MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-014

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017136	GCTGG	2	10	272	281	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017136	GGAAA	2	10	1869	1878	60 %	0 %	40 %	0 %	384043894
3	NC_017136	GGCTC	2	10	2132	2141	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017136	TGCCA	2	10	3100	3109	20 %	20 %	20 %	40 %	384043895
5	NC_017136	CGATC	2	10	3215	3224	20 %	20 %	20 %	40 %	384043895
6	NC_017136	GAGCT	2	10	3806	3815	20 %	20 %	40 %	20 %	384043896
7	NC_017136	CTGTG	2	10	5534	5543	0 %	40 %	40 %	20 %	384043898
8	NC_017136	ATGTG	2	10	7497	7506	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017136	ATCCG	2	10	8722	8731	20 %	20 %	20 %	40 %	384043901
10	NC_017136	AAGCC	2	10	9063	9072	40 %	0 %	20 %	40 %	384043902
11	NC_017136	TACGC	2	10	11257	11266	20 %	20 %	20 %	40 %	384043902
12	NC_017136	GGACA	2	10	18664	18673	40 %	0 %	40 %	20 %	384043907
13	NC_017136	TTTCT	2	10	19997	20006	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017136	ACCAC	2	10	20504	20513	40 %	0 %	0 %	60 %	384043908
15	NC_017136	CCAGC	2	10	20973	20982	20 %	0 %	20 %	60 %	384043910
16	NC_017136	CTGGC	2	10	22804	22813	0 %	20 %	40 %	40 %	384043912
17	NC_017136	TGCAA	2	10	23370	23379	40 %	20 %	20 %	20 %	384043912
18	NC_017136	CTGGT	2	10	23661	23670	0 %	40 %	40 %	20 %	384043912
19	NC_017136	AGAAA	2	10	28206	28215	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017136	TGTCC	2	10	29539	29548	0 %	40 %	20 %	40 %	384043917
21	NC_017136	CACCT	2	10	32507	32516	20 %	20 %	0 %	60 %	384043920
22	NC_017136	GCTCC	2	10	34074	34083	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017136	GCAGG	2	10	36208	36217	20 %	0 %	60 %	20 %	384043923
24	NC_017136	GCTGT	2	10	37257	37266	0 %	40 %	40 %	20 %	384043924
25	NC_017136	CATGC	2	10	39442	39451	20 %	20 %	20 %	40 %	384043927
26	NC_017136	AGAAA	2	10	40172	40181	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017136	TGTCC	2	10	41505	41514	0 %	40 %	20 %	40 %	384043929
28	NC_017136	AGAAA	2	10	41841	41850	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017136	TGTCC	2	10	43174	43183	0 %	40 %	20 %	40 %	384043930
30	NC_017136	ATGGC	2	10	45876	45885	20 %	20 %	40 %	20 %	384043933
31	NC_017136	CCTGA	2	10	46410	46419	20 %	20 %	20 %	40 %	384043933
32	NC_017136	TTATT	2	10	50862	50871	20 %	80 %	0 %	0 %	384043938
33	NC_017136	CGTTC	2	10	51409	51418	0 %	40 %	20 %	40 %	384043939
34	NC_017136	CGGTC	2	10	53155	53164	0 %	20 %	40 %	40 %	384043940
35	NC_017136	GAAGC	2	10	56299	56308	40 %	0 %	40 %	20 %	384043941
36	NC_017136	TCAAG	2	10	57337	57346	40 %	20 %	20 %	20 %	384043942
37	NC_017136	CAGGA	2	10	58457	58466	40 %	0 %	40 %	20 %	384043943
38	NC_017136	CGGAC	2	10	59311	59320	20 %	0 %	40 %	40 %	384043943
39	NC_017136	CACAT	2	10	62746	62755	40 %	20 %	0 %	40 %	384043946
40	NC_017136	ACACA	2	10	65510	65519	60 %	0 %	0 %	40 %	384043948
41	NC_017136	TTACA	2	10	68908	68917	40 %	40 %	0 %	20 %	384043950
42	NC_017136	ACTGT	2	10	69013	69022	20 %	40 %	20 %	20 %	384043950
43	NC_017136	CAACG	2	10	70425	70434	40 %	0 %	20 %	40 %	384043951
44	NC_017136	CCGTC	2	10	71410	71419	0 %	20 %	20 %	60 %	384043952
45	NC_017136	AGCAG	2	10	73823	73832	40 %	0 %	40 %	20 %	384043954
46	NC_017136	GGACA	2	10	75225	75234	40 %	0 %	40 %	20 %	384043956
47	NC_017136	CACAC	2	10	77039	77048	40 %	0 %	0 %	60 %	384043957
48	NC_017136	ACGCC	2	10	81190	81199	20 %	0 %	20 %	60 %	384043959
49	NC_017136	CTTGC	2	10	81737	81746	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017136	CCGCG	2	10	82105	82114	0 %	0 %	40 %	60 %	384043960
51	NC_017136	GCACA	2	10	83000	83009	40 %	0 %	20 %	40 %	384043961
52	NC_017136	TTTCT	2	10	83687	83696	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017136	GCTGT	2	10	84526	84535	0 %	40 %	40 %	20 %	384043963
54	NC_017136	CCAGA	2	10	86628	86637	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017136	CCGAG	2	10	86941	86950	20 %	0 %	40 %	40 %	384043965
56	NC_017136	GGACA	2	10	88615	88624	40 %	0 %	40 %	20 %	384043966
57	NC_017136	TTTCT	2	10	89948	89957	0 %	80 %	0 %	20 %	384043967
58	NC_017136	TCACT	2	10	91070	91079	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017136	AATCA	2	10	91101	91110	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017136	CTGAG	2	10	91118	91127	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017136	TCCTC	2	10	92002	92011	0 %	40 %	0 %	60 %	384043969
62	NC_017136	TTTAC	2	10	92312	92321	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017136	TGTCC	2	10	94401	94410	0 %	40 %	20 %	40 %	384043971
64	NC_017136	ATGCA	2	10	97969	97978	40 %	20 %	20 %	20 %	384043975
65	NC_017136	TTATG	2	10	99868	99877	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017136	CCTGA	2	10	100396	100405	20 %	20 %	20 %	40 %	384043977
67	NC_017136	CATTG	2	10	100436	100445	20 %	40 %	20 %	20 %	384043977
68	NC_017136	CAAGG	2	10	101494	101503	40 %	0 %	40 %	20 %	384043977
69	NC_017136	CTGGG	2	10	101740	101749	0 %	20 %	60 %	20 %	384043977
70	NC_017136	AGGGG	2	10	101984	101993	20 %	0 %	80 %	0 %	384043977
71	NC_017136	GACAT	2	10	103734	103743	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017136	CTATT	2	10	105148	105157	20 %	60 %	0 %	20 %	384043981
73	NC_017136	GTATT	2	10	111032	111041	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017136	GTCAC	2	10	114516	114525	20 %	20 %	20 %	40 %	384043993
75	NC_017136	TTGGA	2	10	117868	117877	20 %	40 %	40 %	0 %	384043994
76	NC_017136	CGGTT	2	10	118976	118985	0 %	40 %	40 %	20 %	384043995
77	NC_017136	CGTCC	2	10	125723	125732	0 %	20 %	20 %	60 %	384044003
78	NC_017136	TTTCA	2	10	125964	125973	20 %	60 %	0 %	20 %	384044003
79	NC_017136	TTATT	2	10	128696	128705	20 %	80 %	0 %	0 %	384044007
80	NC_017136	GGACA	2	10	129725	129734	40 %	0 %	40 %	20 %	384044009
81	NC_017136	TTTCT	2	10	131058	131067	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017136	GCCCT	2	10	131716	131725	0 %	20 %	20 %	60 %	384044011
83	NC_017136	GCCAC	2	10	133318	133327	20 %	0 %	20 %	60 %	384044013
84	NC_017136	GCTGG	2	10	133827	133836	0 %	20 %	60 %	20 %	384044013
85	NC_017136	AGCGA	2	10	134262	134271	40 %	0 %	40 %	20 %	384044015
86	NC_017136	ATAGT	2	10	135467	135476	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017136	TCCGT	2	10	136915	136924	0 %	40 %	20 %	40 %	384044019
88	NC_017136	CTGCG	2	10	137643	137652	0 %	20 %	40 %	40 %	384044019
89	NC_017136	TCGCG	2	10	138178	138187	0 %	20 %	40 %	40 %	384044019
90	NC_017136	CGTCC	2	10	140325	140334	0 %	20 %	20 %	60 %	384044021
91	NC_017136	GGACA	2	10	140827	140836	40 %	0 %	40 %	20 %	384044022
92	NC_017136	TTTCT	2	10	142160	142169	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017136	CATGG	2	10	142944	142953	20 %	20 %	40 %	20 %	384044024
94	NC_017136	AATTA	2	10	143109	143118	60 %	40 %	0 %	0 %	384044024
95	NC_017136	CTTTT	2	10	144072	144081	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017136	ATGAC	2	10	144212	144221	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017136	AGAAA	2	10	144523	144532	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017136	TGTCC	2	10	145856	145865	0 %	40 %	20 %	40 %	384044025
99	NC_017136	TGATC	2	10	146205	146214	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017136	CAGAT	2	10	146409	146418	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017136	ACCGT	2	10	146958	146967	20 %	20 %	20 %	40 %	384044026
102	NC_017136	GATCA	2	10	147590	147599	40 %	20 %	20 %	20 %	384044026
103	NC_017136	TGGGG	2	10	149536	149545	0 %	20 %	80 %	0 %	384044028
104	NC_017136	GGCAC	2	10	151658	151667	20 %	0 %	40 %	40 %	384044030
105	NC_017136	AAACA	2	10	153812	153821	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017136	CTTCC	2	10	154415	154424	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_017136	CTGCC	2	10	155987	155996	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_017136	CCAAC	2	10	157556	157565	40 %	0 %	0 %	60 %	384044037
109	NC_017136	CTGCC	2	10	158673	158682	0 %	20 %	20 %	60 %	384044041
110	NC_017136	GCCAT	2	10	159025	159034	20 %	20 %	20 %	40 %	384044042
111	NC_017136	GCCAC	2	10	159847	159856	20 %	0 %	20 %	60 %	384044043
112	NC_017136	AGAAA	2	10	159977	159986	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017136	TGTCC	2	10	161310	161319	0 %	40 %	20 %	40 %	384044044
114	NC_017136	TCTAT	2	10	162174	162183	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017136	TGCCC	2	10	162859	162868	0 %	20 %	20 %	60 %	384044046
116	NC_017136	GGACA	2	10	164096	164105	40 %	0 %	40 %	20 %	384044048
117	NC_017136	TTTCT	2	10	165429	165438	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017136	CATCT	2	10	165589	165598	20 %	40 %	0 %	40 %	384044049
119	NC_017136	ATCGC	2	10	165848	165857	20 %	20 %	20 %	40 %	384044049
120	NC_017136	CCAAC	2	10	166048	166057	40 %	0 %	0 %	60 %	384044050
121	NC_017136	TCCGG	2	10	167287	167296	0 %	20 %	40 %	40 %	384044050
122	NC_017136	CTGCT	2	10	169075	169084	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017136	CCGGA	2	10	169191	169200	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017136	TCCGG	2	10	171776	171785	0 %	20 %	40 %	40 %	384044054
125	NC_017136	TCGCG	2	10	171836	171845	0 %	20 %	40 %	40 %	384044054
126	NC_017136	CCCGG	2	10	172043	172052	0 %	0 %	40 %	60 %	384044055
127	NC_017136	GTCCG	2	10	172647	172656	0 %	20 %	40 %	40 %	384044055
128	NC_017136	TGATC	2	10	173397	173406	20 %	40 %	20 %	20 %	384044056
129	NC_017136	ACACC	2	10	174970	174979	40 %	0 %	0 %	60 %	384044058
130	NC_017136	AGTAG	2	10	175603	175612	40 %	20 %	40 %	0 %	384044058
131	NC_017136	ATGCA	2	10	176384	176393	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017136	CGATG	2	10	177181	177190	20 %	20 %	40 %	20 %	384044059
133	NC_017136	GGAAA	2	10	178069	178078	60 %	0 %	40 %	0 %	384044060
134	NC_017136	AGAAA	2	10	180585	180594	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017136	TGTCC	2	10	181918	181927	0 %	40 %	20 %	40 %	384044063
136	NC_017136	AGAAA	2	10	182266	182275	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017136	TGTCC	2	10	183599	183608	0 %	40 %	20 %	40 %	384044064
138	NC_017136	GCCCA	2	10	184902	184911	20 %	0 %	20 %	60 %	384044066
139	NC_017136	TGCTC	2	10	185711	185720	0 %	40 %	20 %	40 %	384044066
140	NC_017136	CCGAG	2	10	186308	186317	20 %	0 %	40 %	40 %	384044066
141	NC_017136	CATGC	2	10	186855	186864	20 %	20 %	20 %	40 %	384044067
142	NC_017136	CCTGC	2	10	187435	187444	0 %	20 %	20 %	60 %	384044067
143	NC_017136	ACGAC	2	10	189995	190004	40 %	0 %	20 %	40 %	384044068
144	NC_017136	CCAGC	2	10	190345	190354	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_017136	GCCAC	2	10	191174	191183	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.