MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 plasmid pAPA32-012

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017134	GCTGG	2	10	272	281	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017134	GGCTC	2	10	2132	2141	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017134	ATGTG	2	10	7497	7506	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017134	TTTCT	2	10	19997	20006	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017134	AGAAA	2	10	28206	28215	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017134	GCTCC	2	10	34106	34115	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_017134	AGAAA	2	10	40204	40213	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017134	AGAAA	2	10	41873	41882	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017134	CTTGC	2	10	81769	81778	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017134	TTTCT	2	10	83719	83728	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017134	CCAGA	2	10	86660	86669	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017134	TCACT	2	10	91102	91111	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017134	AATCA	2	10	91133	91142	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017134	CTGAG	2	10	91150	91159	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017134	TTTAC	2	10	92344	92353	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017134	TTATG	2	10	99900	99909	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017134	GACAT	2	10	103766	103775	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017134	GTATT	2	10	111064	111073	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017134	TTTCT	2	10	131090	131099	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017134	ATAGT	2	10	135499	135508	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017134	TTTCT	2	10	142192	142201	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017134	CTTTT	2	10	144104	144113	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017134	ATGAC	2	10	144244	144253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017134	AGAAA	2	10	144555	144564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017134	TGATC	2	10	146237	146246	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017134	CAGAT	2	10	146441	146450	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017134	AAACA	2	10	153844	153853	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017134	CTTCC	2	10	154447	154456	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017134	CTGCC	2	10	156019	156028	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017134	AGAAA	2	10	160009	160018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017134	TCTAT	2	10	162206	162215	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017134	TTTCT	2	10	165461	165470	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017134	CTGCT	2	10	169107	169116	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017134	CCGGA	2	10	169223	169232	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017134	ATGCA	2	10	176416	176425	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017134	AGAAA	2	10	180617	180626	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017134	AGAAA	2	10	182298	182307	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017134	CCAGC	2	10	190377	190386	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_017134	GCCAC	2	10	191206	191215	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.