MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-22 plasmid pAPA22-020

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017126	TGTCC	2	10	886	895	0 %	40 %	20 %	40 %	384055469
2	NC_017126	CCAAT	2	10	4003	4012	40 %	20 %	0 %	40 %	384055475
3	NC_017126	GCGGA	2	10	4420	4429	20 %	0 %	60 %	20 %	384055476
4	NC_017126	TGAGA	2	10	5929	5938	40 %	20 %	40 %	0 %	384055477
5	NC_017126	GGCAC	2	10	8920	8929	20 %	0 %	40 %	40 %	384055479
6	NC_017126	CACCC	2	10	9786	9795	20 %	0 %	0 %	80 %	384055480
7	NC_017126	TGATA	2	10	9944	9953	40 %	40 %	20 %	0 %	384055480
8	NC_017126	GGACA	2	10	10765	10774	40 %	0 %	40 %	20 %	384055481
9	NC_017126	TTTCT	2	10	12097	12106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017126	AAAAG	2	10	13311	13320	80 %	0 %	20 %	0 %	384055483
11	NC_017126	TTTTA	2	10	13991	14000	20 %	80 %	0 %	0 %	384055484
12	NC_017126	GGAAA	2	10	15512	15521	60 %	0 %	40 %	0 %	384055485
13	NC_017126	CAATG	2	10	17635	17644	40 %	20 %	20 %	20 %	384055486
14	NC_017126	CCTGC	2	10	19626	19635	0 %	20 %	20 %	60 %	384055488
15	NC_017126	CAGCA	2	10	20035	20044	40 %	0 %	20 %	40 %	384055488
16	NC_017126	ATAGG	2	10	20290	20299	40 %	20 %	40 %	0 %	384055488
17	NC_017126	CATGC	2	10	21389	21398	20 %	20 %	20 %	40 %	384055489
18	NC_017126	CACAC	2	10	21974	21983	40 %	0 %	0 %	60 %	384055490
19	NC_017126	CCAGC	2	10	23410	23419	20 %	0 %	20 %	60 %	384055492
20	NC_017126	GTGGC	2	10	23919	23928	0 %	20 %	60 %	20 %	384055492
21	NC_017126	AAGGC	2	10	27123	27132	40 %	0 %	40 %	20 %	384055495
22	NC_017126	CATTC	2	10	27215	27224	20 %	40 %	0 %	40 %	384055495
23	NC_017126	GGCCC	2	10	28995	29004	0 %	0 %	40 %	60 %	384055495
24	NC_017126	AGGAT	2	10	30340	30349	40 %	20 %	40 %	0 %	384055498
25	NC_017126	TGTGG	2	10	33958	33967	0 %	40 %	60 %	0 %	384055501
26	NC_017126	GGAAA	2	10	34169	34178	60 %	0 %	40 %	0 %	384055501
27	NC_017126	GAAAA	2	10	35455	35464	80 %	0 %	20 %	0 %	384055501
28	NC_017126	GGAAG	2	10	35496	35505	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017126	ACGAT	2	10	36891	36900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017126	TAAAA	2	10	37109	37118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017126	CTGAT	2	10	39730	39739	20 %	40 %	20 %	20 %	384055506
32	NC_017126	AGGCA	2	10	40730	40739	40 %	0 %	40 %	20 %	384055507
33	NC_017126	GTTGG	2	10	43343	43352	0 %	40 %	60 %	0 %	384055508
34	NC_017126	GCCAT	2	10	43394	43403	20 %	20 %	20 %	40 %	384055508
35	NC_017126	ACCAT	2	10	43592	43601	40 %	20 %	0 %	40 %	384055508
36	NC_017126	CCCTG	2	10	45133	45142	0 %	20 %	20 %	60 %	384055509
37	NC_017126	AAATC	2	10	49246	49255	60 %	20 %	0 %	20 %	384055514
38	NC_017126	TGCGC	2	10	50463	50472	0 %	20 %	40 %	40 %	384055515
39	NC_017126	AGGCA	2	10	51467	51476	40 %	0 %	40 %	20 %	384055516
40	NC_017126	ACGAC	2	10	53050	53059	40 %	0 %	20 %	40 %	384055518
41	NC_017126	CGGGT	2	10	55158	55167	0 %	20 %	60 %	20 %	384055521
42	NC_017126	TGCCG	2	10	55770	55779	0 %	20 %	40 %	40 %	384055522
43	NC_017126	GGTCG	2	10	55882	55891	0 %	20 %	60 %	20 %	384055522
44	NC_017126	GCGCC	2	10	57008	57017	0 %	0 %	40 %	60 %	384055523
45	NC_017126	CAGAC	2	10	58278	58287	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017126	CCATC	2	10	58345	58354	20 %	20 %	0 %	60 %	384055525
47	NC_017126	GCGTT	2	10	58683	58692	0 %	40 %	40 %	20 %	384055525
48	NC_017126	GCAGG	2	10	60057	60066	20 %	0 %	60 %	20 %	384055526
49	NC_017126	CCGTC	2	10	60828	60837	0 %	20 %	20 %	60 %	384055526
50	NC_017126	ATTTT	2	10	63376	63385	20 %	80 %	0 %	0 %	384055527
51	NC_017126	GCTGG	2	10	65314	65323	0 %	20 %	60 %	20 %	384055529
52	NC_017126	GTCCA	2	10	65541	65550	20 %	20 %	20 %	40 %	384055529
53	NC_017126	GCCAC	2	10	66228	66237	20 %	0 %	20 %	60 %	384055530
54	NC_017126	GCTGG	2	10	66737	66746	0 %	20 %	60 %	20 %	384055530
55	NC_017126	GGCGC	2	10	68688	68697	0 %	0 %	60 %	40 %	384055534
56	NC_017126	CATGA	2	10	71467	71476	40 %	20 %	20 %	20 %	384055538
57	NC_017126	GCATT	2	10	71970	71979	20 %	40 %	20 %	20 %	384055538
58	NC_017126	GACTG	2	10	72835	72844	20 %	20 %	40 %	20 %	384055539
59	NC_017126	GTCCT	2	10	74718	74727	0 %	40 %	20 %	40 %	384055541
60	NC_017126	TGATC	2	10	75423	75432	20 %	40 %	20 %	20 %	384055542
61	NC_017126	TGCTC	2	10	76204	76213	0 %	40 %	20 %	40 %	384055543
62	NC_017126	TATTG	2	10	76431	76440	20 %	60 %	20 %	0 %	384055543
63	NC_017126	AGCTC	2	10	77560	77569	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017126	CCAGC	2	10	79259	79268	20 %	0 %	20 %	60 %	384055547
65	NC_017126	GAGAT	2	10	80260	80269	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017126	TTTCC	2	10	80722	80731	0 %	60 %	0 %	40 %	384055548
67	NC_017126	GCTGG	2	10	82687	82696	0 %	20 %	60 %	20 %	384055549
68	NC_017126	GCCCG	2	10	83988	83997	0 %	0 %	40 %	60 %	384055552
69	NC_017126	TGAGG	2	10	85064	85073	20 %	20 %	60 %	0 %	384055553
70	NC_017126	AGAAA	2	10	85969	85978	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017126	TGTCC	2	10	87302	87311	0 %	40 %	20 %	40 %	384055555
72	NC_017126	GGACA	2	10	89046	89055	40 %	0 %	40 %	20 %	384055558
73	NC_017126	TTTCT	2	10	90379	90388	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017126	AGCGG	2	10	90658	90667	20 %	0 %	60 %	20 %	384055559
75	NC_017126	TCGCC	2	10	90767	90776	0 %	20 %	20 %	60 %	384055559
76	NC_017126	GCATG	2	10	90953	90962	20 %	20 %	40 %	20 %	384055559
77	NC_017126	ATTCC	2	10	91458	91467	20 %	40 %	0 %	40 %	384055559
78	NC_017126	AGCGA	2	10	93876	93885	40 %	0 %	40 %	20 %	384055561
79	NC_017126	CAAAG	2	10	96047	96056	60 %	0 %	20 %	20 %	384055564
80	NC_017126	CAGCC	2	10	96867	96876	20 %	0 %	20 %	60 %	384055565
81	NC_017126	AGACA	2	10	98248	98257	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017126	GTTGG	2	10	100432	100441	0 %	40 %	60 %	0 %	384055569
83	NC_017126	TTTTC	2	10	101545	101554	0 %	80 %	0 %	20 %	384055569
84	NC_017126	GTGCC	2	10	102071	102080	0 %	20 %	40 %	40 %	384055569
85	NC_017126	CCAGC	2	10	102558	102567	20 %	0 %	20 %	60 %	384055571
86	NC_017126	GTGGC	2	10	103067	103076	0 %	20 %	60 %	20 %	384055571
87	NC_017126	CACTG	2	10	103983	103992	20 %	20 %	20 %	40 %	384055573
88	NC_017126	TGGAC	2	10	104346	104355	20 %	20 %	40 %	20 %	384055573
89	NC_017126	GGACA	2	10	105552	105561	40 %	0 %	40 %	20 %	384055575
90	NC_017126	TGCGC	2	10	110147	110156	0 %	20 %	40 %	40 %	384055580
91	NC_017126	GGACA	2	10	112712	112721	40 %	0 %	40 %	20 %	384055582
92	NC_017126	GATAA	2	10	114225	114234	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017126	CCATG	2	10	114613	114622	20 %	20 %	20 %	40 %	384055583
94	NC_017126	GATAC	2	10	116689	116698	40 %	20 %	20 %	20 %	384055585
95	NC_017126	GCTGG	2	10	117551	117560	0 %	20 %	60 %	20 %	384055586
96	NC_017126	CTGAC	2	10	118186	118195	20 %	20 %	20 %	40 %	384055589
97	NC_017126	TTTTC	2	10	118980	118989	0 %	80 %	0 %	20 %	384055590
98	NC_017126	CGTTT	2	10	119631	119640	0 %	60 %	20 %	20 %	384055591
99	NC_017126	CACTG	2	10	121386	121395	20 %	20 %	20 %	40 %	384055591
100	NC_017126	TTATT	2	10	126656	126665	20 %	80 %	0 %	0 %	384055596
101	NC_017126	CGTTC	2	10	127203	127212	0 %	40 %	20 %	40 %	384055597
102	NC_017126	CGGTC	2	10	128949	128958	0 %	20 %	40 %	40 %	384055598
103	NC_017126	GAAGC	2	10	132093	132102	40 %	0 %	40 %	20 %	384055599
104	NC_017126	TCAAG	2	10	133131	133140	40 %	20 %	20 %	20 %	384055600
105	NC_017126	CAGGA	2	10	134251	134260	40 %	0 %	40 %	20 %	384055601
106	NC_017126	CGGAC	2	10	135105	135114	20 %	0 %	40 %	40 %	384055601
107	NC_017126	GAGCA	2	10	137241	137250	40 %	0 %	40 %	20 %	384055603
108	NC_017126	GACAG	2	10	138415	138424	40 %	0 %	40 %	20 %	384055605
109	NC_017126	GCTGT	2	10	142569	142578	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017126	AGCGG	2	10	142650	142659	20 %	0 %	60 %	20 %	384055607
111	NC_017126	CGCGA	2	10	146926	146935	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017126	AGGTC	2	10	147737	147746	20 %	20 %	40 %	20 %	384055611
113	NC_017126	CATCG	2	10	149288	149297	20 %	20 %	20 %	40 %	384055612
114	NC_017126	GGCAG	2	10	149790	149799	20 %	0 %	60 %	20 %	384055613
115	NC_017126	CGGCA	2	10	150231	150240	20 %	0 %	40 %	40 %	384055613
116	NC_017126	CCTCA	2	10	152774	152783	20 %	20 %	0 %	60 %	384055616
117	NC_017126	CCGGG	2	10	153849	153858	0 %	0 %	60 %	40 %	384055617
118	NC_017126	CGTTT	2	10	154790	154799	0 %	60 %	20 %	20 %	384055619
119	NC_017126	AGAAA	2	10	155636	155645	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017126	TGTCC	2	10	156969	156978	0 %	40 %	20 %	40 %	384055621
121	NC_017126	GCCAT	2	10	159119	159128	20 %	20 %	20 %	40 %	384055623
122	NC_017126	TCTTT	2	10	159638	159647	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017126	TGAAT	2	10	159976	159985	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017126	AGCTG	2	10	160166	160175	20 %	20 %	40 %	20 %	384055624
125	NC_017126	CGTTC	2	10	162714	162723	0 %	40 %	20 %	40 %	384055628
126	NC_017126	CCCTG	2	10	166572	166581	0 %	20 %	20 %	60 %	384055629
127	NC_017126	CTGCT	2	10	168244	168253	0 %	40 %	20 %	40 %	384055629
128	NC_017126	GAGGG	2	10	168396	168405	20 %	0 %	80 %	0 %	384055629
129	NC_017126	GGAGC	2	10	168700	168709	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017126	AGCAA	2	10	169606	169615	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017126	ATTAA	2	10	171299	171308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017126	TTGAA	2	10	172596	172605	40 %	40 %	20 %	0 %	384055632
133	NC_017126	GCGTT	2	10	172737	172746	0 %	40 %	40 %	20 %	384055632
134	NC_017126	GGGCA	2	10	174165	174174	20 %	0 %	60 %	20 %	384055633
135	NC_017126	GGCAC	2	10	175804	175813	20 %	0 %	40 %	40 %	384055634

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.