MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-22 plasmid pAPA22-020

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017126	CATCCA	2	12	67	78	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384055467
2	NC_017126	AGATCA	2	12	4106	4117	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384055475
3	NC_017126	GCCTTG	2	12	6177	6188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384055477
4	NC_017126	GATGCC	2	12	8361	8372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384055479
5	NC_017126	CATCCA	2	12	11568	11579	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384055481
6	NC_017126	TCACCA	2	12	27401	27412	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384055495
7	NC_017126	CATCTG	2	12	31441	31452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384055499
8	NC_017126	CAATGC	2	12	33604	33615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384055500
9	NC_017126	AGATGA	2	12	37376	37387	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384055504
10	NC_017126	TGCCAC	2	12	38748	38759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384055505
11	NC_017126	CTGCGG	2	12	43815	43826	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384055508
12	NC_017126	GAAGAT	2	12	44917	44928	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384055509
13	NC_017126	TGTACG	2	12	46395	46406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384055511
14	NC_017126	GGCATC	2	12	47605	47616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384055512
15	NC_017126	CCATGA	2	12	50738	50749	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384055515
16	NC_017126	TATCGC	2	12	52583	52594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384055517
17	NC_017126	TGCCCG	2	12	61100	61111	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384055526
18	NC_017126	GCGATG	2	12	74903	74914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384055541
19	NC_017126	GCTGAT	2	12	80495	80506	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384055548
20	NC_017126	AGTTCC	2	12	82425	82436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384055549
21	NC_017126	GGATGG	2	12	84327	84338	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384055552
22	NC_017126	TGGATG	2	12	86497	86508	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384055555
23	NC_017126	CATCCA	2	12	89849	89860	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384055558
24	NC_017126	TCAAGG	2	12	93859	93870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384055561
25	NC_017126	TGCAGG	2	12	94063	94074	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384055561
26	NC_017126	AGCCTG	2	12	103742	103753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384055572
27	NC_017126	CATCCA	2	12	106355	106366	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384055575
28	NC_017126	CATCCA	2	12	113515	113526	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384055582
29	NC_017126	TGCGCC	2	12	116503	116514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384055585
30	NC_017126	GCAAAG	2	12	116546	116557	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384055585
31	NC_017126	AGTTCC	2	12	117289	117300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384055586
32	NC_017126	GTGATT	2	12	120140	120151	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384055591
33	NC_017126	CGTCAG	2	12	128127	128138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384055597
34	NC_017126	GGACAT	2	12	137954	137965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384055604
35	NC_017126	TTCCAG	2	12	140624	140635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384055606
36	NC_017126	TCTCGG	2	12	141094	141105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384055606
37	NC_017126	CCTTTG	2	12	141243	141254	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384055606
38	NC_017126	CGCCGT	2	12	147423	147434	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384055610
39	NC_017126	TCTTCA	2	12	147517	147528	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384055610
40	NC_017126	TGGATG	2	12	156164	156175	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384055621
41	NC_017126	GGCATC	2	12	158012	158023	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384055622
42	NC_017126	GGATGG	2	12	160850	160861	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384055625
43	NC_017126	TTCGCC	2	12	161895	161906	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384055627
44	NC_017126	GACATG	2	12	168506	168517	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384055629
45	NC_017126	GATGCC	2	12	175245	175256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384055634
46	NC_017126	AAACGT	2	12	176890	176901	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384055635
47	NC_017126	GATGCC	2	12	178197	178208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384055637

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.