MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-07 plasmid pAPA07-020

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017122	CATCCA	2	12	67	78	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384052413
2	NC_017122	AGATCA	2	12	4106	4117	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384052421
3	NC_017122	GCCTTG	2	12	6177	6188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384052423
4	NC_017122	GATGCC	2	12	8361	8372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384052425
5	NC_017122	CATCCA	2	12	11568	11579	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384052427
6	NC_017122	TCACCA	2	12	27401	27412	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384052441
7	NC_017122	CATCTG	2	12	31441	31452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384052445
8	NC_017122	CAATGC	2	12	33604	33615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384052446
9	NC_017122	AGATGA	2	12	37376	37387	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384052450
10	NC_017122	TGCCAC	2	12	38748	38759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384052451
11	NC_017122	CTGCGG	2	12	43815	43826	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384052454
12	NC_017122	GAAGAT	2	12	44917	44928	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384052455
13	NC_017122	TGTACG	2	12	46395	46406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384052457
14	NC_017122	GGCATC	2	12	47605	47616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384052458
15	NC_017122	CCATGA	2	12	50738	50749	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384052461
16	NC_017122	TATCGC	2	12	52583	52594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384052463
17	NC_017122	TGCCCG	2	12	61100	61111	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384052472
18	NC_017122	GCGATG	2	12	74903	74914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384052487
19	NC_017122	GCTGAT	2	12	80495	80506	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384052494
20	NC_017122	AGTTCC	2	12	82425	82436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384052495
21	NC_017122	GGATGG	2	12	84327	84338	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384052498
22	NC_017122	TGGATG	2	12	86497	86508	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384052501
23	NC_017122	CATCCA	2	12	89849	89860	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384052504
24	NC_017122	TCAAGG	2	12	93859	93870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384052507
25	NC_017122	TGCAGG	2	12	94063	94074	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384052507
26	NC_017122	AGCCTG	2	12	103742	103753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384052518
27	NC_017122	CATCCA	2	12	106355	106366	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384052521
28	NC_017122	CATCCA	2	12	113515	113526	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384052528
29	NC_017122	TGCGCC	2	12	116503	116514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384052531
30	NC_017122	GCAAAG	2	12	116546	116557	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384052531
31	NC_017122	AGTTCC	2	12	117289	117300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384052532
32	NC_017122	GTGATT	2	12	120140	120151	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384052537
33	NC_017122	CGTCAG	2	12	128127	128138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384052543
34	NC_017122	GGACAT	2	12	137954	137965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384052550
35	NC_017122	TTCCAG	2	12	140624	140635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384052552
36	NC_017122	TCTCGG	2	12	141094	141105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384052552
37	NC_017122	CCTTTG	2	12	141243	141254	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384052552
38	NC_017122	CGCCGT	2	12	147423	147434	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384052556
39	NC_017122	TCTTCA	2	12	147517	147528	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384052556
40	NC_017122	TGGATG	2	12	156164	156175	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384052567
41	NC_017122	GGCATC	2	12	158012	158023	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384052568
42	NC_017122	GGATGG	2	12	160850	160861	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384052571
43	NC_017122	TTCGCC	2	12	161895	161906	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384052573
44	NC_017122	GACATG	2	12	168506	168517	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384052575
45	NC_017122	GATGCC	2	12	175245	175256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384052580
46	NC_017122	AAACGT	2	12	176890	176901	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384052581
47	NC_017122	GATGCC	2	12	178197	178208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384052583

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.