MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-26 plasmid pAPA26-013

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017130	CTTC	2	8	1004	1011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017130	ACGG	2	8	2378	2385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017130	GATC	3	12	2574	2585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017130	TCGT	2	8	4285	4292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017130	AGCC	2	8	4843	4850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017130	CGGT	2	8	8484	8491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017130	TTGC	2	8	13240	13247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017130	CGAT	2	8	13374	13381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017130	GACT	2	8	13488	13495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017130	ACAG	2	8	15390	15397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017130	TAAC	2	8	17996	18003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017130	TTTG	2	8	18031	18038	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017130	CTGT	2	8	18574	18581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017130	TCTT	2	8	25386	25393	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017130	ACTG	2	8	27856	27863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017130	ACAG	2	8	29631	29638	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017130	GACT	2	8	30431	30438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017130	CCAC	2	8	34115	34122	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_017130	CCAT	2	8	37110	37117	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017130	CCGT	2	8	38343	38350	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017130	ATCC	2	8	38480	38487	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017130	ATCC	2	8	38667	38674	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017130	ACAG	2	8	41605	41612	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017130	ACAG	2	8	43274	43281	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017130	AATA	2	8	45213	45220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017130	AGGC	2	8	48103	48110	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017130	CTTC	2	8	49109	49116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017130	GTGA	2	8	49205	49212	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017130	GGTA	2	8	50593	50600	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017130	AAAT	2	8	60916	60923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017130	CTGT	2	8	63575	63582	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017130	GGAA	2	8	65118	65125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017130	CTGA	2	8	67446	67453	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017130	TTTA	2	8	67558	67565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017130	GTCA	2	8	69873	69880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017130	CTTA	2	8	74555	74562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017130	CCAG	2	8	74765	74772	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017130	GATA	2	8	74802	74809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017130	CTGT	2	8	75143	75150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017130	CCTG	2	8	80570	80577	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017130	GTGG	2	8	81634	81641	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017130	CAGG	2	8	81732	81739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017130	GAAT	2	8	84254	84261	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017130	CCAT	2	8	84379	84386	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017130	CAAG	2	8	85532	85539	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017130	CCGG	2	8	86623	86630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017130	ATTG	2	8	86668	86675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017130	CCAG	2	8	87699	87706	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017130	CGTC	2	8	87899	87906	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017130	AACT	2	8	88070	88077	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017130	CTGT	2	8	88533	88540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017130	GTTC	2	8	91041	91048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017130	AAAG	2	8	91177	91184	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017130	ACTT	2	8	92334	92341	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017130	TACC	2	8	92368	92375	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017130	ACAG	2	8	94501	94508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017130	CTTT	2	8	95745	95752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017130	TGTT	2	8	95780	95787	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017130	AGTA	2	8	95920	95927	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017130	AAAT	2	8	96007	96014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017130	GATG	2	8	100306	100313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017130	ATTG	2	8	103505	103512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017130	GTAA	2	8	103716	103723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017130	GGTA	2	8	104324	104331	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017130	AGAT	2	8	104527	104534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017130	TTCT	2	8	104859	104866	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017130	TATT	2	8	105407	105414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017130	CTTG	2	8	105438	105445	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017130	GTGA	2	8	107327	107334	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017130	CAAT	2	8	111063	111070	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017130	GTGC	2	8	126492	126499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017130	TGGA	2	8	128460	128467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017130	CTGT	2	8	129643	129650	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017130	TTGA	2	8	132039	132046	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017130	TTGA	2	8	132081	132088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017130	AGCA	2	8	135505	135512	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017130	GCCG	2	8	136614	136621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017130	GGCG	2	8	138663	138670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017130	ACGA	2	8	139650	139657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017130	CTGT	2	8	140745	140752	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017130	GAAC	2	8	144030	144037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017130	ACAG	2	8	145956	145963	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017130	GCAG	2	8	146641	146648	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017130	CTGT	2	8	149509	149516	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017130	CTCA	2	8	152193	152200	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017130	TCAA	2	8	153616	153623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017130	CAAC	2	8	153659	153666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017130	GATA	2	8	157321	157328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017130	ACAG	2	8	161410	161417	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017130	TGCT	2	8	161735	161742	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017130	ATTC	2	8	162284	162291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017130	CTGT	2	8	164014	164021	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017130	TCGC	2	8	169155	169162	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017130	ACGC	2	8	169286	169293	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017130	TCCT	2	8	174093	174100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017130	CCAG	2	8	174617	174624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017130	TGTA	2	8	174687	174694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017130	GATA	2	8	180026	180033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017130	TGAG	2	8	180163	180170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017130	GTGA	2	8	180229	180236	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017130	ACAG	2	8	182018	182025	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017130	ACAG	2	8	183699	183706	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017130	GCCA	2	8	188989	188996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017130	GACA	2	8	189408	189415	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017130	CGGG	2	8	189776	189783	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017130	GAAG	2	8	190323	190330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017130	TGGA	2	8	190738	190745	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017130	CAAA	2	8	191001	191008	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017130	TGAC	2	8	191135	191142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017130	TCCA	2	8	191308	191315	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.