MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-26 plasmid pAPA26-013

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017130	CG	3	6	422	427	0 %	0 %	50 %	50 %	384061217
2	NC_017130	GC	3	6	1270	1275	0 %	0 %	50 %	50 %	384061219
3	NC_017130	CG	3	6	3182	3187	0 %	0 %	50 %	50 %	384061220
4	NC_017130	TG	3	6	3307	3312	0 %	50 %	50 %	0 %	384061220
5	NC_017130	TG	3	6	3498	3503	0 %	50 %	50 %	0 %	384061220
6	NC_017130	GC	3	6	3892	3897	0 %	0 %	50 %	50 %	384061221
7	NC_017130	TA	3	6	5229	5234	50 %	50 %	0 %	0 %	384061223
8	NC_017130	CG	3	6	5244	5249	0 %	0 %	50 %	50 %	384061223
9	NC_017130	TG	3	6	6288	6293	0 %	50 %	50 %	0 %	384061223
10	NC_017130	AG	3	6	6424	6429	50 %	0 %	50 %	0 %	384061223
11	NC_017130	GA	3	6	10120	10125	50 %	0 %	50 %	0 %	384061227
12	NC_017130	CG	3	6	10597	10602	0 %	0 %	50 %	50 %	384061227
13	NC_017130	CG	3	6	12032	12037	0 %	0 %	50 %	50 %	384061227
14	NC_017130	AG	3	6	12127	12132	50 %	0 %	50 %	0 %	384061227
15	NC_017130	TC	3	6	12471	12476	0 %	50 %	0 %	50 %	384061227
16	NC_017130	CG	3	6	12670	12675	0 %	0 %	50 %	50 %	384061227
17	NC_017130	AG	3	6	12944	12949	50 %	0 %	50 %	0 %	384061227
18	NC_017130	GC	3	6	14882	14887	0 %	0 %	50 %	50 %	384061228
19	NC_017130	CG	3	6	15707	15712	0 %	0 %	50 %	50 %	384061229
20	NC_017130	AC	3	6	16953	16958	50 %	0 %	0 %	50 %	384061230
21	NC_017130	CG	3	6	19083	19088	0 %	0 %	50 %	50 %	384061232
22	NC_017130	GC	3	6	19496	19501	0 %	0 %	50 %	50 %	384061232
23	NC_017130	AG	4	8	20185	20192	50 %	0 %	50 %	0 %	384061233
24	NC_017130	TC	3	6	20250	20255	0 %	50 %	0 %	50 %	384061233
25	NC_017130	AC	3	6	20415	20420	50 %	0 %	0 %	50 %	384061233
26	NC_017130	GC	3	6	20826	20831	0 %	0 %	50 %	50 %	384061234
27	NC_017130	TC	3	6	21883	21888	0 %	50 %	0 %	50 %	384061236
28	NC_017130	GA	4	8	21962	21969	50 %	0 %	50 %	0 %	384061236
29	NC_017130	CT	4	8	23716	23723	0 %	50 %	0 %	50 %	384061237
30	NC_017130	GC	3	6	23867	23872	0 %	0 %	50 %	50 %	384061237
31	NC_017130	GT	3	6	26513	26518	0 %	50 %	50 %	0 %	384061240
32	NC_017130	AG	3	6	26755	26760	50 %	0 %	50 %	0 %	384061240
33	NC_017130	CT	3	6	27592	27597	0 %	50 %	0 %	50 %	384061241
34	NC_017130	GA	3	6	27619	27624	50 %	0 %	50 %	0 %	384061241
35	NC_017130	GC	3	6	29123	29128	0 %	0 %	50 %	50 %	384061242
36	NC_017130	CA	3	6	30932	30937	50 %	0 %	0 %	50 %	384061244
37	NC_017130	AG	3	6	31183	31188	50 %	0 %	50 %	0 %	384061244
38	NC_017130	AC	3	6	32010	32015	50 %	0 %	0 %	50 %	384061245
39	NC_017130	AG	3	6	34624	34629	50 %	0 %	50 %	0 %	384061248
40	NC_017130	GC	3	6	34704	34709	0 %	0 %	50 %	50 %	384061248
41	NC_017130	AC	3	6	34727	34732	50 %	0 %	0 %	50 %	384061248
42	NC_017130	CG	3	6	34905	34910	0 %	0 %	50 %	50 %	384061248
43	NC_017130	CG	3	6	35757	35762	0 %	0 %	50 %	50 %	384061248
44	NC_017130	GT	3	6	35765	35770	0 %	50 %	50 %	0 %	384061248
45	NC_017130	CA	3	6	36297	36302	50 %	0 %	0 %	50 %	384061248
46	NC_017130	CA	3	6	37930	37935	50 %	0 %	0 %	50 %	384061249
47	NC_017130	CA	3	6	38251	38256	50 %	0 %	0 %	50 %	384061250
48	NC_017130	GC	3	6	41097	41102	0 %	0 %	50 %	50 %	384061254
49	NC_017130	GC	3	6	42766	42771	0 %	0 %	50 %	50 %	384061255
50	NC_017130	AC	3	6	45115	45120	50 %	0 %	0 %	50 %	384061257
51	NC_017130	GC	3	6	46158	46163	0 %	0 %	50 %	50 %	384061258
52	NC_017130	CA	3	6	47080	47085	50 %	0 %	0 %	50 %	384061259
53	NC_017130	CG	3	6	47620	47625	0 %	0 %	50 %	50 %	384061259
54	NC_017130	GT	3	6	48298	48303	0 %	50 %	50 %	0 %	384061260
55	NC_017130	TG	3	6	48611	48616	0 %	50 %	50 %	0 %	384061261
56	NC_017130	CT	3	6	48749	48754	0 %	50 %	0 %	50 %	384061261
57	NC_017130	AG	3	6	49431	49436	50 %	0 %	50 %	0 %	384061262
58	NC_017130	AC	3	6	50122	50127	50 %	0 %	0 %	50 %	384061262
59	NC_017130	GT	3	6	51047	51052	0 %	50 %	50 %	0 %	384061263
60	NC_017130	AG	3	6	53875	53880	50 %	0 %	50 %	0 %	384061265
61	NC_017130	CG	3	6	55360	55365	0 %	0 %	50 %	50 %	384061266
62	NC_017130	CG	3	6	55698	55703	0 %	0 %	50 %	50 %	384061266
63	NC_017130	CG	3	6	56441	56446	0 %	0 %	50 %	50 %	384061266
64	NC_017130	CA	3	6	59039	59044	50 %	0 %	0 %	50 %	384061268
65	NC_017130	GC	3	6	59610	59615	0 %	0 %	50 %	50 %	384061268
66	NC_017130	CT	3	6	59781	59786	0 %	50 %	0 %	50 %	384061268
67	NC_017130	TC	3	6	60073	60078	0 %	50 %	0 %	50 %	384061268
68	NC_017130	CG	3	6	60520	60525	0 %	0 %	50 %	50 %	384061269
69	NC_017130	GC	3	6	61352	61357	0 %	0 %	50 %	50 %	384061270
70	NC_017130	CA	3	6	61383	61388	50 %	0 %	0 %	50 %	384061270
71	NC_017130	GC	3	6	61407	61412	0 %	0 %	50 %	50 %	384061270
72	NC_017130	CT	4	8	61433	61440	0 %	50 %	0 %	50 %	384061270
73	NC_017130	AC	3	6	62695	62700	50 %	0 %	0 %	50 %	384061271
74	NC_017130	AC	3	6	63390	63395	50 %	0 %	0 %	50 %	384061271
75	NC_017130	CG	3	6	64084	64089	0 %	0 %	50 %	50 %	384061272
76	NC_017130	TC	3	6	65936	65941	0 %	50 %	0 %	50 %	384061273
77	NC_017130	CA	3	6	66898	66903	50 %	0 %	0 %	50 %	384061274
78	NC_017130	AG	3	6	67176	67181	50 %	0 %	50 %	0 %	384061274
79	NC_017130	AT	3	6	67932	67937	50 %	50 %	0 %	0 %	384061275
80	NC_017130	CT	3	6	68005	68010	0 %	50 %	0 %	50 %	384061275
81	NC_017130	TC	3	6	68722	68727	0 %	50 %	0 %	50 %	384061275
82	NC_017130	TA	3	6	69465	69470	50 %	50 %	0 %	0 %	384061275
83	NC_017130	AG	3	6	70447	70452	50 %	0 %	50 %	0 %	384061276
84	NC_017130	GC	3	6	70558	70563	0 %	0 %	50 %	50 %	384061276
85	NC_017130	GC	3	6	71143	71148	0 %	0 %	50 %	50 %	384061276
86	NC_017130	TG	3	6	71499	71504	0 %	50 %	50 %	0 %	384061277
87	NC_017130	GA	3	6	71643	71648	50 %	0 %	50 %	0 %	384061277
88	NC_017130	GC	3	6	72795	72800	0 %	0 %	50 %	50 %	384061279
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90	NC_017130	TC	3	6	74311	74316	0 %	50 %	0 %	50 %	384061280
91	NC_017130	CG	3	6	75652	75657	0 %	0 %	50 %	50 %	384061281
92	NC_017130	CG	4	8	79810	79817	0 %	0 %	50 %	50 %	384061283
93	NC_017130	GA	3	6	80183	80188	50 %	0 %	50 %	0 %	384061283
94	NC_017130	GC	3	6	80425	80430	0 %	0 %	50 %	50 %	384061283
95	NC_017130	CA	3	6	82586	82591	50 %	0 %	0 %	50 %	384061285
96	NC_017130	TG	3	6	82954	82959	0 %	50 %	50 %	0 %	384061286
97	NC_017130	CA	3	6	85199	85204	50 %	0 %	0 %	50 %	384061288
98	NC_017130	CG	3	6	89042	89047	0 %	0 %	50 %	50 %	384061291
99	NC_017130	GC	3	6	89455	89460	0 %	0 %	50 %	50 %	384061291
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102	NC_017130	GC	3	6	95614	95619	0 %	0 %	50 %	50 %	384061298
103	NC_017130	GA	3	6	96142	96147	50 %	0 %	50 %	0 %	384061299
104	NC_017130	GA	3	6	96472	96477	50 %	0 %	50 %	0 %	384061299
105	NC_017130	TG	3	6	96641	96646	0 %	50 %	50 %	0 %	384061299
106	NC_017130	AT	3	6	97233	97238	50 %	50 %	0 %	0 %	384061299
107	NC_017130	GC	3	6	97923	97928	0 %	0 %	50 %	50 %	384061300
108	NC_017130	CT	3	6	98109	98114	0 %	50 %	0 %	50 %	384061300
109	NC_017130	GA	3	6	98137	98142	50 %	0 %	50 %	0 %	384061301
110	NC_017130	TG	3	6	98182	98187	0 %	50 %	50 %	0 %	384061301
111	NC_017130	CT	3	6	99077	99082	0 %	50 %	0 %	50 %	384061301
112	NC_017130	GC	3	6	100681	100686	0 %	0 %	50 %	50 %	384061302
113	NC_017130	GC	3	6	101353	101358	0 %	0 %	50 %	50 %	384061302
114	NC_017130	GC	3	6	101806	101811	0 %	0 %	50 %	50 %	384061302
115	NC_017130	TG	3	6	102890	102895	0 %	50 %	50 %	0 %	384061304
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118	NC_017130	CT	3	6	106702	106707	0 %	50 %	0 %	50 %	384061308
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123	NC_017130	GC	3	6	110267	110272	0 %	0 %	50 %	50 %	384061312
124	NC_017130	CA	3	6	110345	110350	50 %	0 %	0 %	50 %	384061312
125	NC_017130	TC	3	6	110550	110555	0 %	50 %	0 %	50 %	384061313
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127	NC_017130	AC	3	6	113934	113939	50 %	0 %	0 %	50 %	384061317
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129	NC_017130	GA	3	6	115766	115771	50 %	0 %	50 %	0 %	384061318
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.