAAGG	2	12	18326	18337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044197
7	NC_017138	GGTAAC	2	12	19065	19076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384044198
8	NC_017138	GAAGTT	2	12	25226	25237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044202
9	NC_017138	CAAACG	2	12	30567	30578	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384044208
10	NC_017138	TCTTTT	2	12	37111	37122	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384044212
11	NC_017138	CCGCAA	2	12	38781	38792	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384044214
12	NC_017138	ATTAAA	2	12	41966	41977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044216
13	NC_017138	GTAATG	2	12	42131	42142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044216
14	NC_017138	ATGCTC	2	12	44672	44683	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384044218
15	NC_017138	TAAAAT	2	12	47450	47461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044221
16	NC_017138	ATTGCC	2	12	51149	51160	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384044224
17	NC_017138	GATCAC	2	12	51374	51385	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384044224
18	NC_017138	TTAATT	2	12	52218	52229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044225
19	NC_017138	AATTTT	2	12	52945	52956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044226
20	NC_017138	AAAACC	2	12	56563	56574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044228
21	NC_017138	AAAGTA	2	12	62433	62444	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384044233
22	NC_017138	TTTCCT	2	12	64029	64040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044234
23	NC_017138	GAACAT	2	12	66943	66954	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384044237
24	NC_017138	TACGCC	2	12	70608	70619	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384044240
25	NC_017138	CAGAAG	2	12	74310	74321	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384044244
26	NC_017138	TCTTTA	2	12	76029	76040	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384044245
27	NC_017138	TACTTT	2	12	76325	76336	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384044245
28	NC_017138	AAAGGA	2	12	78469	78480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044247
29	NC_017138	TCAGCT	2	12	80436	80447	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384044251
30	NC_017138	TGTATT	2	12	82486	82497	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384044253
31	NC_017138	ATCAAT	2	12	83198	83209	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384044254
32	NC_017138	CATTTG	2	12	84698	84709	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384044258
33	NC_017138	CTTTGT	2	12	85252	85263	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384044259
34	NC_017138	GATTTA	2	12	94534	94545	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384044268
35	NC_017138	ACCTTC	2	12	96590	96601	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384044270
36	NC_017138	CAAAAG	2	12	99360	99371	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384044271
37	NC_017138	GAAGGA	2	12	103422	103433	50 %	0 %	50 %	0 %	384044275
38	NC_017138	GAAACA	2	12	105959	105970	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384044277
39	NC_017138	GAAAAA	2	12	108664	108675	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384044278
40	NC_017138	AGACTT	2	12	109202	109213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384044279
41	NC_017138	CGTCAT	2	12	110370	110381	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384044279
42	NC_017138	GTAAAG	2	12	110963	110974	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384044280
43	NC_017138	ATAAAT	2	12	111045	111056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044280
44	NC_017138	GAGCAG	2	12	114968	114979	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384044284
45	NC_017138	TACAAC	2	12	126154	126165	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384044294
46	NC_017138	TGAAGA	2	12	126655	126666	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384044294
47	NC_017138	TTGAAA	2	12	127107	127118	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384044295
48	NC_017138	GAAAAA	2	12	128950	128961	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384044297
49	NC_017138	GTACTC	2	12	132038	132049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384044300
50	NC_017138	TAGAAG	2	12	136849	136860	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384044306
51	NC_017138	TCCAGC	2	12	137573	137584	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384044306
52	NC_017138	ATGAAC	2	12	151332	151343	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384044322
53	NC_017138	ATGAAC	2	12	152352	152363	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384044322
54	NC_017138	TTTTTA	2	12	158821	158832	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384044327
55	NC_017138	AGCTTC	2	12	159175	159186	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384044327
56	NC_017138	TTCAGC	2	12	159277	159288	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384044327
57	NC_017138	TTCAGC	2	12	159349	159360	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384044327
58	NC_017138	ATCTGC	2	12	159382	159393	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384044327
59	NC_017138	TTTCTT	2	12	159438	159449	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384044327
60	NC_017138	CGCATG	2	12	163213	163224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384044330
61	NC_017138	GGATGC	2	12	166449	166460	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384044333
62	NC_017138	AAAAAG	2	12	168109	168120	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384044335
63	NC_017138	TTAAAC	2	12	177467	177478	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384044346
64	NC_017138	GTCAGC	2	12	178687	178698	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384044347
65	NC_017138	AAAATT	2	12	182530	182541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044349
66	NC_017138	CAATTA	2	12	182954	182965	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384044349
67	NC_017138	GAAGAT	2	12	192813	192824	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384044359
68	NC_017138	AAAAAC	2	12	192965	192976	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384044359
69	NC_017138	TTTGTA	2	12	194641	194652	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384044361
70	NC_017138	CGTGCT	2	12	198700	198711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044366
71	NC_017138	AAAATA	2	12	200422	200433	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384044367
72	NC_017138	GTAGAA	2	12	205478	205489	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384044371
73	NC_017138	ATTGAT	2	12	210085	210096	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384044373
74	NC_017138	AGCAAA	2	12	211855	211866	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384044375
75	NC_017138	ATTTTA	2	12	212826	212837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044377
76	NC_017138	TTAGCT	2	12	217471	217482	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384044380
77	NC_017138	AACAAG	2	12	223591	223602	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384044388
78	NC_017138	TTATTT	2	12	223712	223723	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384044388
79	NC_017138	TATGTA	2	12	224424	224435	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384044388
80	NC_017138	TTGATT	2	12	243509	243520	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384044407
81	NC_017138	AAAAGA	2	12	244535	244546	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384044407
82	NC_017138	AAAAAG	2	12	244579	244590	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384044407
83	NC_017138	GTTTTT	2	12	250066	250077	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384044412
84	NC_017138	AAAGCA	2	12	259816	259827	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384044421
85	NC_017138	GATTTT	2	12	262554	262565	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384044423
86	NC_017138	GTAAAA	2	12	272306	272317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384044432
87	NC_017138	AAAAGA	2	12	273055	273066	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384044432
88	NC_017138	GTACTG	2	12	273395	273406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384044432
89	NC_017138	ATTTTA	2	12	276383	276394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384044436
90	NC_017138	AAGGTG	2	12	278512	278523	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384044439
91	NC_017138	AAAGAA	2	12	281756	281767	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384044443
92	NC_017138	CTGGTT	2	12	284987	284998	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384044445
93	NC_017138	TTGGAG	2	12	285335	285346	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384044445
94	NC_017138	AATTGA	2	12	287820	287831	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384044449
95	NC_017138	TGAAGA	2	12	293496	293507	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384044456
96	NC_017138	TTCAAT	2	12	295680	295691	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384044458
97	NC_017138	AGATAC	2	12	296394	296405	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384044459
98	NC_017138	AAGGTG	2	12	296876	296887	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384044459
99	NC_017138	AAAGTA	2	12	299418	299429	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384044462
100	NC_017138	CTTGTA	2	12	300287	300298	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384044463
101	NC_017138	CAATGA	2	12	301358	301369	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384044464
102	NC_017138	TCGTGC	2	12	303342	303353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044466
103	NC_017138	ATTTTC	2	12	304605	304616	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384044467
104	NC_017138	CTGCAG	2	12	311550	311561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384044476
105	NC_017138	AAAAGG	2	12	313140	313151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044477
106	NC_017138	CCCCGC	2	12	318626	318637	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	384044486
107	NC_017138	ATTTTT	2	12	321071	321082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384044488
108	NC_017138	GCTATG	2	12	321780	321791	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384044489
109	NC_017138	GACATT	2	12	325183	325194	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384044492
110	NC_017138	GAATGA	2	12	325385	325396	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384044492
111	NC_017138	ATCAAA	2	12	328527	328538	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384044497
112	NC_017138	GTCAAG	2	12	334603	334614	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384044505
113	NC_017138	AATGAG	2	12	337003	337014	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384044509
114	NC_017138	TGATAC	2	12	340092	340103	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384044510
115	NC_017138	TATTGG	2	12	343106	343117	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384044512
116	NC_017138	AGACGC	2	12	344643	344654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044513
117	NC_017138	ATCTTT	2	12	345589	345600	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384044515
118	NC_017138	GGAGTA	2	12	348441	348452	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384044518
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228	NC_017138	GTAAAC	2	12	697491	697502	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384044847
229	NC_017138	AGCTTC	2	12	698092	698103	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384044848
230	NC_017138	CTGCCT	2	12	698403	698414	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384044848
231	NC_017138	AACTGA	2	12	700221	700232	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384044850
232	NC_017138	AAAAGG	2	12	703720	703731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044852
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343	NC_017138	ATTGCC	2	12	961430	961441	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384045122
344	NC_017138	GAGATC	2	12	963961	963972	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384045123
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346	NC_017138	GATATT	2	12	969236	969247	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384045128
347	NC_017138	GCTGAT	2	12	969677	969688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384045129
348	NC_017138	ATCAGC	2	12	971456	971467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384045130
349	NC_017138	GAAAAA	2	12	971853	971864	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384045130
350	NC_017138	AGGTGC	2	12	972158	972169	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384045131
351	NC_017138	GATATT	2	12	976408	976419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384045135
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353	NC_017138	TGCAAT	2	12	978105	978116	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384045137
354	NC_017138	AAGATC	2	12	983391	983402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384045142
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360	NC_017138	CCGCTA	2	12	1001283	1001294	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384045158
361	NC_017138	TGTTAT	2	12	1003053	1003064	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384045160
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431	NC_017138	TGGACT	2	12	1204899	1204910	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384045346
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442	NC_017138	AGCTGG	2	12	1237956	1237967	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384045381
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447	NC_017138	CTTATT	2	12	1254097	1254108	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384045401
448	NC_017138	TGAACA	2	12	1254494	1254505	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384045402
449	NC_017138	CAAGAA	2	12	1256849	1256860	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384045404
450	NC_017138	TCATTG	2	12	1259213	1259224	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384045407
451	NC_017138	GTCTTT	2	12	1270934	1270945	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384045421
452	NC_017138	GCTGAA	2	12	1270983	1270994	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384045421
453	NC_017138	ATCGCA	2	12	1271049	1271060	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384045421
454	NC_017138	ATAAAA	2	12	1281293	1281304	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384045430
455	NC_017138	AATGGG	2	12	1282434	1282445	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384045431
456	NC_017138	ATCTGC	2	12	1285263	1285274	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384045436
457	NC_017138	GAAGCT	2	12	1288591	1288602	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384045438
458	NC_017138	TTAGGT	2	12	1291188	1291199	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384045441
459	NC_017138	GTAAAA	2	12	1302221	1302232	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384045454
460	NC_017138	CTATTT	2	12	1304022	1304033	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384045456
461	NC_017138	TGAAAA	2	12	1305441	1305452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384045458
462	NC_017138	AGAACT	2	12	1307245	1307256	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384045458
463	NC_017138	ACAAGC	2	12	1313138	1313149	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384045464
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465	NC_017138	ATCGCA	2	12	1315305	1315316	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384045466
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470	NC_017138	ATTAAA	2	12	1333798	1333809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384045482
471	NC_017138	TCTGCT	2	12	1333835	1333846	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384045482
472	NC_017138	GCTTGA	2	12	1334670	1334681	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384045483
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484	NC_017138	TTAGGC	2	12	1352166	1352177	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384045499
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489	NC_017138	GAGAAG	2	12	1358652	1358663	50 %	0 %	50 %	0 %	384045505
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499	NC_017138	GAAAGC	2	12	1396723	1396734	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384045543
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