MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 plasmid pAPA32-012

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017134	CTTC	2	8	304	311	0 %	50 %	0 %	50 %	384061577
2	NC_017134	CTGA	2	8	386	393	25 %	25 %	25 %	25 %	384061577
3	NC_017134	GCTG	2	8	1987	1994	0 %	25 %	50 %	25 %	384061579
4	NC_017134	CTGC	2	8	3356	3363	0 %	25 %	25 %	50 %	384061580
5	NC_017134	CAGC	2	8	4068	4075	25 %	0 %	25 %	50 %	384061581
6	NC_017134	TGAT	2	8	5583	5590	25 %	50 %	25 %	0 %	384061583
7	NC_017134	GCAC	2	8	5883	5890	25 %	0 %	25 %	50 %	384061583
8	NC_017134	CCAT	2	8	7170	7177	25 %	25 %	0 %	50 %	384061584
9	NC_017134	GAAA	2	8	7948	7955	75 %	0 %	25 %	0 %	384061585
10	NC_017134	TTGC	2	8	8747	8754	0 %	50 %	25 %	25 %	384061586
11	NC_017134	TTGG	2	8	8768	8775	0 %	50 %	50 %	0 %	384061586
12	NC_017134	TCTT	2	8	8903	8910	0 %	75 %	0 %	25 %	384061586
13	NC_017134	GTCA	2	8	9300	9307	25 %	25 %	25 %	25 %	384061587
14	NC_017134	CCAG	2	8	9820	9827	25 %	0 %	25 %	50 %	384061587
15	NC_017134	TTCT	2	8	10274	10281	0 %	75 %	0 %	25 %	384061587
16	NC_017134	ATGG	2	8	10859	10866	25 %	25 %	50 %	0 %	384061587
17	NC_017134	CAGC	2	8	11443	11450	25 %	0 %	25 %	50 %	384061587
18	NC_017134	AAAG	2	8	11591	11598	75 %	0 %	25 %	0 %	384061587
19	NC_017134	CTTG	2	8	11955	11962	0 %	50 %	25 %	25 %	384061587
20	NC_017134	TTCG	2	8	12338	12345	0 %	50 %	25 %	25 %	384061587
21	NC_017134	GTCA	2	8	12993	13000	25 %	25 %	25 %	25 %	384061587
22	NC_017134	CAGA	2	8	14003	14010	50 %	0 %	25 %	25 %	384061588
23	NC_017134	TGGC	2	8	14343	14350	0 %	25 %	50 %	25 %	384061588
24	NC_017134	GCAC	2	8	14470	14477	25 %	0 %	25 %	50 %	384061588
25	NC_017134	GACA	2	8	14629	14636	50 %	0 %	25 %	25 %	384061588
26	NC_017134	GAAG	2	8	14647	14654	50 %	0 %	50 %	0 %	384061588
27	NC_017134	CGTC	2	8	15286	15293	0 %	25 %	25 %	50 %	384061588
28	NC_017134	TCGG	2	8	15756	15763	0 %	25 %	50 %	25 %	384061589
29	NC_017134	TTGC	2	8	16062	16069	0 %	50 %	25 %	25 %	384061589
30	NC_017134	CGGG	2	8	16559	16566	0 %	0 %	75 %	25 %	384061590
31	NC_017134	CTTC	2	8	17414	17421	0 %	50 %	0 %	50 %	384061590
32	NC_017134	GACG	2	8	18678	18685	25 %	0 %	50 %	25 %	384061592
33	NC_017134	GCGG	2	8	19486	19493	0 %	0 %	75 %	25 %	384061592
34	NC_017134	GCCA	2	8	19621	19628	25 %	0 %	25 %	50 %	384061592
35	NC_017134	TCTG	2	8	19961	19968	0 %	50 %	25 %	25 %	384061592
36	NC_017134	TCGA	2	8	20348	20355	25 %	25 %	25 %	25 %	384061593
37	NC_017134	GAAG	2	8	20515	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	384061593
38	NC_017134	AAGA	2	8	20558	20565	75 %	0 %	25 %	0 %	384061593
39	NC_017134	GAAG	2	8	20943	20950	50 %	0 %	50 %	0 %	384061594
40	NC_017134	TGGA	2	8	21358	21365	25 %	25 %	50 %	0 %	384061595
41	NC_017134	GTCA	2	8	21531	21538	25 %	25 %	25 %	25 %	384061595
42	NC_017134	AGAT	2	8	22339	22346	50 %	25 %	25 %	0 %	384061596
43	NC_017134	GCTC	2	8	23012	23019	0 %	25 %	25 %	50 %	384061597
44	NC_017134	CTAT	2	8	23042	23049	25 %	50 %	0 %	25 %	384061597
45	NC_017134	GCTG	2	8	24150	24157	0 %	25 %	50 %	25 %	384061597
46	NC_017134	AGAA	2	8	24845	24852	75 %	0 %	25 %	0 %	384061597
47	NC_017134	GATA	2	8	24873	24880	50 %	25 %	25 %	0 %	384061597
48	NC_017134	CAAA	2	8	25286	25293	75 %	0 %	0 %	25 %	384061598
49	NC_017134	GGCA	2	8	26056	26063	25 %	0 %	50 %	25 %	384061599
50	NC_017134	TGCG	2	8	26088	26095	0 %	25 %	50 %	25 %	384061599
51	NC_017134	AAGG	2	8	26126	26133	50 %	0 %	50 %	0 %	384061599
52	NC_017134	CCAT	2	8	26812	26819	25 %	25 %	0 %	50 %	384061600
53	NC_017134	CAGA	2	8	28244	28251	50 %	0 %	25 %	25 %	384061602
54	NC_017134	TGGC	2	8	28584	28591	0 %	25 %	50 %	25 %	384061602
55	NC_017134	GCAC	2	8	28711	28718	25 %	0 %	25 %	50 %	384061602
56	NC_017134	GAAG	2	8	28888	28895	50 %	0 %	50 %	0 %	384061602
57	NC_017134	CGTC	2	8	29527	29534	0 %	25 %	25 %	50 %	384061602
58	NC_017134	GTCA	2	8	30145	30152	25 %	25 %	25 %	25 %	384061603
59	NC_017134	ATCT	2	8	31148	31155	25 %	50 %	0 %	25 %	384061604
60	NC_017134	AGGT	2	8	31416	31423	25 %	25 %	50 %	0 %	384061604
61	NC_017134	TTCC	2	8	31640	31647	0 %	50 %	0 %	50 %	384061604
62	NC_017134	AACG	2	8	31981	31988	50 %	0 %	25 %	25 %	384061605
63	NC_017134	GAAC	2	8	32064	32071	50 %	0 %	25 %	25 %	384061605
64	NC_017134	CCAA	2	8	32123	32130	50 %	0 %	0 %	50 %	384061605
65	NC_017134	GGAA	2	8	32802	32809	50 %	0 %	50 %	0 %	384061605
66	NC_017134	TGAT	2	8	33789	33796	25 %	50 %	25 %	0 %	384061606
67	NC_017134	TGGT	2	8	34062	34069	0 %	50 %	50 %	0 %	384061607
68	NC_017134	GCGT	2	8	34466	34473	0 %	25 %	50 %	25 %	384061608
69	NC_017134	ACCC	2	8	35018	35025	25 %	0 %	0 %	75 %	384061608
70	NC_017134	GACA	2	8	35714	35721	50 %	0 %	25 %	25 %	384061608
71	NC_017134	CGTG	2	8	35865	35872	0 %	25 %	50 %	25 %	384061608
72	NC_017134	ATCA	2	8	35884	35891	50 %	25 %	0 %	25 %	384061608
73	NC_017134	CTGG	2	8	35988	35995	0 %	25 %	50 %	25 %	384061608
74	NC_017134	TCAT	2	8	36065	36072	25 %	50 %	0 %	25 %	384061608
75	NC_017134	CGCA	2	8	36342	36349	25 %	0 %	25 %	50 %	384061608
76	NC_017134	CCGT	2	8	36482	36489	0 %	25 %	25 %	50 %	384061608
77	NC_017134	GAGC	2	8	36848	36855	25 %	0 %	50 %	25 %	384061608
78	NC_017134	GAAT	2	8	37009	37016	50 %	25 %	25 %	0 %	384061608
79	NC_017134	CGAT	2	8	37494	37501	25 %	25 %	25 %	25 %	384061609
80	NC_017134	CGGG	2	8	37774	37781	0 %	0 %	75 %	25 %	384061609
81	NC_017134	TTGA	2	8	38101	38108	25 %	50 %	25 %	0 %	384061610
82	NC_017134	ACCC	2	8	38778	38785	25 %	0 %	0 %	75 %	384061611
83	NC_017134	CGCA	2	8	38925	38932	25 %	0 %	25 %	50 %	384061611
84	NC_017134	GGGA	2	8	39548	39555	25 %	0 %	75 %	0 %	384061612
85	NC_017134	CAGA	2	8	39723	39730	50 %	0 %	25 %	25 %	384061613
86	NC_017134	TGGC	2	8	40063	40070	0 %	25 %	50 %	25 %	384061613
87	NC_017134	CAGA	2	8	40242	40249	50 %	0 %	25 %	25 %	384061614
88	NC_017134	TGGC	2	8	40582	40589	0 %	25 %	50 %	25 %	384061614
89	NC_017134	GCAC	2	8	40709	40716	25 %	0 %	25 %	50 %	384061614
90	NC_017134	GAAG	2	8	40886	40893	50 %	0 %	50 %	0 %	384061614
91	NC_017134	CGTC	2	8	41525	41532	0 %	25 %	25 %	50 %	384061614
92	NC_017134	CAGA	2	8	41911	41918	50 %	0 %	25 %	25 %	384061615
93	NC_017134	TGGC	2	8	42251	42258	0 %	25 %	50 %	25 %	384061615
94	NC_017134	GCAC	2	8	42378	42385	25 %	0 %	25 %	50 %	384061615
95	NC_017134	GAAG	2	8	42555	42562	50 %	0 %	50 %	0 %	384061615
96	NC_017134	CGTC	2	8	43194	43201	0 %	25 %	25 %	50 %	384061615
97	NC_017134	TCCG	2	8	44114	44121	0 %	25 %	25 %	50 %	384061616
98	NC_017134	CTGG	2	8	45108	45115	0 %	25 %	50 %	25 %	384061617
99	NC_017134	GGCA	2	8	45170	45177	25 %	0 %	50 %	25 %	384061617
100	NC_017134	ATGG	2	8	45580	45587	25 %	25 %	50 %	0 %	384061618
101	NC_017134	TGCC	2	8	45698	45705	0 %	25 %	25 %	50 %	384061618
102	NC_017134	GCAC	2	8	46076	46083	25 %	0 %	25 %	50 %	384061618
103	NC_017134	GTCT	2	8	46307	46314	0 %	50 %	25 %	25 %	384061618
104	NC_017134	TGGT	2	8	46349	46356	0 %	50 %	50 %	0 %	384061618
105	NC_017134	AATG	2	8	46680	46687	50 %	25 %	25 %	0 %	384061619
106	NC_017134	ACCT	2	8	47804	47811	25 %	25 %	0 %	50 %	384061619
107	NC_017134	ATTG	2	8	47847	47854	25 %	50 %	25 %	0 %	384061619
108	NC_017134	CGTC	2	8	48924	48931	0 %	25 %	25 %	50 %	384061621
109	NC_017134	GCGT	2	8	49088	49095	0 %	25 %	50 %	25 %	384061621
110	NC_017134	GCGT	2	8	49909	49916	0 %	25 %	50 %	25 %	384061622
111	NC_017134	CATC	2	8	50390	50397	25 %	25 %	0 %	50 %	384061622
112	NC_017134	AGCG	2	8	50505	50512	25 %	0 %	50 %	25 %	384061622
113	NC_017134	ACGA	2	8	50910	50917	50 %	0 %	25 %	25 %	384061623
114	NC_017134	GGAC	2	8	51038	51045	25 %	0 %	50 %	25 %	384061623
115	NC_017134	GGTC	2	8	52025	52032	0 %	25 %	50 %	25 %	384061624
116	NC_017134	GAAA	2	8	52663	52670	75 %	0 %	25 %	0 %	384061624
117	NC_017134	TGCC	2	8	54343	54350	0 %	25 %	25 %	50 %	384061625
118	NC_017134	GTGG	2	8	54685	54692	0 %	25 %	75 %	0 %	384061625
119	NC_017134	CCTT	2	8	54698	54705	0 %	50 %	0 %	50 %	384061625
120	NC_017134	CCTT	2	8	55438	55445	0 %	50 %	0 %	50 %	384061626
121	NC_017134	CAGG	2	8	55793	55800	25 %	0 %	50 %	25 %	384061626
122	NC_017134	TGTT	2	8	56623	56630	0 %	75 %	25 %	0 %	384061626
123	NC_017134	TTTC	2	8	56947	56954	0 %	75 %	0 %	25 %	384061627
124	NC_017134	GCGG	2	8	57022	57029	0 %	0 %	75 %	25 %	384061627
125	NC_017134	GGTT	2	8	57057	57064	0 %	50 %	50 %	0 %	384061627
126	NC_017134	TGGA	2	8	57909	57916	25 %	25 %	50 %	0 %	384061628
127	NC_017134	CTCC	2	8	58920	58927	0 %	25 %	0 %	75 %	384061628
128	NC_017134	AGAA	2	8	59384	59391	75 %	0 %	25 %	0 %	384061628
129	NC_017134	CGTC	2	8	59950	59957	0 %	25 %	25 %	50 %	384061628
130	NC_017134	ATGG	2	8	60386	60393	25 %	25 %	50 %	0 %	384061629
131	NC_017134	GGAT	2	8	61810	61817	25 %	25 %	50 %	0 %	384061630
132	NC_017134	CCCG	2	8	62277	62284	0 %	0 %	25 %	75 %	384061630
133	NC_017134	CTGT	2	8	62309	62316	0 %	50 %	25 %	25 %	384061630
134	NC_017134	AATC	2	8	63007	63014	50 %	25 %	0 %	25 %	384061631
135	NC_017134	GACG	2	8	63703	63710	25 %	0 %	50 %	25 %	384061632
136	NC_017134	GGTC	2	8	63973	63980	0 %	25 %	50 %	25 %	384061632
137	NC_017134	CTTC	2	8	64342	64349	0 %	50 %	0 %	50 %	384061632
138	NC_017134	CGGG	2	8	64512	64519	0 %	0 %	75 %	25 %	384061632
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408	NC_017134	ATGG	2	8	185429	185436	25 %	25 %	50 %	0 %	384061751
409	NC_017134	CCGG	2	8	185480	185487	0 %	0 %	50 %	50 %	384061751
410	NC_017134	ACCG	2	8	185900	185907	25 %	0 %	25 %	50 %	384061751
411	NC_017134	CATC	2	8	185926	185933	25 %	25 %	0 %	50 %	384061751
412	NC_017134	CCGC	2	8	186118	186125	0 %	0 %	25 %	75 %	384061751
413	NC_017134	GGCC	2	8	186583	186590	0 %	0 %	50 %	50 %	384061751
414	NC_017134	CTTC	2	8	187278	187285	0 %	50 %	0 %	50 %	384061752
415	NC_017134	CCAA	2	8	188070	188077	50 %	0 %	0 %	50 %	384061752
416	NC_017134	GATC	2	8	189969	189976	25 %	25 %	25 %	25 %	384061753

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.