MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-22 plasmid pAPA22-030

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017127	CTTTC	2	10	1960	1969	0 %	60 %	0 %	40 %	384055645
2	NC_017127	TGGGG	2	10	3671	3680	0 %	20 %	80 %	0 %	384055648
3	NC_017127	ATCAC	2	10	3700	3709	40 %	20 %	0 %	40 %	384055648
4	NC_017127	CTGTT	2	10	4708	4717	0 %	60 %	20 %	20 %	384055649
5	NC_017127	CCAGA	2	10	5319	5328	40 %	0 %	20 %	40 %	384055649
6	NC_017127	GCCAC	2	10	8216	8225	20 %	0 %	20 %	60 %	384055654
7	NC_017127	GCTGG	2	10	8725	8734	0 %	20 %	60 %	20 %	384055654
8	NC_017127	TGATC	2	10	9254	9263	20 %	40 %	20 %	20 %	384055656
9	NC_017127	CCGAT	2	10	11122	11131	20 %	20 %	20 %	40 %	384055658
10	NC_017127	ATCTC	2	10	13085	13094	20 %	40 %	0 %	40 %	384055660
11	NC_017127	CGGGT	2	10	21937	21946	0 %	20 %	60 %	20 %	384055675
12	NC_017127	TGGAC	2	10	22872	22881	20 %	20 %	40 %	20 %	384055675
13	NC_017127	GGACA	2	10	24761	24770	40 %	0 %	40 %	20 %	384055679
14	NC_017127	GCTGG	2	10	30942	30951	0 %	20 %	60 %	20 %	384055686
15	NC_017127	ACCAA	2	10	31340	31349	60 %	0 %	0 %	40 %	384055688
16	NC_017127	GATCC	2	10	32308	32317	20 %	20 %	20 %	40 %	384055688
17	NC_017127	ACAGC	2	10	33964	33973	40 %	0 %	20 %	40 %	384055689
18	NC_017127	GACTG	2	10	38987	38996	20 %	20 %	40 %	20 %	384055692
19	NC_017127	GGACA	2	10	41831	41840	40 %	0 %	40 %	20 %	384055697
20	NC_017127	TGGGG	2	10	43453	43462	0 %	20 %	80 %	0 %	384055698
21	NC_017127	ATCAC	2	10	43482	43491	40 %	20 %	0 %	40 %	384055698
22	NC_017127	CTGTT	2	10	44490	44499	0 %	60 %	20 %	20 %	384055699
23	NC_017127	CCAGA	2	10	45101	45110	40 %	0 %	20 %	40 %	384055699
24	NC_017127	GTAAG	2	10	45946	45955	40 %	20 %	40 %	0 %	384055699
25	NC_017127	CCAGC	2	10	46582	46591	20 %	0 %	20 %	60 %	384055701

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.