MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 plasmid pAPA32-012

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017134	GGCGCG	2	12	1810	1821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384061579
2	NC_017134	GGCTGG	2	12	1834	1845	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384061579
3	NC_017134	GATAAT	2	12	7675	7686	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017134	ATTGTC	2	12	12564	12575	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384061587
5	NC_017134	CCTGTC	2	12	12584	12595	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384061587
6	NC_017134	TGGATG	2	12	14493	14504	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061588
7	NC_017134	CATCCA	2	12	19467	19478	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061592
8	NC_017134	GGAACT	2	12	21233	21244	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384061595
9	NC_017134	CATGCT	2	12	24243	24254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384061597
10	NC_017134	TAAGGG	2	12	27320	27331	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384061600
11	NC_017134	TGGATG	2	12	28734	28745	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061602
12	NC_017134	AACAAG	2	12	29979	29990	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384061603
13	NC_017134	GTCAGG	2	12	30748	30759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017134	TCCTGA	2	12	39137	39148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384061612
15	NC_017134	TGGATG	2	12	40732	40743	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061614
16	NC_017134	TGGATG	2	12	42401	42412	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061615
17	NC_017134	GTGCTT	2	12	45382	45393	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384061618
18	NC_017134	GGCATC	2	12	50312	50323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061622
19	NC_017134	CGTCAG	2	12	52365	52376	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061624
20	NC_017134	TTCGGC	2	12	52917	52928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017134	GGCGTG	2	12	61678	61689	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384061630
22	NC_017134	CATCCA	2	12	64492	64503	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061632
23	NC_017134	ATTTTA	2	12	67783	67794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017134	CATTAT	2	12	69445	69456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384061635
25	NC_017134	GAGGAC	2	12	73125	73136	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384061639
26	NC_017134	CATCCA	2	12	76060	76071	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061641
27	NC_017134	AACCAG	2	12	77395	77406	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384061642
28	NC_017134	CATCCA	2	12	89450	89461	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061651
29	NC_017134	TGGATG	2	12	93628	93639	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061656
30	NC_017134	GAATAA	2	12	96118	96129	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384061659
31	NC_017134	TCTTAA	2	12	96371	96382	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384061659
32	NC_017134	TTTGCC	2	12	102654	102665	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384061664
33	NC_017134	GGCATC	2	12	108434	108445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061670
34	NC_017134	CAGCCG	2	12	109484	109495	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384061671
35	NC_017134	CTTCCT	2	12	113578	113589	0 %	50 %	0 %	50 %	384061676
36	NC_017134	AGCGGA	2	12	114314	114325	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384061678
37	NC_017134	GGGCCA	2	12	117334	117345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384061679
38	NC_017134	TGCAGG	2	12	119887	119898	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384061681
39	NC_017134	CCAAAA	2	12	124556	124567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017134	CATCCA	2	12	130560	130571	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061694
41	NC_017134	CCCCCT	2	12	132000	132011	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	384061696
42	NC_017134	CCAGAA	2	12	138862	138873	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384061705
43	NC_017134	GAGGAA	2	12	139907	139918	50 %	0 %	50 %	0 %	384061706
44	NC_017134	CATCCA	2	12	141662	141673	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061707
45	NC_017134	TGGATG	2	12	145083	145094	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061710
46	NC_017134	CCCACG	2	12	148863	148874	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384061711
47	NC_017134	GATGCC	2	12	151131	151142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061715
48	NC_017134	CTTCCT	2	12	153538	153549	0 %	50 %	0 %	50 %	384061716
49	NC_017134	TGGATG	2	12	160537	160548	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061729
50	NC_017134	GATGCC	2	12	163540	163551	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061732
51	NC_017134	CATCCA	2	12	164931	164942	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061733
52	NC_017134	GCCATC	2	12	171312	171323	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384061738
53	NC_017134	CCCAAA	2	12	174937	174948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017134	TGGATG	2	12	181145	181156	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061748
55	NC_017134	TGGATG	2	12	182826	182837	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061749
56	NC_017134	TCCAGC	2	12	185823	185834	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384061751
57	NC_017134	ATTCTG	2	12	186633	186644	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384061751
58	NC_017134	ATACCG	2	12	187947	187958	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384061752
59	NC_017134	TCAGTT	2	12	188114	188125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384061752
60	NC_017134	TATCGC	2	12	189561	189572	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.