MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-014

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017136	CG	3	6	422	427	0 %	0 %	50 %	50 %	384043892
2	NC_017136	GC	3	6	1270	1275	0 %	0 %	50 %	50 %	384043894
3	NC_017136	CG	3	6	3182	3187	0 %	0 %	50 %	50 %	384043895
4	NC_017136	TG	3	6	3307	3312	0 %	50 %	50 %	0 %	384043895
5	NC_017136	TG	3	6	3498	3503	0 %	50 %	50 %	0 %	384043895
6	NC_017136	GC	3	6	3892	3897	0 %	0 %	50 %	50 %	384043896
7	NC_017136	TA	3	6	5229	5234	50 %	50 %	0 %	0 %	384043898
8	NC_017136	CG	3	6	5244	5249	0 %	0 %	50 %	50 %	384043898
9	NC_017136	TG	3	6	6288	6293	0 %	50 %	50 %	0 %	384043898
10	NC_017136	AG	3	6	6424	6429	50 %	0 %	50 %	0 %	384043898
11	NC_017136	GA	3	6	10120	10125	50 %	0 %	50 %	0 %	384043902
12	NC_017136	CG	3	6	10597	10602	0 %	0 %	50 %	50 %	384043902
13	NC_017136	CG	3	6	12032	12037	0 %	0 %	50 %	50 %	384043902
14	NC_017136	AG	3	6	12127	12132	50 %	0 %	50 %	0 %	384043902
15	NC_017136	TC	3	6	12471	12476	0 %	50 %	0 %	50 %	384043902
16	NC_017136	CG	3	6	12670	12675	0 %	0 %	50 %	50 %	384043902
17	NC_017136	AG	3	6	12944	12949	50 %	0 %	50 %	0 %	384043902
18	NC_017136	GC	3	6	14882	14887	0 %	0 %	50 %	50 %	384043903
19	NC_017136	CG	3	6	15707	15712	0 %	0 %	50 %	50 %	384043904
20	NC_017136	AC	3	6	16953	16958	50 %	0 %	0 %	50 %	384043905
21	NC_017136	CG	3	6	19083	19088	0 %	0 %	50 %	50 %	384043907
22	NC_017136	GC	3	6	19496	19501	0 %	0 %	50 %	50 %	384043907
23	NC_017136	AG	4	8	20185	20192	50 %	0 %	50 %	0 %	384043908
24	NC_017136	TC	3	6	20250	20255	0 %	50 %	0 %	50 %	384043908
25	NC_017136	AC	3	6	20415	20420	50 %	0 %	0 %	50 %	384043908
26	NC_017136	GC	3	6	20826	20831	0 %	0 %	50 %	50 %	384043909
27	NC_017136	TC	3	6	21883	21888	0 %	50 %	0 %	50 %	384043911
28	NC_017136	GA	4	8	21962	21969	50 %	0 %	50 %	0 %	384043911
29	NC_017136	CT	4	8	23716	23723	0 %	50 %	0 %	50 %	384043912
30	NC_017136	GC	3	6	23867	23872	0 %	0 %	50 %	50 %	384043912
31	NC_017136	GT	3	6	26513	26518	0 %	50 %	50 %	0 %	384043915
32	NC_017136	AG	3	6	26755	26760	50 %	0 %	50 %	0 %	384043915
33	NC_017136	CT	3	6	27592	27597	0 %	50 %	0 %	50 %	384043916
34	NC_017136	GA	3	6	27619	27624	50 %	0 %	50 %	0 %	384043916
35	NC_017136	GC	3	6	29123	29128	0 %	0 %	50 %	50 %	384043917
36	NC_017136	CA	3	6	30932	30937	50 %	0 %	0 %	50 %	384043919
37	NC_017136	AG	3	6	31183	31188	50 %	0 %	50 %	0 %	384043919
38	NC_017136	AC	3	6	32010	32015	50 %	0 %	0 %	50 %	384043920
39	NC_017136	AG	3	6	34616	34621	50 %	0 %	50 %	0 %	384043923
40	NC_017136	GC	3	6	34696	34701	0 %	0 %	50 %	50 %	384043923
41	NC_017136	AC	3	6	34719	34724	50 %	0 %	0 %	50 %	384043923
42	NC_017136	CG	3	6	34897	34902	0 %	0 %	50 %	50 %	384043923
43	NC_017136	CG	3	6	35749	35754	0 %	0 %	50 %	50 %	384043923
44	NC_017136	GT	3	6	35757	35762	0 %	50 %	50 %	0 %	384043923
45	NC_017136	CA	3	6	36289	36294	50 %	0 %	0 %	50 %	384043923
46	NC_017136	CA	3	6	37922	37927	50 %	0 %	0 %	50 %	384043924
47	NC_017136	CA	3	6	38243	38248	50 %	0 %	0 %	50 %	384043925
48	NC_017136	GC	3	6	41089	41094	0 %	0 %	50 %	50 %	384043929
49	NC_017136	GC	3	6	42758	42763	0 %	0 %	50 %	50 %	384043930
50	NC_017136	AC	3	6	45107	45112	50 %	0 %	0 %	50 %	384043932
51	NC_017136	GC	3	6	46150	46155	0 %	0 %	50 %	50 %	384043933
52	NC_017136	CA	3	6	47072	47077	50 %	0 %	0 %	50 %	384043934
53	NC_017136	CG	3	6	47612	47617	0 %	0 %	50 %	50 %	384043934
54	NC_017136	GT	3	6	48290	48295	0 %	50 %	50 %	0 %	384043935
55	NC_017136	TG	3	6	48603	48608	0 %	50 %	50 %	0 %	384043936
56	NC_017136	CT	3	6	48741	48746	0 %	50 %	0 %	50 %	384043936
57	NC_017136	AG	3	6	49423	49428	50 %	0 %	50 %	0 %	384043937
58	NC_017136	AC	3	6	50114	50119	50 %	0 %	0 %	50 %	384043937
59	NC_017136	GT	3	6	51039	51044	0 %	50 %	50 %	0 %	384043938
60	NC_017136	AG	3	6	53867	53872	50 %	0 %	50 %	0 %	384043940
61	NC_017136	CG	3	6	55352	55357	0 %	0 %	50 %	50 %	384043941
62	NC_017136	CG	3	6	55690	55695	0 %	0 %	50 %	50 %	384043941
63	NC_017136	CG	3	6	56433	56438	0 %	0 %	50 %	50 %	384043941
64	NC_017136	CA	3	6	59031	59036	50 %	0 %	0 %	50 %	384043943
65	NC_017136	GC	3	6	59602	59607	0 %	0 %	50 %	50 %	384043943
66	NC_017136	CT	3	6	59773	59778	0 %	50 %	0 %	50 %	384043943
67	NC_017136	TC	3	6	60065	60070	0 %	50 %	0 %	50 %	384043943
68	NC_017136	CG	3	6	60512	60517	0 %	0 %	50 %	50 %	384043944
69	NC_017136	GC	3	6	61344	61349	0 %	0 %	50 %	50 %	384043945
70	NC_017136	CA	3	6	61375	61380	50 %	0 %	0 %	50 %	384043945
71	NC_017136	GC	3	6	61399	61404	0 %	0 %	50 %	50 %	384043945
72	NC_017136	CT	4	8	61425	61432	0 %	50 %	0 %	50 %	384043945
73	NC_017136	AC	3	6	62687	62692	50 %	0 %	0 %	50 %	384043946
74	NC_017136	AC	3	6	63382	63387	50 %	0 %	0 %	50 %	384043946
75	NC_017136	CG	3	6	64076	64081	0 %	0 %	50 %	50 %	384043947
76	NC_017136	TC	3	6	65928	65933	0 %	50 %	0 %	50 %	384043948
77	NC_017136	CA	3	6	66890	66895	50 %	0 %	0 %	50 %	384043949
78	NC_017136	AG	3	6	67168	67173	50 %	0 %	50 %	0 %	384043949
79	NC_017136	AT	3	6	67924	67929	50 %	50 %	0 %	0 %	384043950
80	NC_017136	CT	3	6	67997	68002	0 %	50 %	0 %	50 %	384043950
81	NC_017136	TC	3	6	68714	68719	0 %	50 %	0 %	50 %	384043950
82	NC_017136	TA	3	6	69457	69462	50 %	50 %	0 %	0 %	384043950
83	NC_017136	AG	3	6	70439	70444	50 %	0 %	50 %	0 %	384043951
84	NC_017136	GC	3	6	70550	70555	0 %	0 %	50 %	50 %	384043951
85	NC_017136	GC	3	6	71135	71140	0 %	0 %	50 %	50 %	384043951
86	NC_017136	TG	3	6	71491	71496	0 %	50 %	50 %	0 %	384043952
87	NC_017136	GA	3	6	71635	71640	50 %	0 %	50 %	0 %	384043952
88	NC_017136	GC	3	6	72787	72792	0 %	0 %	50 %	50 %	384043954
89	NC_017136	CT	4	8	74233	74240	0 %	50 %	0 %	50 %	384043955
90	NC_017136	TC	3	6	74303	74308	0 %	50 %	0 %	50 %	384043955
91	NC_017136	CG	3	6	75644	75649	0 %	0 %	50 %	50 %	384043956
92	NC_017136	CG	4	8	79802	79809	0 %	0 %	50 %	50 %	384043958
93	NC_017136	GA	3	6	80175	80180	50 %	0 %	50 %	0 %	384043958
94	NC_017136	GC	3	6	80417	80422	0 %	0 %	50 %	50 %	384043958
95	NC_017136	CA	3	6	82578	82583	50 %	0 %	0 %	50 %	384043960
96	NC_017136	TG	3	6	82946	82951	0 %	50 %	50 %	0 %	384043961
97	NC_017136	CA	3	6	85191	85196	50 %	0 %	0 %	50 %	384043963
98	NC_017136	CG	3	6	89034	89039	0 %	0 %	50 %	50 %	384043966
99	NC_017136	GC	3	6	89447	89452	0 %	0 %	50 %	50 %	384043966
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101	NC_017136	GC	3	6	93985	93990	0 %	0 %	50 %	50 %	384043971
102	NC_017136	GC	3	6	95606	95611	0 %	0 %	50 %	50 %	384043973
103	NC_017136	GA	3	6	96134	96139	50 %	0 %	50 %	0 %	384043974
104	NC_017136	GA	3	6	96464	96469	50 %	0 %	50 %	0 %	384043974
105	NC_017136	TG	3	6	96633	96638	0 %	50 %	50 %	0 %	384043974
106	NC_017136	AT	3	6	97225	97230	50 %	50 %	0 %	0 %	384043974
107	NC_017136	GC	3	6	97915	97920	0 %	0 %	50 %	50 %	384043975
108	NC_017136	CT	3	6	98101	98106	0 %	50 %	0 %	50 %	384043975
109	NC_017136	GA	3	6	98129	98134	50 %	0 %	50 %	0 %	384043976
110	NC_017136	TG	3	6	98174	98179	0 %	50 %	50 %	0 %	384043976
111	NC_017136	CT	3	6	99069	99074	0 %	50 %	0 %	50 %	384043976
112	NC_017136	GC	3	6	100673	100678	0 %	0 %	50 %	50 %	384043977
113	NC_017136	GC	3	6	101345	101350	0 %	0 %	50 %	50 %	384043977
114	NC_017136	GC	3	6	101798	101803	0 %	0 %	50 %	50 %	384043977
115	NC_017136	TG	3	6	102882	102887	0 %	50 %	50 %	0 %	384043979
116	NC_017136	GC	3	6	105687	105692	0 %	0 %	50 %	50 %	384043982
117	NC_017136	AG	3	6	105800	105805	50 %	0 %	50 %	0 %	384043982
118	NC_017136	CT	3	6	106694	106699	0 %	50 %	0 %	50 %	384043983
119	NC_017136	TG	3	6	107061	107066	0 %	50 %	50 %	0 %	384043984
120	NC_017136	AC	3	6	107133	107138	50 %	0 %	0 %	50 %	384043984
121	NC_017136	AG	3	6	107545	107550	50 %	0 %	50 %	0 %	384043985
122	NC_017136	AC	3	6	108236	108241	50 %	0 %	0 %	50 %	384043985
123	NC_017136	GC	3	6	110259	110264	0 %	0 %	50 %	50 %	384043987
124	NC_017136	CA	3	6	110337	110342	50 %	0 %	0 %	50 %	384043987
125	NC_017136	TC	3	6	110542	110547	0 %	50 %	0 %	50 %	384043988
126	NC_017136	TC	3	6	112757	112762	0 %	50 %	0 %	50 %	384043991
127	NC_017136	AC	3	6	113926	113931	50 %	0 %	0 %	50 %	384043992
128	NC_017136	TC	3	6	115276	115281	0 %	50 %	0 %	50 %	384043993
129	NC_017136	GA	3	6	115758	115763	50 %	0 %	50 %	0 %	384043993
130	NC_017136	GC	3	6	115784	115789	0 %	0 %	50 %	50 %	384043993
131	NC_017136	CT	3	6	116643	116648	0 %	50 %	0 %	50 %	384043993
132	NC_017136	CG	3	6	117574	117579	0 %	0 %	50 %	50 %	384043994
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138	NC_017136	CT	3	6	120353	120358	0 %	50 %	0 %	50 %	384043997
139	NC_017136	CA	3	6	120530	120535	50 %	0 %	0 %	50 %	384043997
140	NC_017136	CG	3	6	121097	121102	0 %	0 %	50 %	50 %	384043998
141	NC_017136	CA	3	6	121917	121922	50 %	0 %	0 %	50 %	384043999
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.