MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 plasmid pAPA32-012

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017134	GGCGCG	2	12	1810	1821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384061579
2	NC_017134	GGCTGG	2	12	1834	1845	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384061579
3	NC_017134	ATTGTC	2	12	12564	12575	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384061587
4	NC_017134	CCTGTC	2	12	12584	12595	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384061587
5	NC_017134	TGGATG	2	12	14493	14504	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061588
6	NC_017134	CATCCA	2	12	19467	19478	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061592
7	NC_017134	GGAACT	2	12	21233	21244	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384061595
8	NC_017134	CATGCT	2	12	24243	24254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384061597
9	NC_017134	TAAGGG	2	12	27320	27331	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384061600
10	NC_017134	TGGATG	2	12	28734	28745	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061602
11	NC_017134	AACAAG	2	12	29979	29990	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384061603
12	NC_017134	TCCTGA	2	12	39137	39148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384061612
13	NC_017134	TGGATG	2	12	40732	40743	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061614
14	NC_017134	TGGATG	2	12	42401	42412	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061615
15	NC_017134	GTGCTT	2	12	45382	45393	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384061618
16	NC_017134	GGCATC	2	12	50312	50323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061622
17	NC_017134	CGTCAG	2	12	52365	52376	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061624
18	NC_017134	GGCGTG	2	12	61678	61689	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384061630
19	NC_017134	CATCCA	2	12	64492	64503	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061632
20	NC_017134	CATTAT	2	12	69445	69456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384061635
21	NC_017134	GAGGAC	2	12	73125	73136	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384061639
22	NC_017134	CATCCA	2	12	76060	76071	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061641
23	NC_017134	AACCAG	2	12	77395	77406	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384061642
24	NC_017134	CATCCA	2	12	89450	89461	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061651
25	NC_017134	TGGATG	2	12	93628	93639	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061656
26	NC_017134	GAATAA	2	12	96118	96129	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384061659
27	NC_017134	TCTTAA	2	12	96371	96382	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384061659
28	NC_017134	TTTGCC	2	12	102654	102665	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384061664
29	NC_017134	GGCATC	2	12	108434	108445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061670
30	NC_017134	CAGCCG	2	12	109484	109495	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384061671
31	NC_017134	CTTCCT	2	12	113578	113589	0 %	50 %	0 %	50 %	384061676
32	NC_017134	AGCGGA	2	12	114314	114325	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384061678
33	NC_017134	GGGCCA	2	12	117334	117345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384061679
34	NC_017134	TGCAGG	2	12	119887	119898	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384061681
35	NC_017134	CATCCA	2	12	130560	130571	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061694
36	NC_017134	CCCCCT	2	12	132000	132011	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	384061696
37	NC_017134	CCAGAA	2	12	138862	138873	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384061705
38	NC_017134	GAGGAA	2	12	139907	139918	50 %	0 %	50 %	0 %	384061706
39	NC_017134	CATCCA	2	12	141662	141673	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061707
40	NC_017134	TGGATG	2	12	145083	145094	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061710
41	NC_017134	CCCACG	2	12	148863	148874	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384061711
42	NC_017134	GATGCC	2	12	151131	151142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061715
43	NC_017134	CTTCCT	2	12	153538	153549	0 %	50 %	0 %	50 %	384061716
44	NC_017134	TGGATG	2	12	160537	160548	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061729
45	NC_017134	GATGCC	2	12	163540	163551	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384061732
46	NC_017134	CATCCA	2	12	164931	164942	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384061733
47	NC_017134	GCCATC	2	12	171312	171323	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384061738
48	NC_017134	TGGATG	2	12	181145	181156	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061748
49	NC_017134	TGGATG	2	12	182826	182837	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384061749
50	NC_017134	TCCAGC	2	12	185823	185834	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384061751
51	NC_017134	ATTCTG	2	12	186633	186644	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384061751
52	NC_017134	ATACCG	2	12	187947	187958	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384061752
53	NC_017134	TCAGTT	2	12	188114	188125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384061752

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.