MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-014

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017136	CTTC	2	8	1004	1011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017136	ACGG	2	8	2378	2385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017136	GATC	3	12	2574	2585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017136	TCGT	2	8	4285	4292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017136	AGCC	2	8	4843	4850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017136	CGGT	2	8	8484	8491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017136	TTGC	2	8	13240	13247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017136	CGAT	2	8	13374	13381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017136	GACT	2	8	13488	13495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017136	ACAG	2	8	15390	15397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017136	TAAC	2	8	17996	18003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017136	TTTG	2	8	18031	18038	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017136	CTGT	2	8	18574	18581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017136	TCTT	2	8	25386	25393	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017136	ACTG	2	8	27856	27863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017136	ACAG	2	8	29631	29638	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017136	GACT	2	8	30431	30438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017136	CCAC	2	8	34107	34114	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_017136	CCAT	2	8	37102	37109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017136	CCGT	2	8	38335	38342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017136	ATCC	2	8	38472	38479	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017136	ATCC	2	8	38659	38666	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017136	ACAG	2	8	41597	41604	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017136	ACAG	2	8	43266	43273	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017136	AATA	2	8	45205	45212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017136	AGGC	2	8	48095	48102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017136	CTTC	2	8	49101	49108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017136	GTGA	2	8	49197	49204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017136	GGTA	2	8	50585	50592	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017136	AAAT	2	8	60908	60915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017136	CTGT	2	8	63567	63574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017136	GGAA	2	8	65110	65117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017136	CTGA	2	8	67438	67445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017136	TTTA	2	8	67550	67557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017136	GTCA	2	8	69865	69872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017136	CTTA	2	8	74547	74554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017136	CCAG	2	8	74757	74764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017136	GATA	2	8	74794	74801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017136	CTGT	2	8	75135	75142	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017136	CCTG	2	8	80562	80569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017136	GTGG	2	8	81626	81633	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017136	CAGG	2	8	81724	81731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017136	GAAT	2	8	84246	84253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017136	CCAT	2	8	84371	84378	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017136	CAAG	2	8	85524	85531	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017136	CCGG	2	8	86615	86622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017136	ATTG	2	8	86660	86667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017136	CCAG	2	8	87691	87698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017136	CGTC	2	8	87891	87898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017136	AACT	2	8	88062	88069	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017136	CTGT	2	8	88525	88532	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017136	GTTC	2	8	91033	91040	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017136	AAAG	2	8	91169	91176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017136	ACTT	2	8	92326	92333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017136	TACC	2	8	92360	92367	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017136	ACAG	2	8	94493	94500	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017136	CTTT	2	8	95737	95744	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017136	TGTT	2	8	95772	95779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017136	AGTA	2	8	95912	95919	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017136	AAAT	2	8	95999	96006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017136	GATG	2	8	100298	100305	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017136	ATTG	2	8	103497	103504	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017136	GTAA	2	8	103708	103715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017136	GGTA	2	8	104316	104323	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017136	AGAT	2	8	104519	104526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017136	TTCT	2	8	104851	104858	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017136	TATT	2	8	105399	105406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017136	CTTG	2	8	105430	105437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017136	GTGA	2	8	107319	107326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017136	CAAT	2	8	111055	111062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017136	GTGC	2	8	126484	126491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017136	TGGA	2	8	128452	128459	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017136	CTGT	2	8	129635	129642	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017136	TTGA	2	8	132031	132038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017136	TTGA	2	8	132073	132080	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017136	AGCA	2	8	135497	135504	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017136	GCCG	2	8	136606	136613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017136	GGCG	2	8	138655	138662	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017136	ACGA	2	8	139642	139649	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017136	CTGT	2	8	140737	140744	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017136	GAAC	2	8	144022	144029	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017136	ACAG	2	8	145948	145955	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017136	GCAG	2	8	146633	146640	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017136	CTGT	2	8	149501	149508	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017136	CTCA	2	8	152185	152192	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017136	TCAA	2	8	153608	153615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017136	CAAC	2	8	153651	153658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017136	GATA	2	8	157313	157320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017136	ACAG	2	8	161402	161409	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017136	TGCT	2	8	161727	161734	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017136	ATTC	2	8	162276	162283	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017136	CTGT	2	8	164006	164013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017136	TCGC	2	8	169147	169154	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017136	ACGC	2	8	169278	169285	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017136	TCCT	2	8	174085	174092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017136	CCAG	2	8	174609	174616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017136	TGTA	2	8	174679	174686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017136	GATA	2	8	180018	180025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017136	TGAG	2	8	180155	180162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017136	GTGA	2	8	180221	180228	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017136	ACAG	2	8	182010	182017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017136	ACAG	2	8	183691	183698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017136	GCCA	2	8	188981	188988	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017136	GACA	2	8	189400	189407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017136	CGGG	2	8	189768	189775	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017136	GAAG	2	8	190315	190322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017136	TGGA	2	8	190730	190737	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017136	CAAA	2	8	190993	191000	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017136	TGAC	2	8	191127	191134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017136	TCCA	2	8	191300	191307	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.