MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 plasmid pAPA32-030

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017135	CTTTC	2	10	1960	1969	0 %	60 %	0 %	40 %	384061758
2	NC_017135	TGGGG	2	10	3671	3680	0 %	20 %	80 %	0 %	384061761
3	NC_017135	ATCAC	2	10	3700	3709	40 %	20 %	0 %	40 %	384061761
4	NC_017135	CTGTT	2	10	4708	4717	0 %	60 %	20 %	20 %	384061762
5	NC_017135	CCAGA	2	10	5319	5328	40 %	0 %	20 %	40 %	384061762
6	NC_017135	GTAAG	2	10	6599	6608	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017135	GCCAC	2	10	8216	8225	20 %	0 %	20 %	60 %	384061767
8	NC_017135	GCTGG	2	10	8725	8734	0 %	20 %	60 %	20 %	384061767
9	NC_017135	TGATC	2	10	9254	9263	20 %	40 %	20 %	20 %	384061769
10	NC_017135	CCGAT	2	10	11122	11131	20 %	20 %	20 %	40 %	384061771
11	NC_017135	ATCTC	2	10	13085	13094	20 %	40 %	0 %	40 %	384061773
12	NC_017135	CGGGT	2	10	21937	21946	0 %	20 %	60 %	20 %	384061788
13	NC_017135	TGGAC	2	10	22872	22881	20 %	20 %	40 %	20 %	384061788
14	NC_017135	GGACA	2	10	24761	24770	40 %	0 %	40 %	20 %	384061792
15	NC_017135	GATGC	2	10	27709	27718	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017135	GCTGG	2	10	30942	30951	0 %	20 %	60 %	20 %	384061799
17	NC_017135	ACCAA	2	10	31340	31349	60 %	0 %	0 %	40 %	384061801
18	NC_017135	GATCC	2	10	32308	32317	20 %	20 %	20 %	40 %	384061801
19	NC_017135	ACAGC	2	10	33964	33973	40 %	0 %	20 %	40 %	384061802
20	NC_017135	GACTG	2	10	38987	38996	20 %	20 %	40 %	20 %	384061805
21	NC_017135	TATGT	2	10	39447	39456	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017135	GGACA	2	10	41831	41840	40 %	0 %	40 %	20 %	384061810
23	NC_017135	TTTCT	2	10	43164	43173	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017135	TGGGG	2	10	43453	43462	0 %	20 %	80 %	0 %	384061811
25	NC_017135	ATCAC	2	10	43482	43491	40 %	20 %	0 %	40 %	384061811
26	NC_017135	CTGTT	2	10	44490	44499	0 %	60 %	20 %	20 %	384061812
27	NC_017135	CCAGA	2	10	45101	45110	40 %	0 %	20 %	40 %	384061812
28	NC_017135	GTAAG	2	10	45946	45955	40 %	20 %	40 %	0 %	384061812
29	NC_017135	CCAGC	2	10	46582	46591	20 %	0 %	20 %	60 %	384061814
30	NC_017135	GCATC	2	10	48578	48587	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.