MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-014

Total Repeats: 404

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017136	AGA	2	6	133	138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017136	ATG	2	6	237	242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017136	GGT	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017136	TCC	2	6	1034	1039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017136	AGA	2	6	2327	2332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017136	TGA	2	6	2536	2541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017136	CCT	2	6	3717	3722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017136	CGA	2	6	4189	4194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017136	AAG	2	6	4224	4229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017136	AGC	2	6	4380	4385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017136	TCA	2	6	4402	4407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017136	CGG	2	6	4763	4768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017136	TCA	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017136	TCG	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017136	CTT	2	6	7381	7386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017136	GAC	2	6	7533	7538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017136	ATC	2	6	7541	7546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017136	TTA	2	6	7692	7697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017136	AAT	2	6	7730	7735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017136	TTA	2	6	7762	7767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017136	ATT	2	6	7888	7893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017136	ACT	2	6	7899	7904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017136	TCA	2	6	7920	7925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017136	CTT	2	6	8611	8616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017136	CAG	2	6	13035	13040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017136	ATG	2	6	13043	13048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017136	GAT	2	6	13058	13063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017136	GGT	2	6	13118	13123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017136	GCT	2	6	13290	13295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017136	CCA	2	6	13463	13468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017136	CCT	2	6	13535	13540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017136	CCT	2	6	13547	13552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017136	GCC	2	6	13590	13595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017136	CCG	2	6	13611	13616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017136	CCT	2	6	13627	13632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017136	CAA	2	6	13726	13731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017136	ACC	2	6	13733	13738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017136	GCC	2	6	13753	13758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017136	CCA	2	6	15417	15422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017136	CGC	2	6	15467	15472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017136	ACG	2	6	15580	15585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017136	CCA	2	6	15637	15642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017136	GAC	2	6	16092	16097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017136	AGG	2	6	16111	16116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017136	GAC	2	6	16155	16160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017136	TTC	2	6	16199	16204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017136	GCT	2	6	17677	17682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017136	CAG	2	6	17703	17708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017136	CAA	2	6	17866	17871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017136	CTG	2	6	17953	17958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017136	ATC	2	6	18046	18051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017136	GGC	2	6	18498	18503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017136	TGG	2	6	18549	18554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017136	TGA	2	6	19982	19987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017136	GAT	2	6	20081	20086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017136	TTC	2	6	20148	20153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017136	GCG	2	6	20171	20176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017136	GAG	2	6	20692	20697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017136	GTT	2	6	21840	21845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017136	ATG	2	6	25337	25342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017136	ACC	2	6	25478	25483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017136	TAT	2	6	25500	25505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017136	CGC	2	6	25670	25675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017136	GCC	2	6	25702	25707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017136	GGC	2	6	25716	25721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017136	AAT	2	6	27775	27780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017136	CCA	2	6	27790	27795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017136	ACC	2	6	27806	27811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017136	TTG	2	6	27829	27834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017136	TTA	2	6	27841	27846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017136	GAA	2	6	27920	27925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017136	CAT	2	6	28007	28012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017136	AGG	2	6	28042	28047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017136	CAT	2	6	28048	28053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017136	GGT	2	6	28100	28105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017136	ATT	2	6	28130	28135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017136	ATC	2	6	28224	28229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017136	CCA	2	6	29658	29663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017136	CGC	2	6	29708	29713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017136	TGA	2	6	29828	29833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017136	CAA	2	6	30507	30512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017136	ATA	2	6	30620	30625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017136	TAA	2	6	30632	30637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017136	TGC	2	6	30647	30652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017136	GTT	2	6	31776	31781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017136	GTG	2	6	31891	31896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017136	AGA	2	6	34231	34236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017136	TGA	2	6	37004	37009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017136	ACG	2	6	37036	37041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017136	TCC	2	6	37048	37053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017136	CGC	2	6	37059	37064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017136	GAA	2	6	37068	37073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017136	CGG	2	6	37144	37149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017136	TGA	2	6	38034	38039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017136	GCG	2	6	38355	38360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017136	TAT	2	6	38461	38466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017136	CCG	2	6	38511	38516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017136	CGT	2	6	38645	38650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017136	TCG	2	6	38671	38676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017136	TGA	2	6	38686	38691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017136	ATC	2	6	40190	40195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017136	CCA	2	6	41624	41629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017136	CGC	2	6	41674	41679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017136	ATC	2	6	41859	41864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017136	CCA	2	6	43293	43298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017136	CGC	2	6	43343	43348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017136	GAT	2	6	43466	43471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017136	CGG	2	6	43486	43491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017136	CAG	2	6	43533	43538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017136	ATG	2	6	43539	43544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017136	CCA	2	6	44229	44234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017136	GAA	2	6	44250	44255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017136	GCA	2	6	44329	44334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017136	TAT	2	6	44468	44473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017136	AGG	2	6	44498	44503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017136	AGA	2	6	44517	44522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017136	GAC	2	6	45213	45218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017136	CTA	2	6	45223	45228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017136	TAA	2	6	45242	45247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017136	GAT	2	6	47922	47927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017136	GAT	2	6	47936	47941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017136	TGA	2	6	48103	48108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017136	CAT	2	6	48116	48121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017136	TGA	2	6	48128	48133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017136	GAC	2	6	49160	49165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017136	TCG	2	6	49231	49236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017136	AGC	2	6	50642	50647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017136	GCA	2	6	50760	50765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017136	CTT	2	6	52785	52790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017136	TCA	2	6	52951	52956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017136	CGT	2	6	52964	52969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017136	CCT	2	6	52979	52984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017136	CGG	2	6	52996	53001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017136	ATT	2	6	60892	60897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017136	TGC	2	6	60971	60976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017136	AGA	2	6	61033	61038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017136	GCG	2	6	61097	61102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017136	ATT	2	6	62391	62396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017136	AAG	2	6	62413	62418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017136	AAT	2	6	62422	62427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_017136	AAT	2	6	124103	124108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.