MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-014

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017136	GGCGCG	2	12	1810	1821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384043894
2	NC_017136	GGCTGG	2	12	1834	1845	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384043894
3	NC_017136	GATAAT	2	12	7675	7686	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017136	ATTGTC	2	12	12564	12575	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384043902
5	NC_017136	CCTGTC	2	12	12584	12595	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384043902
6	NC_017136	TGGATG	2	12	14493	14504	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384043903
7	NC_017136	CATCCA	2	12	19467	19478	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384043907
8	NC_017136	GGAACT	2	12	21233	21244	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384043910
9	NC_017136	CATGCT	2	12	24243	24254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384043912
10	NC_017136	TAAGGG	2	12	27320	27331	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384043915
11	NC_017136	TGGATG	2	12	28734	28745	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384043917
12	NC_017136	AACAAG	2	12	29979	29990	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384043918
13	NC_017136	GTCAGG	2	12	30748	30759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017136	TCCTGA	2	12	39105	39116	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384043927
15	NC_017136	TGGATG	2	12	40700	40711	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384043929
16	NC_017136	TGGATG	2	12	42369	42380	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384043930
17	NC_017136	GTGCTT	2	12	45350	45361	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384043933
18	NC_017136	GGCATC	2	12	50280	50291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384043937
19	NC_017136	CGTCAG	2	12	52333	52344	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384043939
20	NC_017136	TTCGGC	2	12	52885	52896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017136	GGCGTG	2	12	61646	61657	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384043945
22	NC_017136	CATCCA	2	12	64460	64471	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384043947
23	NC_017136	ATTTTA	2	12	67751	67762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017136	CATTAT	2	12	69413	69424	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384043950
25	NC_017136	GAGGAC	2	12	73093	73104	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384043954
26	NC_017136	CATCCA	2	12	76028	76039	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384043956
27	NC_017136	AACCAG	2	12	77363	77374	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384043957
28	NC_017136	CATCCA	2	12	89418	89429	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384043966
29	NC_017136	TGGATG	2	12	93596	93607	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384043971
30	NC_017136	GAATAA	2	12	96086	96097	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384043974
31	NC_017136	TCTTAA	2	12	96339	96350	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384043974
32	NC_017136	TTTGCC	2	12	102622	102633	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384043979
33	NC_017136	GGCATC	2	12	108402	108413	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384043985
34	NC_017136	CAGCCG	2	12	109452	109463	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384043986
35	NC_017136	CTTCCT	2	12	113546	113557	0 %	50 %	0 %	50 %	384043991
36	NC_017136	AGCGGA	2	12	114282	114293	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384043993
37	NC_017136	GGGCCA	2	12	117302	117313	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384043994
38	NC_017136	TGCAGG	2	12	119855	119866	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384043996
39	NC_017136	CCAAAA	2	12	124524	124535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017136	CATCCA	2	12	130528	130539	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384044009
41	NC_017136	CCCCCT	2	12	131968	131979	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	384044011
42	NC_017136	CCAGAA	2	12	138830	138841	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384044020
43	NC_017136	GAGGAA	2	12	139875	139886	50 %	0 %	50 %	0 %	384044021
44	NC_017136	CATCCA	2	12	141630	141641	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384044022
45	NC_017136	TGGATG	2	12	145051	145062	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384044025
46	NC_017136	CCCACG	2	12	148831	148842	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384044026
47	NC_017136	GATGCC	2	12	151099	151110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384044030
48	NC_017136	CTTCCT	2	12	153506	153517	0 %	50 %	0 %	50 %	384044031
49	NC_017136	TGGATG	2	12	160505	160516	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384044044
50	NC_017136	GATGCC	2	12	163508	163519	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384044047
51	NC_017136	CATCCA	2	12	164899	164910	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384044048
52	NC_017136	GCCATC	2	12	171280	171291	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384044053
53	NC_017136	CCCAAA	2	12	174905	174916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017136	TGGATG	2	12	181113	181124	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384044063
55	NC_017136	TGGATG	2	12	182794	182805	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384044064
56	NC_017136	TCCAGC	2	12	185791	185802	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384044066
57	NC_017136	ATTCTG	2	12	186601	186612	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384044066
58	NC_017136	ATACCG	2	12	187915	187926	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384044067
59	NC_017136	TCAGTT	2	12	188082	188093	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384044067
60	NC_017136	TATCGC	2	12	189529	189540	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.