MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-03 plasmid pAPA03-020

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017118	CATCCA	2	12	67	78	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384052170
2	NC_017118	AGATCA	2	12	4106	4117	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384052178
3	NC_017118	GCCTTG	2	12	6177	6188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384052180
4	NC_017118	GATGCC	2	12	8361	8372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384052182
5	NC_017118	CATCCA	2	12	11568	11579	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384052184
6	NC_017118	TCACCA	2	12	27401	27412	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384052198
7	NC_017118	CATCTG	2	12	31441	31452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384052202
8	NC_017118	CAATGC	2	12	33604	33615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384052203
9	NC_017118	AGATGA	2	12	37376	37387	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384052207
10	NC_017118	TGCCAC	2	12	38748	38759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384052208
11	NC_017118	CTGCGG	2	12	43815	43826	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384052211
12	NC_017118	GAAGAT	2	12	44917	44928	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384052212
13	NC_017118	TGTACG	2	12	46395	46406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384052214
14	NC_017118	GGCATC	2	12	47605	47616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384052215
15	NC_017118	CCATGA	2	12	50738	50749	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384052218
16	NC_017118	TATCGC	2	12	52583	52594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384052220
17	NC_017118	TGCCCG	2	12	61100	61111	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384052229
18	NC_017118	GCGATG	2	12	74903	74914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384052244
19	NC_017118	GCTGAT	2	12	80495	80506	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384052251
20	NC_017118	AGTTCC	2	12	82425	82436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384052252
21	NC_017118	GGATGG	2	12	84327	84338	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384052255
22	NC_017118	TGGATG	2	12	86497	86508	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384052258
23	NC_017118	CATCCA	2	12	89849	89860	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384052261
24	NC_017118	TCAAGG	2	12	93859	93870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384052264
25	NC_017118	TGCAGG	2	12	94063	94074	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384052264
26	NC_017118	AGCCTG	2	12	103742	103753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384052275
27	NC_017118	CATCCA	2	12	106355	106366	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384052278
28	NC_017118	CATCCA	2	12	113515	113526	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384052285
29	NC_017118	TGCGCC	2	12	116503	116514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384052288
30	NC_017118	GCAAAG	2	12	116546	116557	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384052288
31	NC_017118	AGTTCC	2	12	117289	117300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384052289
32	NC_017118	GTGATT	2	12	120140	120151	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384052294
33	NC_017118	CGTCAG	2	12	128127	128138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384052300
34	NC_017118	GGACAT	2	12	137954	137965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384052307
35	NC_017118	TTCCAG	2	12	140624	140635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384052309
36	NC_017118	TCTCGG	2	12	141094	141105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384052309
37	NC_017118	CCTTTG	2	12	141243	141254	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384052309
38	NC_017118	CGCCGT	2	12	147423	147434	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384052313
39	NC_017118	TCTTCA	2	12	147517	147528	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384052313
40	NC_017118	TGGATG	2	12	156164	156175	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384052324
41	NC_017118	GGCATC	2	12	158012	158023	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384052325
42	NC_017118	GGATGG	2	12	160850	160861	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384052328
43	NC_017118	TTCGCC	2	12	161895	161906	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384052330
44	NC_017118	GACATG	2	12	168506	168517	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384052332
45	NC_017118	GATGCC	2	12	175245	175256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384052337
46	NC_017118	AAACGT	2	12	176890	176901	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384052338
47	NC_017118	GATGCC	2	12	178197	178208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384052340

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.