MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-22

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017125	TATTTT	2	12	157463	157474	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017125	TTTTGC	2	12	163909	163920	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017125	TGTGTA	2	12	185229	185240	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017125	TATTTA	2	12	185346	185357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017125	GTCGGA	2	12	196772	196783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017125	ACCTTT	2	12	230042	230053	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017125	CGACCG	2	12	278785	278796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017125	TGCCAC	2	12	291046	291057	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017125	GGGCGG	2	12	309571	309582	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017125	AGAAAA	2	12	318237	318248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017125	TTCTGG	2	12	349051	349062	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017125	GGCGCG	2	12	419525	419536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017125	TATGCA	2	12	473968	473979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017125	AAACCA	2	12	521863	521874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017125	AAAATT	2	12	530972	530983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017125	TAAAAA	2	12	533157	533168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017125	TGCCAA	2	12	645192	645203	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017125	GTGCGT	2	12	723388	723399	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017125	AAAAGG	2	12	753042	753053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017125	TGAACG	2	12	766363	766374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017125	TAAAGC	2	12	774378	774389	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017125	GCGCAA	2	12	791217	791228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017125	TGCGCG	2	12	866628	866639	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017125	GAAGGT	2	12	867500	867511	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017125	AGACGG	2	12	963622	963633	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017125	CCTTTC	2	12	1022636	1022647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017125	GCCGGG	2	12	1042778	1042789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017125	TTTTCT	2	12	1055346	1055357	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017125	GGGGAT	2	12	1089924	1089935	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017125	TGTTGG	2	12	1090502	1090513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017125	GGGCAG	2	12	1192174	1192185	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017125	ACGGAA	2	12	1220214	1220225	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017125	GGAACG	2	12	1244204	1244215	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017125	TATTCG	2	12	1318954	1318965	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017125	AAACAT	2	12	1335039	1335050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017125	TTCAGG	2	12	1335112	1335123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017125	CAAAAA	2	12	1348820	1348831	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017125	CAAAAA	2	12	1369744	1369755	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017125	TTGGGG	2	12	1370278	1370289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017125	TTTTTG	2	12	1463492	1463503	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017125	CTCGCC	2	12	1539154	1539165	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017125	TTTGAT	2	12	1729472	1729483	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017125	CTCGCC	2	12	1732237	1732248	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017125	CCGAAA	2	12	1804488	1804499	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017125	TTTTTA	2	12	1836341	1836352	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017125	GAGCCC	2	12	1845708	1845719	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017125	CGGTTC	2	12	1851218	1851229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017125	TATGGA	2	12	1918349	1918360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017125	CGATCC	2	12	1920793	1920804	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017125	GATGCC	2	12	1920842	1920853	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017125	TGAAGA	2	12	1923522	1923533	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017125	AGCTAT	2	12	1932647	1932658	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017125	GTTTTT	2	12	1985106	1985117	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017125	ATCACG	2	12	2019151	2019162	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017125	TATTTT	2	12	2029117	2029128	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017125	TGATCA	2	12	2033234	2033245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017125	CTACGC	2	12	2097255	2097266	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017125	AACCCT	2	12	2226294	2226305	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017125	AATATA	2	12	2256244	2256255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017125	CTCGCC	2	12	2286052	2286063	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017125	TGCGGT	2	12	2311803	2311814	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017125	GAAAAA	2	12	2352494	2352505	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017125	ATCCTT	2	12	2412986	2412997	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017125	TCGTTA	2	12	2417823	2417834	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017125	AAAATA	2	12	2428669	2428680	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017125	AATTGG	2	12	2480796	2480807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017125	GCGCCA	2	12	2504374	2504385	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017125	CAGAAA	2	12	2540775	2540786	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017125	AGCTTC	2	12	2589066	2589077	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017125	ACGTCA	2	12	2607963	2607974	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017125	CTCGCC	2	12	2610481	2610492	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017125	ACCTGC	2	12	2645636	2645647	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017125	CCGGAT	2	12	2677407	2677418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017125	TCGCTG	2	12	2700836	2700847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017125	GCTTGC	2	12	2700982	2700993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017125	CTCGCC	2	12	2765526	2765537	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017125	TCTTAC	2	12	2786425	2786436	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017125	ATTTTA	2	12	2788539	2788550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017125	CTTTTT	2	12	2805529	2805540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017125	GCTTCT	2	12	2843570	2843581	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017125	TCCTTT	2	12	2868366	2868377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.