MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-26 plasmid pAPA26-013

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017130	GCTGG	2	10	272	281	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017130	GGAAA	2	10	1869	1878	60 %	0 %	40 %	0 %	384061219
3	NC_017130	GGCTC	2	10	2132	2141	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017130	TGCCA	2	10	3100	3109	20 %	20 %	20 %	40 %	384061220
5	NC_017130	CGATC	2	10	3215	3224	20 %	20 %	20 %	40 %	384061220
6	NC_017130	GAGCT	2	10	3806	3815	20 %	20 %	40 %	20 %	384061221
7	NC_017130	CTGTG	2	10	5534	5543	0 %	40 %	40 %	20 %	384061223
8	NC_017130	ATGTG	2	10	7497	7506	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017130	ATCCG	2	10	8722	8731	20 %	20 %	20 %	40 %	384061226
10	NC_017130	AAGCC	2	10	9063	9072	40 %	0 %	20 %	40 %	384061227
11	NC_017130	TACGC	2	10	11257	11266	20 %	20 %	20 %	40 %	384061227
12	NC_017130	GGACA	2	10	18664	18673	40 %	0 %	40 %	20 %	384061232
13	NC_017130	TTTCT	2	10	19997	20006	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017130	ACCAC	2	10	20504	20513	40 %	0 %	0 %	60 %	384061233
15	NC_017130	CCAGC	2	10	20973	20982	20 %	0 %	20 %	60 %	384061235
16	NC_017130	CTGGC	2	10	22804	22813	0 %	20 %	40 %	40 %	384061237
17	NC_017130	TGCAA	2	10	23370	23379	40 %	20 %	20 %	20 %	384061237
18	NC_017130	CTGGT	2	10	23661	23670	0 %	40 %	40 %	20 %	384061237
19	NC_017130	AGAAA	2	10	28206	28215	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017130	TGTCC	2	10	29539	29548	0 %	40 %	20 %	40 %	384061242
21	NC_017130	CACCT	2	10	32507	32516	20 %	20 %	0 %	60 %	384061245
22	NC_017130	GCTCC	2	10	34082	34091	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017130	GCAGG	2	10	36216	36225	20 %	0 %	60 %	20 %	384061248
24	NC_017130	GCTGT	2	10	37265	37274	0 %	40 %	40 %	20 %	384061249
25	NC_017130	CATGC	2	10	39450	39459	20 %	20 %	20 %	40 %	384061252
26	NC_017130	AGAAA	2	10	40180	40189	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017130	TGTCC	2	10	41513	41522	0 %	40 %	20 %	40 %	384061254
28	NC_017130	AGAAA	2	10	41849	41858	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017130	TGTCC	2	10	43182	43191	0 %	40 %	20 %	40 %	384061255
30	NC_017130	ATGGC	2	10	45884	45893	20 %	20 %	40 %	20 %	384061258
31	NC_017130	CCTGA	2	10	46418	46427	20 %	20 %	20 %	40 %	384061258
32	NC_017130	TTATT	2	10	50870	50879	20 %	80 %	0 %	0 %	384061263
33	NC_017130	CGTTC	2	10	51417	51426	0 %	40 %	20 %	40 %	384061264
34	NC_017130	CGGTC	2	10	53163	53172	0 %	20 %	40 %	40 %	384061265
35	NC_017130	GAAGC	2	10	56307	56316	40 %	0 %	40 %	20 %	384061266
36	NC_017130	TCAAG	2	10	57345	57354	40 %	20 %	20 %	20 %	384061267
37	NC_017130	CAGGA	2	10	58465	58474	40 %	0 %	40 %	20 %	384061268
38	NC_017130	CGGAC	2	10	59319	59328	20 %	0 %	40 %	40 %	384061268
39	NC_017130	CACAT	2	10	62754	62763	40 %	20 %	0 %	40 %	384061271
40	NC_017130	ACACA	2	10	65518	65527	60 %	0 %	0 %	40 %	384061273
41	NC_017130	TTACA	2	10	68916	68925	40 %	40 %	0 %	20 %	384061275
42	NC_017130	ACTGT	2	10	69021	69030	20 %	40 %	20 %	20 %	384061275
43	NC_017130	CAACG	2	10	70433	70442	40 %	0 %	20 %	40 %	384061276
44	NC_017130	CCGTC	2	10	71418	71427	0 %	20 %	20 %	60 %	384061277
45	NC_017130	AGCAG	2	10	73831	73840	40 %	0 %	40 %	20 %	384061279
46	NC_017130	GGACA	2	10	75233	75242	40 %	0 %	40 %	20 %	384061281
47	NC_017130	CACAC	2	10	77047	77056	40 %	0 %	0 %	60 %	384061282
48	NC_017130	ACGCC	2	10	81198	81207	20 %	0 %	20 %	60 %	384061284
49	NC_017130	CTTGC	2	10	81745	81754	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017130	CCGCG	2	10	82113	82122	0 %	0 %	40 %	60 %	384061285
51	NC_017130	GCACA	2	10	83008	83017	40 %	0 %	20 %	40 %	384061286
52	NC_017130	TTTCT	2	10	83695	83704	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017130	GCTGT	2	10	84534	84543	0 %	40 %	40 %	20 %	384061288
54	NC_017130	CCAGA	2	10	86636	86645	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017130	CCGAG	2	10	86949	86958	20 %	0 %	40 %	40 %	384061290
56	NC_017130	GGACA	2	10	88623	88632	40 %	0 %	40 %	20 %	384061291
57	NC_017130	TTTCT	2	10	89956	89965	0 %	80 %	0 %	20 %	384061292
58	NC_017130	TCACT	2	10	91078	91087	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017130	AATCA	2	10	91109	91118	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017130	CTGAG	2	10	91126	91135	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017130	TCCTC	2	10	92010	92019	0 %	40 %	0 %	60 %	384061294
62	NC_017130	TTTAC	2	10	92320	92329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017130	TGTCC	2	10	94409	94418	0 %	40 %	20 %	40 %	384061296
64	NC_017130	ATGCA	2	10	97977	97986	40 %	20 %	20 %	20 %	384061300
65	NC_017130	TTATG	2	10	99876	99885	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017130	CCTGA	2	10	100404	100413	20 %	20 %	20 %	40 %	384061302
67	NC_017130	CATTG	2	10	100444	100453	20 %	40 %	20 %	20 %	384061302
68	NC_017130	CAAGG	2	10	101502	101511	40 %	0 %	40 %	20 %	384061302
69	NC_017130	CTGGG	2	10	101748	101757	0 %	20 %	60 %	20 %	384061302
70	NC_017130	AGGGG	2	10	101992	102001	20 %	0 %	80 %	0 %	384061302
71	NC_017130	GACAT	2	10	103742	103751	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017130	CTATT	2	10	105156	105165	20 %	60 %	0 %	20 %	384061306
73	NC_017130	GTATT	2	10	111040	111049	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017130	GTCAC	2	10	114524	114533	20 %	20 %	20 %	40 %	384061318
75	NC_017130	TTGGA	2	10	117876	117885	20 %	40 %	40 %	0 %	384061319
76	NC_017130	CGGTT	2	10	118984	118993	0 %	40 %	40 %	20 %	384061320
77	NC_017130	CGTCC	2	10	125731	125740	0 %	20 %	20 %	60 %	384061328
78	NC_017130	TTTCA	2	10	125972	125981	20 %	60 %	0 %	20 %	384061328
79	NC_017130	TTATT	2	10	128704	128713	20 %	80 %	0 %	0 %	384061332
80	NC_017130	GGACA	2	10	129733	129742	40 %	0 %	40 %	20 %	384061334
81	NC_017130	TTTCT	2	10	131066	131075	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017130	GCCCT	2	10	131724	131733	0 %	20 %	20 %	60 %	384061336
83	NC_017130	GCCAC	2	10	133326	133335	20 %	0 %	20 %	60 %	384061338
84	NC_017130	GCTGG	2	10	133835	133844	0 %	20 %	60 %	20 %	384061338
85	NC_017130	AGCGA	2	10	134270	134279	40 %	0 %	40 %	20 %	384061340
86	NC_017130	ATAGT	2	10	135475	135484	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017130	TCCGT	2	10	136923	136932	0 %	40 %	20 %	40 %	384061344
88	NC_017130	CTGCG	2	10	137651	137660	0 %	20 %	40 %	40 %	384061344
89	NC_017130	TCGCG	2	10	138186	138195	0 %	20 %	40 %	40 %	384061344
90	NC_017130	CGTCC	2	10	140333	140342	0 %	20 %	20 %	60 %	384061346
91	NC_017130	GGACA	2	10	140835	140844	40 %	0 %	40 %	20 %	384061347
92	NC_017130	TTTCT	2	10	142168	142177	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017130	CATGG	2	10	142952	142961	20 %	20 %	40 %	20 %	384061349
94	NC_017130	AATTA	2	10	143117	143126	60 %	40 %	0 %	0 %	384061349
95	NC_017130	CTTTT	2	10	144080	144089	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017130	ATGAC	2	10	144220	144229	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017130	AGAAA	2	10	144531	144540	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017130	TGTCC	2	10	145864	145873	0 %	40 %	20 %	40 %	384061350
99	NC_017130	TGATC	2	10	146213	146222	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017130	CAGAT	2	10	146417	146426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017130	ACCGT	2	10	146966	146975	20 %	20 %	20 %	40 %	384061351
102	NC_017130	GATCA	2	10	147598	147607	40 %	20 %	20 %	20 %	384061351
103	NC_017130	TGGGG	2	10	149544	149553	0 %	20 %	80 %	0 %	384061353
104	NC_017130	GGCAC	2	10	151666	151675	20 %	0 %	40 %	40 %	384061355
105	NC_017130	AAACA	2	10	153820	153829	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017130	CTTCC	2	10	154423	154432	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_017130	CTGCC	2	10	155995	156004	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_017130	CCAAC	2	10	157564	157573	40 %	0 %	0 %	60 %	384061362
109	NC_017130	CTGCC	2	10	158681	158690	0 %	20 %	20 %	60 %	384061366
110	NC_017130	GCCAT	2	10	159033	159042	20 %	20 %	20 %	40 %	384061367
111	NC_017130	GCCAC	2	10	159855	159864	20 %	0 %	20 %	60 %	384061368
112	NC_017130	AGAAA	2	10	159985	159994	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017130	TGTCC	2	10	161318	161327	0 %	40 %	20 %	40 %	384061369
114	NC_017130	TCTAT	2	10	162182	162191	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017130	TGCCC	2	10	162867	162876	0 %	20 %	20 %	60 %	384061371
116	NC_017130	GGACA	2	10	164104	164113	40 %	0 %	40 %	20 %	384061373
117	NC_017130	TTTCT	2	10	165437	165446	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017130	CATCT	2	10	165597	165606	20 %	40 %	0 %	40 %	384061374
119	NC_017130	ATCGC	2	10	165856	165865	20 %	20 %	20 %	40 %	384061374
120	NC_017130	CCAAC	2	10	166056	166065	40 %	0 %	0 %	60 %	384061375
121	NC_017130	TCCGG	2	10	167295	167304	0 %	20 %	40 %	40 %	384061375
122	NC_017130	CTGCT	2	10	169083	169092	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017130	CCGGA	2	10	169199	169208	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017130	TCCGG	2	10	171784	171793	0 %	20 %	40 %	40 %	384061379
125	NC_017130	TCGCG	2	10	171844	171853	0 %	20 %	40 %	40 %	384061379
126	NC_017130	CCCGG	2	10	172051	172060	0 %	0 %	40 %	60 %	384061380
127	NC_017130	GTCCG	2	10	172655	172664	0 %	20 %	40 %	40 %	384061380
128	NC_017130	TGATC	2	10	173405	173414	20 %	40 %	20 %	20 %	384061381
129	NC_017130	ACACC	2	10	174978	174987	40 %	0 %	0 %	60 %	384061383
130	NC_017130	AGTAG	2	10	175611	175620	40 %	20 %	40 %	0 %	384061383
131	NC_017130	ATGCA	2	10	176392	176401	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017130	CGATG	2	10	177189	177198	20 %	20 %	40 %	20 %	384061384
133	NC_017130	GGAAA	2	10	178077	178086	60 %	0 %	40 %	0 %	384061385
134	NC_017130	AGAAA	2	10	180593	180602	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017130	TGTCC	2	10	181926	181935	0 %	40 %	20 %	40 %	384061388
136	NC_017130	AGAAA	2	10	182274	182283	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017130	TGTCC	2	10	183607	183616	0 %	40 %	20 %	40 %	384061389
138	NC_017130	GCCCA	2	10	184910	184919	20 %	0 %	20 %	60 %	384061391
139	NC_017130	TGCTC	2	10	185719	185728	0 %	40 %	20 %	40 %	384061391
140	NC_017130	CCGAG	2	10	186316	186325	20 %	0 %	40 %	40 %	384061391
141	NC_017130	CATGC	2	10	186863	186872	20 %	20 %	20 %	40 %	384061392
142	NC_017130	CCTGC	2	10	187443	187452	0 %	20 %	20 %	60 %	384061392
143	NC_017130	ACGAC	2	10	190003	190012	40 %	0 %	20 %	40 %	384061393
144	NC_017130	CCAGC	2	10	190353	190362	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_017130	GCCAC	2	10	191182	191191	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.