MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-014

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017136	CTTC	2	8	304	311	0 %	50 %	0 %	50 %	384043892
2	NC_017136	CTGA	2	8	386	393	25 %	25 %	25 %	25 %	384043892
3	NC_017136	GCTG	2	8	1987	1994	0 %	25 %	50 %	25 %	384043894
4	NC_017136	CTGC	2	8	3356	3363	0 %	25 %	25 %	50 %	384043895
5	NC_017136	CAGC	2	8	4068	4075	25 %	0 %	25 %	50 %	384043896
6	NC_017136	TGAT	2	8	5583	5590	25 %	50 %	25 %	0 %	384043898
7	NC_017136	GCAC	2	8	5883	5890	25 %	0 %	25 %	50 %	384043898
8	NC_017136	CCAT	2	8	7170	7177	25 %	25 %	0 %	50 %	384043899
9	NC_017136	GAAA	2	8	7948	7955	75 %	0 %	25 %	0 %	384043900
10	NC_017136	TTGC	2	8	8747	8754	0 %	50 %	25 %	25 %	384043901
11	NC_017136	TTGG	2	8	8768	8775	0 %	50 %	50 %	0 %	384043901
12	NC_017136	TCTT	2	8	8903	8910	0 %	75 %	0 %	25 %	384043901
13	NC_017136	GTCA	2	8	9300	9307	25 %	25 %	25 %	25 %	384043902
14	NC_017136	CCAG	2	8	9820	9827	25 %	0 %	25 %	50 %	384043902
15	NC_017136	TTCT	2	8	10274	10281	0 %	75 %	0 %	25 %	384043902
16	NC_017136	ATGG	2	8	10859	10866	25 %	25 %	50 %	0 %	384043902
17	NC_017136	CAGC	2	8	11443	11450	25 %	0 %	25 %	50 %	384043902
18	NC_017136	AAAG	2	8	11591	11598	75 %	0 %	25 %	0 %	384043902
19	NC_017136	CTTG	2	8	11955	11962	0 %	50 %	25 %	25 %	384043902
20	NC_017136	TTCG	2	8	12338	12345	0 %	50 %	25 %	25 %	384043902
21	NC_017136	GTCA	2	8	12993	13000	25 %	25 %	25 %	25 %	384043902
22	NC_017136	CAGA	2	8	14003	14010	50 %	0 %	25 %	25 %	384043903
23	NC_017136	TGGC	2	8	14343	14350	0 %	25 %	50 %	25 %	384043903
24	NC_017136	GCAC	2	8	14470	14477	25 %	0 %	25 %	50 %	384043903
25	NC_017136	GACA	2	8	14629	14636	50 %	0 %	25 %	25 %	384043903
26	NC_017136	GAAG	2	8	14647	14654	50 %	0 %	50 %	0 %	384043903
27	NC_017136	CGTC	2	8	15286	15293	0 %	25 %	25 %	50 %	384043903
28	NC_017136	TCGG	2	8	15756	15763	0 %	25 %	50 %	25 %	384043904
29	NC_017136	TTGC	2	8	16062	16069	0 %	50 %	25 %	25 %	384043904
30	NC_017136	CGGG	2	8	16559	16566	0 %	0 %	75 %	25 %	384043905
31	NC_017136	CTTC	2	8	17414	17421	0 %	50 %	0 %	50 %	384043905
32	NC_017136	GACG	2	8	18678	18685	25 %	0 %	50 %	25 %	384043907
33	NC_017136	GCGG	2	8	19486	19493	0 %	0 %	75 %	25 %	384043907
34	NC_017136	GCCA	2	8	19621	19628	25 %	0 %	25 %	50 %	384043907
35	NC_017136	TCTG	2	8	19961	19968	0 %	50 %	25 %	25 %	384043907
36	NC_017136	TCGA	2	8	20348	20355	25 %	25 %	25 %	25 %	384043908
37	NC_017136	GAAG	2	8	20515	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	384043908
38	NC_017136	AAGA	2	8	20558	20565	75 %	0 %	25 %	0 %	384043908
39	NC_017136	GAAG	2	8	20943	20950	50 %	0 %	50 %	0 %	384043909
40	NC_017136	TGGA	2	8	21358	21365	25 %	25 %	50 %	0 %	384043910
41	NC_017136	GTCA	2	8	21531	21538	25 %	25 %	25 %	25 %	384043910
42	NC_017136	AGAT	2	8	22339	22346	50 %	25 %	25 %	0 %	384043911
43	NC_017136	GCTC	2	8	23012	23019	0 %	25 %	25 %	50 %	384043912
44	NC_017136	CTAT	2	8	23042	23049	25 %	50 %	0 %	25 %	384043912
45	NC_017136	GCTG	2	8	24150	24157	0 %	25 %	50 %	25 %	384043912
46	NC_017136	AGAA	2	8	24845	24852	75 %	0 %	25 %	0 %	384043912
47	NC_017136	GATA	2	8	24873	24880	50 %	25 %	25 %	0 %	384043912
48	NC_017136	CAAA	2	8	25286	25293	75 %	0 %	0 %	25 %	384043913
49	NC_017136	GGCA	2	8	26056	26063	25 %	0 %	50 %	25 %	384043914
50	NC_017136	TGCG	2	8	26088	26095	0 %	25 %	50 %	25 %	384043914
51	NC_017136	AAGG	2	8	26126	26133	50 %	0 %	50 %	0 %	384043914
52	NC_017136	CCAT	2	8	26812	26819	25 %	25 %	0 %	50 %	384043915
53	NC_017136	CAGA	2	8	28244	28251	50 %	0 %	25 %	25 %	384043917
54	NC_017136	TGGC	2	8	28584	28591	0 %	25 %	50 %	25 %	384043917
55	NC_017136	GCAC	2	8	28711	28718	25 %	0 %	25 %	50 %	384043917
56	NC_017136	GAAG	2	8	28888	28895	50 %	0 %	50 %	0 %	384043917
57	NC_017136	CGTC	2	8	29527	29534	0 %	25 %	25 %	50 %	384043917
58	NC_017136	GTCA	2	8	30145	30152	25 %	25 %	25 %	25 %	384043918
59	NC_017136	ATCT	2	8	31148	31155	25 %	50 %	0 %	25 %	384043919
60	NC_017136	AGGT	2	8	31416	31423	25 %	25 %	50 %	0 %	384043919
61	NC_017136	TTCC	2	8	31640	31647	0 %	50 %	0 %	50 %	384043919
62	NC_017136	AACG	2	8	31981	31988	50 %	0 %	25 %	25 %	384043920
63	NC_017136	GAAC	2	8	32064	32071	50 %	0 %	25 %	25 %	384043920
64	NC_017136	CCAA	2	8	32123	32130	50 %	0 %	0 %	50 %	384043920
65	NC_017136	GGAA	2	8	32802	32809	50 %	0 %	50 %	0 %	384043920
66	NC_017136	TGAT	2	8	33789	33796	25 %	50 %	25 %	0 %	384043921
67	NC_017136	TGGT	2	8	34030	34037	0 %	50 %	50 %	0 %	384043922
68	NC_017136	GCGT	2	8	34434	34441	0 %	25 %	50 %	25 %	384043923
69	NC_017136	ACCC	2	8	34986	34993	25 %	0 %	0 %	75 %	384043923
70	NC_017136	GACA	2	8	35682	35689	50 %	0 %	25 %	25 %	384043923
71	NC_017136	CGTG	2	8	35833	35840	0 %	25 %	50 %	25 %	384043923
72	NC_017136	ATCA	2	8	35852	35859	50 %	25 %	0 %	25 %	384043923
73	NC_017136	CTGG	2	8	35956	35963	0 %	25 %	50 %	25 %	384043923
74	NC_017136	TCAT	2	8	36033	36040	25 %	50 %	0 %	25 %	384043923
75	NC_017136	CGCA	2	8	36310	36317	25 %	0 %	25 %	50 %	384043923
76	NC_017136	CCGT	2	8	36450	36457	0 %	25 %	25 %	50 %	384043923
77	NC_017136	GAGC	2	8	36816	36823	25 %	0 %	50 %	25 %	384043923
78	NC_017136	GAAT	2	8	36977	36984	50 %	25 %	25 %	0 %	384043923
79	NC_017136	CGAT	2	8	37462	37469	25 %	25 %	25 %	25 %	384043924
80	NC_017136	CGGG	2	8	37742	37749	0 %	0 %	75 %	25 %	384043924
81	NC_017136	TTGA	2	8	38069	38076	25 %	50 %	25 %	0 %	384043925
82	NC_017136	ACCC	2	8	38746	38753	25 %	0 %	0 %	75 %	384043926
83	NC_017136	CGCA	2	8	38893	38900	25 %	0 %	25 %	50 %	384043926
84	NC_017136	GGGA	2	8	39516	39523	25 %	0 %	75 %	0 %	384043927
85	NC_017136	CAGA	2	8	39691	39698	50 %	0 %	25 %	25 %	384043928
86	NC_017136	TGGC	2	8	40031	40038	0 %	25 %	50 %	25 %	384043928
87	NC_017136	CAGA	2	8	40210	40217	50 %	0 %	25 %	25 %	384043929
88	NC_017136	TGGC	2	8	40550	40557	0 %	25 %	50 %	25 %	384043929
89	NC_017136	GCAC	2	8	40677	40684	25 %	0 %	25 %	50 %	384043929
90	NC_017136	GAAG	2	8	40854	40861	50 %	0 %	50 %	0 %	384043929
91	NC_017136	CGTC	2	8	41493	41500	0 %	25 %	25 %	50 %	384043929
92	NC_017136	CAGA	2	8	41879	41886	50 %	0 %	25 %	25 %	384043930
93	NC_017136	TGGC	2	8	42219	42226	0 %	25 %	50 %	25 %	384043930
94	NC_017136	GCAC	2	8	42346	42353	25 %	0 %	25 %	50 %	384043930
95	NC_017136	GAAG	2	8	42523	42530	50 %	0 %	50 %	0 %	384043930
96	NC_017136	CGTC	2	8	43162	43169	0 %	25 %	25 %	50 %	384043930
97	NC_017136	TCCG	2	8	44082	44089	0 %	25 %	25 %	50 %	384043931
98	NC_017136	CTGG	2	8	45076	45083	0 %	25 %	50 %	25 %	384043932
99	NC_017136	GGCA	2	8	45138	45145	25 %	0 %	50 %	25 %	384043932
100	NC_017136	ATGG	2	8	45548	45555	25 %	25 %	50 %	0 %	384043933
101	NC_017136	TGCC	2	8	45666	45673	0 %	25 %	25 %	50 %	384043933
102	NC_017136	GCAC	2	8	46044	46051	25 %	0 %	25 %	50 %	384043933
103	NC_017136	GTCT	2	8	46275	46282	0 %	50 %	25 %	25 %	384043933
104	NC_017136	TGGT	2	8	46317	46324	0 %	50 %	50 %	0 %	384043933
105	NC_017136	AATG	2	8	46648	46655	50 %	25 %	25 %	0 %	384043934
106	NC_017136	ACCT	2	8	47772	47779	25 %	25 %	0 %	50 %	384043934
107	NC_017136	ATTG	2	8	47815	47822	25 %	50 %	25 %	0 %	384043934
108	NC_017136	CGTC	2	8	48892	48899	0 %	25 %	25 %	50 %	384043936
109	NC_017136	GCGT	2	8	49056	49063	0 %	25 %	50 %	25 %	384043936
110	NC_017136	GCGT	2	8	49877	49884	0 %	25 %	50 %	25 %	384043937
111	NC_017136	CATC	2	8	50358	50365	25 %	25 %	0 %	50 %	384043937
112	NC_017136	AGCG	2	8	50473	50480	25 %	0 %	50 %	25 %	384043937
113	NC_017136	ACGA	2	8	50878	50885	50 %	0 %	25 %	25 %	384043938
114	NC_017136	GGAC	2	8	51006	51013	25 %	0 %	50 %	25 %	384043938
115	NC_017136	GGTC	2	8	51993	52000	0 %	25 %	50 %	25 %	384043939
116	NC_017136	GAAA	2	8	52631	52638	75 %	0 %	25 %	0 %	384043939
117	NC_017136	TGCC	2	8	54311	54318	0 %	25 %	25 %	50 %	384043940
118	NC_017136	GTGG	2	8	54653	54660	0 %	25 %	75 %	0 %	384043940
119	NC_017136	CCTT	2	8	54666	54673	0 %	50 %	0 %	50 %	384043940
120	NC_017136	CCTT	2	8	55406	55413	0 %	50 %	0 %	50 %	384043941
121	NC_017136	CAGG	2	8	55761	55768	25 %	0 %	50 %	25 %	384043941
122	NC_017136	TGTT	2	8	56591	56598	0 %	75 %	25 %	0 %	384043941
123	NC_017136	TTTC	2	8	56915	56922	0 %	75 %	0 %	25 %	384043942
124	NC_017136	GCGG	2	8	56990	56997	0 %	0 %	75 %	25 %	384043942
125	NC_017136	GGTT	2	8	57025	57032	0 %	50 %	50 %	0 %	384043942
126	NC_017136	TGGA	2	8	57877	57884	25 %	25 %	50 %	0 %	384043943
127	NC_017136	CTCC	2	8	58888	58895	0 %	25 %	0 %	75 %	384043943
128	NC_017136	AGAA	2	8	59352	59359	75 %	0 %	25 %	0 %	384043943
129	NC_017136	CGTC	2	8	59918	59925	0 %	25 %	25 %	50 %	384043943
130	NC_017136	ATGG	2	8	60354	60361	25 %	25 %	50 %	0 %	384043944
131	NC_017136	GGAT	2	8	61778	61785	25 %	25 %	50 %	0 %	384043945
132	NC_017136	CCCG	2	8	62245	62252	0 %	0 %	25 %	75 %	384043945
133	NC_017136	CTGT	2	8	62277	62284	0 %	50 %	25 %	25 %	384043945
134	NC_017136	AATC	2	8	62975	62982	50 %	25 %	0 %	25 %	384043946
135	NC_017136	GACG	2	8	63671	63678	25 %	0 %	50 %	25 %	384043947
136	NC_017136	GGTC	2	8	63941	63948	0 %	25 %	50 %	25 %	384043947
137	NC_017136	CTTC	2	8	64310	64317	0 %	50 %	0 %	50 %	384043947
138	NC_017136	CGGG	2	8	64480	64487	0 %	0 %	75 %	25 %	384043947
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408	NC_017136	ATGG	2	8	185397	185404	25 %	25 %	50 %	0 %	384044066
409	NC_017136	CCGG	2	8	185448	185455	0 %	0 %	50 %	50 %	384044066
410	NC_017136	ACCG	2	8	185868	185875	25 %	0 %	25 %	50 %	384044066
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.