MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 plasmid pAPA32-012

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017134	GGAAA	2	10	1869	1878	60 %	0 %	40 %	0 %	384061579
2	NC_017134	TGCCA	2	10	3100	3109	20 %	20 %	20 %	40 %	384061580
3	NC_017134	CGATC	2	10	3215	3224	20 %	20 %	20 %	40 %	384061580
4	NC_017134	GAGCT	2	10	3806	3815	20 %	20 %	40 %	20 %	384061581
5	NC_017134	CTGTG	2	10	5534	5543	0 %	40 %	40 %	20 %	384061583
6	NC_017134	ATCCG	2	10	8722	8731	20 %	20 %	20 %	40 %	384061586
7	NC_017134	AAGCC	2	10	9063	9072	40 %	0 %	20 %	40 %	384061587
8	NC_017134	TACGC	2	10	11257	11266	20 %	20 %	20 %	40 %	384061587
9	NC_017134	GGACA	2	10	18664	18673	40 %	0 %	40 %	20 %	384061592
10	NC_017134	ACCAC	2	10	20504	20513	40 %	0 %	0 %	60 %	384061593
11	NC_017134	CCAGC	2	10	20973	20982	20 %	0 %	20 %	60 %	384061595
12	NC_017134	CTGGC	2	10	22804	22813	0 %	20 %	40 %	40 %	384061597
13	NC_017134	TGCAA	2	10	23370	23379	40 %	20 %	20 %	20 %	384061597
14	NC_017134	CTGGT	2	10	23661	23670	0 %	40 %	40 %	20 %	384061597
15	NC_017134	TGTCC	2	10	29539	29548	0 %	40 %	20 %	40 %	384061602
16	NC_017134	CACCT	2	10	32507	32516	20 %	20 %	0 %	60 %	384061605
17	NC_017134	GCAGG	2	10	36240	36249	20 %	0 %	60 %	20 %	384061608
18	NC_017134	GCTGT	2	10	37289	37298	0 %	40 %	40 %	20 %	384061609
19	NC_017134	CATGC	2	10	39474	39483	20 %	20 %	20 %	40 %	384061612
20	NC_017134	TGTCC	2	10	41537	41546	0 %	40 %	20 %	40 %	384061614
21	NC_017134	TGTCC	2	10	43206	43215	0 %	40 %	20 %	40 %	384061615
22	NC_017134	ATGGC	2	10	45908	45917	20 %	20 %	40 %	20 %	384061618
23	NC_017134	CCTGA	2	10	46442	46451	20 %	20 %	20 %	40 %	384061618
24	NC_017134	TTATT	2	10	50894	50903	20 %	80 %	0 %	0 %	384061623
25	NC_017134	CGTTC	2	10	51441	51450	0 %	40 %	20 %	40 %	384061624
26	NC_017134	CGGTC	2	10	53187	53196	0 %	20 %	40 %	40 %	384061625
27	NC_017134	GAAGC	2	10	56331	56340	40 %	0 %	40 %	20 %	384061626
28	NC_017134	TCAAG	2	10	57369	57378	40 %	20 %	20 %	20 %	384061627
29	NC_017134	CAGGA	2	10	58489	58498	40 %	0 %	40 %	20 %	384061628
30	NC_017134	CGGAC	2	10	59343	59352	20 %	0 %	40 %	40 %	384061628
31	NC_017134	CACAT	2	10	62778	62787	40 %	20 %	0 %	40 %	384061631
32	NC_017134	ACACA	2	10	65542	65551	60 %	0 %	0 %	40 %	384061633
33	NC_017134	TTACA	2	10	68940	68949	40 %	40 %	0 %	20 %	384061635
34	NC_017134	ACTGT	2	10	69045	69054	20 %	40 %	20 %	20 %	384061635
35	NC_017134	CAACG	2	10	70457	70466	40 %	0 %	20 %	40 %	384061636
36	NC_017134	CCGTC	2	10	71442	71451	0 %	20 %	20 %	60 %	384061637
37	NC_017134	AGCAG	2	10	73855	73864	40 %	0 %	40 %	20 %	384061639
38	NC_017134	GGACA	2	10	75257	75266	40 %	0 %	40 %	20 %	384061641
39	NC_017134	CACAC	2	10	77071	77080	40 %	0 %	0 %	60 %	384061642
40	NC_017134	ACGCC	2	10	81222	81231	20 %	0 %	20 %	60 %	384061644
41	NC_017134	CCGCG	2	10	82137	82146	0 %	0 %	40 %	60 %	384061645
42	NC_017134	GCACA	2	10	83032	83041	40 %	0 %	20 %	40 %	384061646
43	NC_017134	GCTGT	2	10	84558	84567	0 %	40 %	40 %	20 %	384061648
44	NC_017134	CCGAG	2	10	86973	86982	20 %	0 %	40 %	40 %	384061650
45	NC_017134	GGACA	2	10	88647	88656	40 %	0 %	40 %	20 %	384061651
46	NC_017134	TTTCT	2	10	89980	89989	0 %	80 %	0 %	20 %	384061652
47	NC_017134	TCCTC	2	10	92034	92043	0 %	40 %	0 %	60 %	384061654
48	NC_017134	TGTCC	2	10	94433	94442	0 %	40 %	20 %	40 %	384061656
49	NC_017134	ATGCA	2	10	98001	98010	40 %	20 %	20 %	20 %	384061660
50	NC_017134	CCTGA	2	10	100428	100437	20 %	20 %	20 %	40 %	384061662
51	NC_017134	CATTG	2	10	100468	100477	20 %	40 %	20 %	20 %	384061662
52	NC_017134	CAAGG	2	10	101526	101535	40 %	0 %	40 %	20 %	384061662
53	NC_017134	CTGGG	2	10	101772	101781	0 %	20 %	60 %	20 %	384061662
54	NC_017134	AGGGG	2	10	102016	102025	20 %	0 %	80 %	0 %	384061662
55	NC_017134	CTATT	2	10	105180	105189	20 %	60 %	0 %	20 %	384061666
56	NC_017134	GTCAC	2	10	114548	114557	20 %	20 %	20 %	40 %	384061678
57	NC_017134	TTGGA	2	10	117900	117909	20 %	40 %	40 %	0 %	384061679
58	NC_017134	CGGTT	2	10	119008	119017	0 %	40 %	40 %	20 %	384061680
59	NC_017134	CGTCC	2	10	125755	125764	0 %	20 %	20 %	60 %	384061688
60	NC_017134	TTTCA	2	10	125996	126005	20 %	60 %	0 %	20 %	384061688
61	NC_017134	TTATT	2	10	128728	128737	20 %	80 %	0 %	0 %	384061692
62	NC_017134	GGACA	2	10	129757	129766	40 %	0 %	40 %	20 %	384061694
63	NC_017134	GCCCT	2	10	131748	131757	0 %	20 %	20 %	60 %	384061696
64	NC_017134	GCCAC	2	10	133350	133359	20 %	0 %	20 %	60 %	384061698
65	NC_017134	GCTGG	2	10	133859	133868	0 %	20 %	60 %	20 %	384061698
66	NC_017134	AGCGA	2	10	134294	134303	40 %	0 %	40 %	20 %	384061700
67	NC_017134	TCCGT	2	10	136947	136956	0 %	40 %	20 %	40 %	384061704
68	NC_017134	CTGCG	2	10	137675	137684	0 %	20 %	40 %	40 %	384061704
69	NC_017134	TCGCG	2	10	138210	138219	0 %	20 %	40 %	40 %	384061704
70	NC_017134	CGTCC	2	10	140357	140366	0 %	20 %	20 %	60 %	384061706
71	NC_017134	GGACA	2	10	140859	140868	40 %	0 %	40 %	20 %	384061707
72	NC_017134	CATGG	2	10	142976	142985	20 %	20 %	40 %	20 %	384061709
73	NC_017134	AATTA	2	10	143141	143150	60 %	40 %	0 %	0 %	384061709
74	NC_017134	TGTCC	2	10	145888	145897	0 %	40 %	20 %	40 %	384061710
75	NC_017134	ACCGT	2	10	146990	146999	20 %	20 %	20 %	40 %	384061711
76	NC_017134	GATCA	2	10	147622	147631	40 %	20 %	20 %	20 %	384061711
77	NC_017134	TGGGG	2	10	149568	149577	0 %	20 %	80 %	0 %	384061713
78	NC_017134	GGCAC	2	10	151690	151699	20 %	0 %	40 %	40 %	384061715
79	NC_017134	CCAAC	2	10	157588	157597	40 %	0 %	0 %	60 %	384061722
80	NC_017134	CTGCC	2	10	158705	158714	0 %	20 %	20 %	60 %	384061726
81	NC_017134	GCCAT	2	10	159057	159066	20 %	20 %	20 %	40 %	384061727
82	NC_017134	GCCAC	2	10	159879	159888	20 %	0 %	20 %	60 %	384061728
83	NC_017134	TGTCC	2	10	161342	161351	0 %	40 %	20 %	40 %	384061729
84	NC_017134	TGCCC	2	10	162891	162900	0 %	20 %	20 %	60 %	384061731
85	NC_017134	GGACA	2	10	164128	164137	40 %	0 %	40 %	20 %	384061733
86	NC_017134	CATCT	2	10	165621	165630	20 %	40 %	0 %	40 %	384061734
87	NC_017134	ATCGC	2	10	165880	165889	20 %	20 %	20 %	40 %	384061734
88	NC_017134	CCAAC	2	10	166080	166089	40 %	0 %	0 %	60 %	384061735
89	NC_017134	TCCGG	2	10	167319	167328	0 %	20 %	40 %	40 %	384061735
90	NC_017134	TCCGG	2	10	171808	171817	0 %	20 %	40 %	40 %	384061739
91	NC_017134	TCGCG	2	10	171868	171877	0 %	20 %	40 %	40 %	384061739
92	NC_017134	CCCGG	2	10	172075	172084	0 %	0 %	40 %	60 %	384061740
93	NC_017134	GTCCG	2	10	172679	172688	0 %	20 %	40 %	40 %	384061740
94	NC_017134	TGATC	2	10	173429	173438	20 %	40 %	20 %	20 %	384061741
95	NC_017134	ACACC	2	10	175002	175011	40 %	0 %	0 %	60 %	384061743
96	NC_017134	AGTAG	2	10	175635	175644	40 %	20 %	40 %	0 %	384061743
97	NC_017134	CGATG	2	10	177213	177222	20 %	20 %	40 %	20 %	384061744
98	NC_017134	GGAAA	2	10	178101	178110	60 %	0 %	40 %	0 %	384061745
99	NC_017134	TGTCC	2	10	181950	181959	0 %	40 %	20 %	40 %	384061748
100	NC_017134	TGTCC	2	10	183631	183640	0 %	40 %	20 %	40 %	384061749
101	NC_017134	GCCCA	2	10	184934	184943	20 %	0 %	20 %	60 %	384061751
102	NC_017134	TGCTC	2	10	185743	185752	0 %	40 %	20 %	40 %	384061751
103	NC_017134	CCGAG	2	10	186340	186349	20 %	0 %	40 %	40 %	384061751
104	NC_017134	CATGC	2	10	186887	186896	20 %	20 %	20 %	40 %	384061752
105	NC_017134	CCTGC	2	10	187467	187476	0 %	20 %	20 %	60 %	384061752
106	NC_017134	ACGAC	2	10	190027	190036	40 %	0 %	20 %	40 %	384061753

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.