MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-014

Total Repeats: 306

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017136	CG	3	6	422	427	0 %	0 %	50 %	50 %	384043892
2	NC_017136	GC	3	6	1270	1275	0 %	0 %	50 %	50 %	384043894
3	NC_017136	CG	3	6	3182	3187	0 %	0 %	50 %	50 %	384043895
4	NC_017136	TG	3	6	3307	3312	0 %	50 %	50 %	0 %	384043895
5	NC_017136	TG	3	6	3498	3503	0 %	50 %	50 %	0 %	384043895
6	NC_017136	GC	3	6	3892	3897	0 %	0 %	50 %	50 %	384043896
7	NC_017136	TA	3	6	5229	5234	50 %	50 %	0 %	0 %	384043898
8	NC_017136	CG	3	6	5244	5249	0 %	0 %	50 %	50 %	384043898
9	NC_017136	TG	3	6	6288	6293	0 %	50 %	50 %	0 %	384043898
10	NC_017136	AG	3	6	6424	6429	50 %	0 %	50 %	0 %	384043898
11	NC_017136	TG	3	6	7349	7354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017136	GT	3	6	7560	7565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017136	GA	3	6	8415	8420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017136	GA	3	6	10120	10125	50 %	0 %	50 %	0 %	384043902
15	NC_017136	CG	3	6	10597	10602	0 %	0 %	50 %	50 %	384043902
16	NC_017136	CG	3	6	12032	12037	0 %	0 %	50 %	50 %	384043902
17	NC_017136	AG	3	6	12127	12132	50 %	0 %	50 %	0 %	384043902
18	NC_017136	TC	3	6	12471	12476	0 %	50 %	0 %	50 %	384043902
19	NC_017136	CG	3	6	12670	12675	0 %	0 %	50 %	50 %	384043902
20	NC_017136	AG	3	6	12944	12949	50 %	0 %	50 %	0 %	384043902
21	NC_017136	GC	3	6	14882	14887	0 %	0 %	50 %	50 %	384043903
22	NC_017136	GC	3	6	15586	15591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017136	CG	3	6	15707	15712	0 %	0 %	50 %	50 %	384043904
24	NC_017136	AC	3	6	16953	16958	50 %	0 %	0 %	50 %	384043905
25	NC_017136	CA	3	6	17936	17941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017136	CG	3	6	19083	19088	0 %	0 %	50 %	50 %	384043907
27	NC_017136	GC	3	6	19496	19501	0 %	0 %	50 %	50 %	384043907
28	NC_017136	AG	4	8	20185	20192	50 %	0 %	50 %	0 %	384043908
29	NC_017136	TC	3	6	20250	20255	0 %	50 %	0 %	50 %	384043908
30	NC_017136	AC	3	6	20415	20420	50 %	0 %	0 %	50 %	384043908
31	NC_017136	GC	3	6	20826	20831	0 %	0 %	50 %	50 %	384043909
32	NC_017136	TC	3	6	21883	21888	0 %	50 %	0 %	50 %	384043911
33	NC_017136	GA	4	8	21962	21969	50 %	0 %	50 %	0 %	384043911
34	NC_017136	CT	4	8	23716	23723	0 %	50 %	0 %	50 %	384043912
35	NC_017136	GC	3	6	23867	23872	0 %	0 %	50 %	50 %	384043912
36	NC_017136	GT	3	6	26513	26518	0 %	50 %	50 %	0 %	384043915
37	NC_017136	AG	3	6	26755	26760	50 %	0 %	50 %	0 %	384043915
38	NC_017136	CT	3	6	27592	27597	0 %	50 %	0 %	50 %	384043916
39	NC_017136	GA	3	6	27619	27624	50 %	0 %	50 %	0 %	384043916
40	NC_017136	GC	3	6	29123	29128	0 %	0 %	50 %	50 %	384043917
41	NC_017136	CA	3	6	30610	30615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017136	GA	3	6	30655	30660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017136	CA	3	6	30932	30937	50 %	0 %	0 %	50 %	384043919
44	NC_017136	AG	3	6	31183	31188	50 %	0 %	50 %	0 %	384043919
45	NC_017136	TC	3	6	31708	31713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017136	GT	3	6	31796	31801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017136	CT	3	6	31819	31824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017136	AC	3	6	32010	32015	50 %	0 %	0 %	50 %	384043920
49	NC_017136	GA	3	6	34157	34162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017136	AG	3	6	34616	34621	50 %	0 %	50 %	0 %	384043923
51	NC_017136	GC	3	6	34696	34701	0 %	0 %	50 %	50 %	384043923
52	NC_017136	AC	3	6	34719	34724	50 %	0 %	0 %	50 %	384043923
53	NC_017136	CG	3	6	34897	34902	0 %	0 %	50 %	50 %	384043923
54	NC_017136	CG	3	6	35749	35754	0 %	0 %	50 %	50 %	384043923
55	NC_017136	GT	3	6	35757	35762	0 %	50 %	50 %	0 %	384043923
56	NC_017136	CA	3	6	36289	36294	50 %	0 %	0 %	50 %	384043923
57	NC_017136	CT	3	6	37080	37085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017136	CA	3	6	37922	37927	50 %	0 %	0 %	50 %	384043924
59	NC_017136	CA	3	6	38243	38248	50 %	0 %	0 %	50 %	384043925
60	NC_017136	GC	3	6	41089	41094	0 %	0 %	50 %	50 %	384043929
61	NC_017136	GC	3	6	42758	42763	0 %	0 %	50 %	50 %	384043930
62	NC_017136	CA	3	6	44263	44268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017136	TA	3	6	44448	44453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017136	AT	3	6	44562	44567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017136	AC	3	6	45107	45112	50 %	0 %	0 %	50 %	384043932
66	NC_017136	GC	3	6	46150	46155	0 %	0 %	50 %	50 %	384043933
67	NC_017136	CA	3	6	47072	47077	50 %	0 %	0 %	50 %	384043934
68	NC_017136	CG	3	6	47612	47617	0 %	0 %	50 %	50 %	384043934
69	NC_017136	GT	3	6	48290	48295	0 %	50 %	50 %	0 %	384043935
70	NC_017136	TG	3	6	48603	48608	0 %	50 %	50 %	0 %	384043936
71	NC_017136	CT	3	6	48741	48746	0 %	50 %	0 %	50 %	384043936
72	NC_017136	GA	3	6	49260	49265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017136	AG	3	6	49423	49428	50 %	0 %	50 %	0 %	384043937
74	NC_017136	AC	3	6	50114	50119	50 %	0 %	0 %	50 %	384043937
75	NC_017136	GT	3	6	51039	51044	0 %	50 %	50 %	0 %	384043938
76	NC_017136	CA	3	6	52832	52837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017136	AG	3	6	53867	53872	50 %	0 %	50 %	0 %	384043940
78	NC_017136	CG	3	6	55352	55357	0 %	0 %	50 %	50 %	384043941
79	NC_017136	CG	3	6	55690	55695	0 %	0 %	50 %	50 %	384043941
80	NC_017136	CG	3	6	56433	56438	0 %	0 %	50 %	50 %	384043941
81	NC_017136	CA	3	6	59031	59036	50 %	0 %	0 %	50 %	384043943
82	NC_017136	GC	3	6	59602	59607	0 %	0 %	50 %	50 %	384043943
83	NC_017136	CT	3	6	59773	59778	0 %	50 %	0 %	50 %	384043943
84	NC_017136	TC	3	6	60065	60070	0 %	50 %	0 %	50 %	384043943
85	NC_017136	CG	3	6	60512	60517	0 %	0 %	50 %	50 %	384043944
86	NC_017136	CA	3	6	60881	60886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017136	CA	3	6	61060	61065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017136	GC	3	6	61344	61349	0 %	0 %	50 %	50 %	384043945
89	NC_017136	CA	3	6	61375	61380	50 %	0 %	0 %	50 %	384043945
90	NC_017136	GC	3	6	61399	61404	0 %	0 %	50 %	50 %	384043945
91	NC_017136	CT	4	8	61425	61432	0 %	50 %	0 %	50 %	384043945
92	NC_017136	AC	3	6	62687	62692	50 %	0 %	0 %	50 %	384043946
93	NC_017136	AC	3	6	63382	63387	50 %	0 %	0 %	50 %	384043946
94	NC_017136	CG	3	6	64076	64081	0 %	0 %	50 %	50 %	384043947
95	NC_017136	AT	3	6	65235	65240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017136	TC	3	6	65928	65933	0 %	50 %	0 %	50 %	384043948
97	NC_017136	CA	3	6	66890	66895	50 %	0 %	0 %	50 %	384043949
98	NC_017136	AG	3	6	67168	67173	50 %	0 %	50 %	0 %	384043949
99	NC_017136	AT	3	6	67415	67420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017136	TA	4	8	67622	67629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017136	TA	3	6	67676	67681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017136	GA	3	6	67694	67699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017136	AC	3	6	67715	67720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017136	AT	3	6	67924	67929	50 %	50 %	0 %	0 %	384043950
105	NC_017136	CT	3	6	67997	68002	0 %	50 %	0 %	50 %	384043950
106	NC_017136	TC	3	6	68714	68719	0 %	50 %	0 %	50 %	384043950
107	NC_017136	TA	3	6	69457	69462	50 %	50 %	0 %	0 %	384043950
108	NC_017136	AG	3	6	70439	70444	50 %	0 %	50 %	0 %	384043951
109	NC_017136	GC	3	6	70550	70555	0 %	0 %	50 %	50 %	384043951
110	NC_017136	GC	3	6	71135	71140	0 %	0 %	50 %	50 %	384043951
111	NC_017136	TG	3	6	71491	71496	0 %	50 %	50 %	0 %	384043952
112	NC_017136	GA	3	6	71635	71640	50 %	0 %	50 %	0 %	384043952
113	NC_017136	GC	3	6	72787	72792	0 %	0 %	50 %	50 %	384043954
114	NC_017136	CT	4	8	74233	74240	0 %	50 %	0 %	50 %	384043955
115	NC_017136	TC	3	6	74303	74308	0 %	50 %	0 %	50 %	384043955
116	NC_017136	CG	3	6	75644	75649	0 %	0 %	50 %	50 %	384043956
117	NC_017136	TG	3	6	76771	76776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017136	CG	4	8	79802	79809	0 %	0 %	50 %	50 %	384043958
119	NC_017136	GA	3	6	80175	80180	50 %	0 %	50 %	0 %	384043958
120	NC_017136	GC	3	6	80417	80422	0 %	0 %	50 %	50 %	384043958
121	NC_017136	CT	3	6	80613	80618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017136	AG	3	6	80634	80639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017136	CA	3	6	82578	82583	50 %	0 %	0 %	50 %	384043960
124	NC_017136	CT	3	6	82728	82733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017136	CT	3	6	82773	82778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017136	TG	3	6	82946	82951	0 %	50 %	50 %	0 %	384043961
127	NC_017136	CT	3	6	84349	84354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017136	CA	3	6	85191	85196	50 %	0 %	0 %	50 %	384043963
129	NC_017136	CT	3	6	86512	86517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017136	CA	3	6	86784	86789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017136	GT	3	6	87531	87536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017136	AG	3	6	87544	87549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017136	CG	3	6	89034	89039	0 %	0 %	50 %	50 %	384043966
134	NC_017136	GC	3	6	89447	89452	0 %	0 %	50 %	50 %	384043966
135	NC_017136	AG	3	6	90086	90091	50 %	0 %	50 %	0 %	384043967
136	NC_017136	AG	4	8	90386	90393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017136	TC	3	6	90432	90437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017136	AT	3	6	90449	90454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017136	AT	3	6	90503	90508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017136	AC	3	6	90860	90865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017136	AC	3	6	92150	92155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017136	GC	3	6	93985	93990	0 %	0 %	50 %	50 %	384043971
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145	NC_017136	GA	3	6	96464	96469	50 %	0 %	50 %	0 %	384043974
146	NC_017136	TG	3	6	96633	96638	0 %	50 %	50 %	0 %	384043974
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.