MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-03 plasmid pAPA03-030

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017119	TTGT	2	8	685	692	0 %	75 %	25 %	0 %	384052345
2	NC_017119	AGAA	2	8	889	896	75 %	0 %	25 %	0 %	384052345
3	NC_017119	TGAA	2	8	1399	1406	50 %	25 %	25 %	0 %	384052346
4	NC_017119	GGCG	2	8	1515	1522	0 %	0 %	75 %	25 %	384052347
5	NC_017119	CGAT	2	8	1595	1602	25 %	25 %	25 %	25 %	384052347
6	NC_017119	TTGA	2	8	1848	1855	25 %	50 %	25 %	0 %	384052347
7	NC_017119	GTAA	2	8	2733	2740	50 %	25 %	25 %	0 %	384052349
8	NC_017119	TCTG	2	8	3038	3045	0 %	50 %	25 %	25 %	384052349
9	NC_017119	CTCA	2	8	3269	3276	25 %	25 %	0 %	50 %	384052350
10	NC_017119	GATG	2	8	3378	3385	25 %	25 %	50 %	0 %	384052350
11	NC_017119	GTCC	2	8	4177	4184	0 %	25 %	25 %	50 %	384052352
12	NC_017119	GCCA	2	8	4893	4900	25 %	0 %	25 %	50 %	384052352
13	NC_017119	ACCC	2	8	4945	4952	25 %	0 %	0 %	75 %	384052352
14	NC_017119	AGAA	2	8	5068	5075	75 %	0 %	25 %	0 %	384052352
15	NC_017119	AACT	2	8	6159	6166	50 %	25 %	0 %	25 %	384052352
16	NC_017119	TGGC	2	8	6952	6959	0 %	25 %	50 %	25 %	384052354
17	NC_017119	AGCG	2	8	7805	7812	25 %	0 %	50 %	25 %	384052356
18	NC_017119	TGAC	2	8	8169	8176	25 %	25 %	25 %	25 %	384052357
19	NC_017119	TCCA	2	8	8342	8349	25 %	25 %	0 %	50 %	384052357
20	NC_017119	CTTC	2	8	8757	8764	0 %	50 %	0 %	50 %	384052358
21	NC_017119	CTGA	2	8	8839	8846	25 %	25 %	25 %	25 %	384052358
22	NC_017119	TGCT	2	8	9217	9224	0 %	50 %	25 %	25 %	384052359
23	NC_017119	TGTC	2	8	10276	10283	0 %	50 %	25 %	25 %	384052360
24	NC_017119	TGAT	2	8	10540	10547	25 %	50 %	25 %	0 %	384052361
25	NC_017119	AATC	2	8	10835	10842	50 %	25 %	0 %	25 %	384052361
26	NC_017119	CTCG	2	8	11087	11094	0 %	25 %	25 %	50 %	384052361
27	NC_017119	GATG	2	8	11472	11479	25 %	25 %	50 %	0 %	384052361
28	NC_017119	AGAA	2	8	11792	11799	75 %	0 %	25 %	0 %	384052361
29	NC_017119	CAGC	2	8	11847	11854	25 %	0 %	25 %	50 %	384052361
30	NC_017119	TCGA	2	8	12399	12406	25 %	25 %	25 %	25 %	384052362
31	NC_017119	AGCG	2	8	13231	13238	25 %	0 %	50 %	25 %	384052363
32	NC_017119	ATTG	2	8	14735	14742	25 %	50 %	25 %	0 %	384052366
33	NC_017119	CATT	2	8	15015	15022	25 %	50 %	0 %	25 %	384052366
34	NC_017119	ACTC	2	8	17141	17148	25 %	25 %	0 %	50 %	384052368
35	NC_017119	GCCG	3	12	17947	17958	0 %	0 %	50 %	50 %	384052370
36	NC_017119	CCAG	2	8	18331	18338	25 %	0 %	25 %	50 %	384052371
37	NC_017119	AGGG	2	8	19143	19150	25 %	0 %	75 %	0 %	384052374
38	NC_017119	TTGC	2	8	19234	19241	0 %	50 %	25 %	25 %	384052374
39	NC_017119	GCCT	2	8	20095	20102	0 %	25 %	25 %	50 %	384052377
40	NC_017119	TCGA	2	8	20198	20205	25 %	25 %	25 %	25 %	384052377
41	NC_017119	CCGG	2	8	20534	20541	0 %	0 %	50 %	50 %	384052378
42	NC_017119	GGAC	2	8	20880	20887	25 %	0 %	50 %	25 %	384052378
43	NC_017119	GATC	2	8	21054	21061	25 %	25 %	25 %	25 %	384052378
44	NC_017119	CCGG	2	8	21115	21122	0 %	0 %	50 %	50 %	384052378
45	NC_017119	TCGC	2	8	21439	21446	0 %	25 %	25 %	50 %	384052378
46	NC_017119	TCTG	2	8	21834	21841	0 %	50 %	25 %	25 %	384052378
47	NC_017119	CAGG	2	8	22806	22813	25 %	0 %	50 %	25 %	384052378
48	NC_017119	GCCG	2	8	23034	23041	0 %	0 %	50 %	50 %	384052378
49	NC_017119	GCGG	2	8	23226	23233	0 %	0 %	75 %	25 %	384052378
50	NC_017119	GCGG	2	8	23352	23359	0 %	0 %	75 %	25 %	384052378
51	NC_017119	GATC	2	8	23962	23969	25 %	25 %	25 %	25 %	384052380
52	NC_017119	GGGC	2	8	24179	24186	0 %	0 %	75 %	25 %	384052380
53	NC_017119	GACG	2	8	24775	24782	25 %	0 %	50 %	25 %	384052382
54	NC_017119	GCGG	2	8	25583	25590	0 %	0 %	75 %	25 %	384052382
55	NC_017119	GCCA	2	8	25718	25725	25 %	0 %	25 %	50 %	384052382
56	NC_017119	TCTG	2	8	26058	26065	0 %	50 %	25 %	25 %	384052382
57	NC_017119	CCTT	2	8	26190	26197	0 %	50 %	0 %	50 %	384052383
58	NC_017119	GAAT	2	8	26259	26266	50 %	25 %	25 %	0 %	384052383
59	NC_017119	ACTG	2	8	26316	26323	25 %	25 %	25 %	25 %	384052383
60	NC_017119	AGCA	2	8	28629	28636	50 %	0 %	25 %	25 %	384052386
61	NC_017119	GCTG	2	8	29049	29056	0 %	25 %	50 %	25 %	384052387
62	NC_017119	CCCA	2	8	29411	29418	25 %	0 %	0 %	75 %	384052388
63	NC_017119	GGCA	2	8	30017	30024	25 %	0 %	50 %	25 %	384052388
64	NC_017119	TGAC	2	8	30386	30393	25 %	25 %	25 %	25 %	384052389
65	NC_017119	TCCA	2	8	30559	30566	25 %	25 %	0 %	50 %	384052389
66	NC_017119	CTTC	2	8	30974	30981	0 %	50 %	0 %	50 %	384052390
67	NC_017119	CTGA	2	8	31056	31063	25 %	25 %	25 %	25 %	384052390
68	NC_017119	ATCA	2	8	32777	32784	50 %	25 %	0 %	25 %	384052392
69	NC_017119	CTGC	2	8	32875	32882	0 %	25 %	25 %	50 %	384052392
70	NC_017119	CCTT	2	8	33525	33532	0 %	50 %	0 %	50 %	384052392
71	NC_017119	GGAC	2	8	33727	33734	25 %	0 %	50 %	25 %	384052392
72	NC_017119	GTTC	2	8	34324	34331	0 %	50 %	25 %	25 %	384052392
73	NC_017119	CCGA	2	8	34703	34710	25 %	0 %	25 %	50 %	384052393
74	NC_017119	TTGT	2	8	35031	35038	0 %	75 %	25 %	0 %	384052393
75	NC_017119	AGGA	2	8	35054	35061	50 %	0 %	50 %	0 %	384052393
76	NC_017119	TTTC	2	8	35344	35351	0 %	75 %	0 %	25 %	384052393
77	NC_017119	CCGC	2	8	36163	36170	0 %	0 %	25 %	75 %	384052393
78	NC_017119	GCCT	2	8	36320	36327	0 %	25 %	25 %	50 %	384052393
79	NC_017119	GATG	2	8	37126	37133	25 %	25 %	50 %	0 %	384052393
80	NC_017119	TCCG	2	8	37575	37582	0 %	25 %	25 %	50 %	384052394
81	NC_017119	GATG	2	8	37855	37862	25 %	25 %	50 %	0 %	384052394
82	NC_017119	CCCG	2	8	37969	37976	0 %	0 %	25 %	75 %	384052394
83	NC_017119	ATCA	2	8	38288	38295	50 %	25 %	0 %	25 %	384052394
84	NC_017119	ATGA	2	8	39916	39923	50 %	25 %	25 %	0 %	384052396
85	NC_017119	CCAA	2	8	40274	40281	50 %	0 %	0 %	50 %	384052397
86	NC_017119	ACCG	2	8	40628	40635	25 %	0 %	25 %	50 %	384052397
87	NC_017119	CGCT	2	8	40801	40808	0 %	25 %	25 %	50 %	384052398
88	NC_017119	GACG	2	8	41845	41852	25 %	0 %	50 %	25 %	384052400
89	NC_017119	CTTC	2	8	42484	42491	0 %	50 %	0 %	50 %	384052400
90	NC_017119	CGGG	2	8	42654	42661	0 %	0 %	75 %	25 %	384052400
91	NC_017119	CTGC	2	8	42745	42752	0 %	25 %	25 %	50 %	384052400
92	NC_017119	GCCA	2	8	42788	42795	25 %	0 %	25 %	50 %	384052400
93	NC_017119	TCTG	2	8	43128	43135	0 %	50 %	25 %	25 %	384052400
94	NC_017119	AGGA	2	8	43290	43297	50 %	0 %	50 %	0 %	384052401
95	NC_017119	GTCC	2	8	43959	43966	0 %	25 %	25 %	50 %	384052402
96	NC_017119	GCCA	2	8	44675	44682	25 %	0 %	25 %	50 %	384052402
97	NC_017119	ACCC	2	8	44727	44734	25 %	0 %	0 %	75 %	384052402
98	NC_017119	AGAA	2	8	44850	44857	75 %	0 %	25 %	0 %	384052402
99	NC_017119	GAAG	2	8	46552	46559	50 %	0 %	50 %	0 %	384052403
100	NC_017119	TGGA	2	8	46967	46974	25 %	25 %	50 %	0 %	384052404
101	NC_017119	GTCA	2	8	47140	47147	25 %	25 %	25 %	25 %	384052404

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.