MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-26 plasmid pAPA26-020

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017131	TGTCC	2	10	886	895	0 %	40 %	20 %	40 %	384061401
2	NC_017131	CCAAT	2	10	4003	4012	40 %	20 %	0 %	40 %	384061407
3	NC_017131	GCGGA	2	10	4420	4429	20 %	0 %	60 %	20 %	384061408
4	NC_017131	TGAGA	2	10	5929	5938	40 %	20 %	40 %	0 %	384061409
5	NC_017131	GGCAC	2	10	8920	8929	20 %	0 %	40 %	40 %	384061411
6	NC_017131	CACCC	2	10	9786	9795	20 %	0 %	0 %	80 %	384061412
7	NC_017131	TGATA	2	10	9944	9953	40 %	40 %	20 %	0 %	384061412
8	NC_017131	GGACA	2	10	10765	10774	40 %	0 %	40 %	20 %	384061413
9	NC_017131	AAAAG	2	10	13311	13320	80 %	0 %	20 %	0 %	384061415
10	NC_017131	TTTTA	2	10	13991	14000	20 %	80 %	0 %	0 %	384061416
11	NC_017131	GGAAA	2	10	15512	15521	60 %	0 %	40 %	0 %	384061417
12	NC_017131	CAATG	2	10	17635	17644	40 %	20 %	20 %	20 %	384061418
13	NC_017131	CCTGC	2	10	19626	19635	0 %	20 %	20 %	60 %	384061420
14	NC_017131	CAGCA	2	10	20035	20044	40 %	0 %	20 %	40 %	384061420
15	NC_017131	ATAGG	2	10	20290	20299	40 %	20 %	40 %	0 %	384061420
16	NC_017131	CATGC	2	10	21389	21398	20 %	20 %	20 %	40 %	384061421
17	NC_017131	CACAC	2	10	21974	21983	40 %	0 %	0 %	60 %	384061422
18	NC_017131	CCAGC	2	10	23410	23419	20 %	0 %	20 %	60 %	384061424
19	NC_017131	GTGGC	2	10	23919	23928	0 %	20 %	60 %	20 %	384061424
20	NC_017131	AAGGC	2	10	27123	27132	40 %	0 %	40 %	20 %	384061427
21	NC_017131	CATTC	2	10	27215	27224	20 %	40 %	0 %	40 %	384061427
22	NC_017131	GGCCC	2	10	28995	29004	0 %	0 %	40 %	60 %	384061427
23	NC_017131	AGGAT	2	10	30340	30349	40 %	20 %	40 %	0 %	384061430
24	NC_017131	TGTGG	2	10	33958	33967	0 %	40 %	60 %	0 %	384061433
25	NC_017131	GGAAA	2	10	34169	34178	60 %	0 %	40 %	0 %	384061433
26	NC_017131	GAAAA	2	10	35455	35464	80 %	0 %	20 %	0 %	384061433
27	NC_017131	CTGAT	2	10	39730	39739	20 %	40 %	20 %	20 %	384061438
28	NC_017131	AGGCA	2	10	40730	40739	40 %	0 %	40 %	20 %	384061439
29	NC_017131	GTTGG	2	10	43343	43352	0 %	40 %	60 %	0 %	384061440
30	NC_017131	GCCAT	2	10	43394	43403	20 %	20 %	20 %	40 %	384061440
31	NC_017131	ACCAT	2	10	43592	43601	40 %	20 %	0 %	40 %	384061440
32	NC_017131	CCCTG	2	10	45133	45142	0 %	20 %	20 %	60 %	384061441
33	NC_017131	AAATC	2	10	49246	49255	60 %	20 %	0 %	20 %	384061446
34	NC_017131	TGCGC	2	10	50463	50472	0 %	20 %	40 %	40 %	384061447
35	NC_017131	AGGCA	2	10	51467	51476	40 %	0 %	40 %	20 %	384061448
36	NC_017131	ACGAC	2	10	53050	53059	40 %	0 %	20 %	40 %	384061450
37	NC_017131	CGGGT	2	10	55158	55167	0 %	20 %	60 %	20 %	384061453
38	NC_017131	TGCCG	2	10	55770	55779	0 %	20 %	40 %	40 %	384061454
39	NC_017131	GGTCG	2	10	55882	55891	0 %	20 %	60 %	20 %	384061454
40	NC_017131	GCGCC	2	10	57008	57017	0 %	0 %	40 %	60 %	384061455
41	NC_017131	CCATC	2	10	58345	58354	20 %	20 %	0 %	60 %	384061457
42	NC_017131	GCGTT	2	10	58683	58692	0 %	40 %	40 %	20 %	384061457
43	NC_017131	GCAGG	2	10	60057	60066	20 %	0 %	60 %	20 %	384061458
44	NC_017131	CCGTC	2	10	60828	60837	0 %	20 %	20 %	60 %	384061458
45	NC_017131	ATTTT	2	10	63376	63385	20 %	80 %	0 %	0 %	384061459
46	NC_017131	GCTGG	2	10	65314	65323	0 %	20 %	60 %	20 %	384061461
47	NC_017131	GTCCA	2	10	65541	65550	20 %	20 %	20 %	40 %	384061461
48	NC_017131	GCCAC	2	10	66228	66237	20 %	0 %	20 %	60 %	384061462
49	NC_017131	GCTGG	2	10	66737	66746	0 %	20 %	60 %	20 %	384061462
50	NC_017131	GGCGC	2	10	68688	68697	0 %	0 %	60 %	40 %	384061466
51	NC_017131	CATGA	2	10	71467	71476	40 %	20 %	20 %	20 %	384061470
52	NC_017131	GCATT	2	10	71970	71979	20 %	40 %	20 %	20 %	384061470
53	NC_017131	GACTG	2	10	72835	72844	20 %	20 %	40 %	20 %	384061471
54	NC_017131	GTCCT	2	10	74718	74727	0 %	40 %	20 %	40 %	384061473
55	NC_017131	TGATC	2	10	75423	75432	20 %	40 %	20 %	20 %	384061474
56	NC_017131	TGCTC	2	10	76204	76213	0 %	40 %	20 %	40 %	384061475
57	NC_017131	TATTG	2	10	76431	76440	20 %	60 %	20 %	0 %	384061475
58	NC_017131	CCAGC	2	10	79259	79268	20 %	0 %	20 %	60 %	384061479
59	NC_017131	TTTCC	2	10	80722	80731	0 %	60 %	0 %	40 %	384061480
60	NC_017131	GCTGG	2	10	82687	82696	0 %	20 %	60 %	20 %	384061481
61	NC_017131	GCCCG	2	10	83988	83997	0 %	0 %	40 %	60 %	384061484
62	NC_017131	TGAGG	2	10	85064	85073	20 %	20 %	60 %	0 %	384061485
63	NC_017131	TGTCC	2	10	87302	87311	0 %	40 %	20 %	40 %	384061487
64	NC_017131	GGACA	2	10	89046	89055	40 %	0 %	40 %	20 %	384061490
65	NC_017131	AGCGG	2	10	90658	90667	20 %	0 %	60 %	20 %	384061491
66	NC_017131	TCGCC	2	10	90767	90776	0 %	20 %	20 %	60 %	384061491
67	NC_017131	GCATG	2	10	90953	90962	20 %	20 %	40 %	20 %	384061491
68	NC_017131	ATTCC	2	10	91458	91467	20 %	40 %	0 %	40 %	384061491
69	NC_017131	AGCGA	2	10	93876	93885	40 %	0 %	40 %	20 %	384061493
70	NC_017131	CAAAG	2	10	96047	96056	60 %	0 %	20 %	20 %	384061496
71	NC_017131	CAGCC	2	10	96867	96876	20 %	0 %	20 %	60 %	384061497
72	NC_017131	GTTGG	2	10	100432	100441	0 %	40 %	60 %	0 %	384061501
73	NC_017131	TTTTC	2	10	101545	101554	0 %	80 %	0 %	20 %	384061501
74	NC_017131	GTGCC	2	10	102071	102080	0 %	20 %	40 %	40 %	384061501
75	NC_017131	CCAGC	2	10	102558	102567	20 %	0 %	20 %	60 %	384061503
76	NC_017131	GTGGC	2	10	103067	103076	0 %	20 %	60 %	20 %	384061503
77	NC_017131	CACTG	2	10	103983	103992	20 %	20 %	20 %	40 %	384061505
78	NC_017131	TGGAC	2	10	104346	104355	20 %	20 %	40 %	20 %	384061505
79	NC_017131	GGACA	2	10	105552	105561	40 %	0 %	40 %	20 %	384061507
80	NC_017131	TGCGC	2	10	110147	110156	0 %	20 %	40 %	40 %	384061512
81	NC_017131	GGACA	2	10	112712	112721	40 %	0 %	40 %	20 %	384061514
82	NC_017131	CCATG	2	10	114613	114622	20 %	20 %	20 %	40 %	384061515
83	NC_017131	GATAC	2	10	116689	116698	40 %	20 %	20 %	20 %	384061517
84	NC_017131	GCTGG	2	10	117551	117560	0 %	20 %	60 %	20 %	384061518
85	NC_017131	CTGAC	2	10	118186	118195	20 %	20 %	20 %	40 %	384061521
86	NC_017131	TTTTC	2	10	118980	118989	0 %	80 %	0 %	20 %	384061522
87	NC_017131	CGTTT	2	10	119631	119640	0 %	60 %	20 %	20 %	384061523
88	NC_017131	CACTG	2	10	121386	121395	20 %	20 %	20 %	40 %	384061523
89	NC_017131	TTATT	2	10	126656	126665	20 %	80 %	0 %	0 %	384061528
90	NC_017131	CGTTC	2	10	127203	127212	0 %	40 %	20 %	40 %	384061529
91	NC_017131	CGGTC	2	10	128949	128958	0 %	20 %	40 %	40 %	384061530
92	NC_017131	GAAGC	2	10	132093	132102	40 %	0 %	40 %	20 %	384061531
93	NC_017131	TCAAG	2	10	133131	133140	40 %	20 %	20 %	20 %	384061532
94	NC_017131	CAGGA	2	10	134251	134260	40 %	0 %	40 %	20 %	384061533
95	NC_017131	CGGAC	2	10	135105	135114	20 %	0 %	40 %	40 %	384061533
96	NC_017131	GAGCA	2	10	137241	137250	40 %	0 %	40 %	20 %	384061535
97	NC_017131	GACAG	2	10	138415	138424	40 %	0 %	40 %	20 %	384061537
98	NC_017131	AGCGG	2	10	142650	142659	20 %	0 %	60 %	20 %	384061539
99	NC_017131	AGGTC	2	10	147737	147746	20 %	20 %	40 %	20 %	384061543
100	NC_017131	CATCG	2	10	149288	149297	20 %	20 %	20 %	40 %	384061544
101	NC_017131	GGCAG	2	10	149790	149799	20 %	0 %	60 %	20 %	384061545
102	NC_017131	CGGCA	2	10	150231	150240	20 %	0 %	40 %	40 %	384061545
103	NC_017131	CCTCA	2	10	152774	152783	20 %	20 %	0 %	60 %	384061548
104	NC_017131	CCGGG	2	10	153849	153858	0 %	0 %	60 %	40 %	384061549
105	NC_017131	CGTTT	2	10	154790	154799	0 %	60 %	20 %	20 %	384061551
106	NC_017131	TGTCC	2	10	156969	156978	0 %	40 %	20 %	40 %	384061553
107	NC_017131	GCCAT	2	10	159119	159128	20 %	20 %	20 %	40 %	384061555
108	NC_017131	AGCTG	2	10	160166	160175	20 %	20 %	40 %	20 %	384061556
109	NC_017131	CGTTC	2	10	162714	162723	0 %	40 %	20 %	40 %	384061560
110	NC_017131	CCCTG	2	10	166572	166581	0 %	20 %	20 %	60 %	384061561
111	NC_017131	CTGCT	2	10	168244	168253	0 %	40 %	20 %	40 %	384061561
112	NC_017131	GAGGG	2	10	168396	168405	20 %	0 %	80 %	0 %	384061561
113	NC_017131	TTGAA	2	10	172596	172605	40 %	40 %	20 %	0 %	384061564
114	NC_017131	GCGTT	2	10	172737	172746	0 %	40 %	40 %	20 %	384061564
115	NC_017131	GGGCA	2	10	174165	174174	20 %	0 %	60 %	20 %	384061565
116	NC_017131	GGCAC	2	10	175804	175813	20 %	0 %	40 %	40 %	384061566

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.