MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-03 plasmid pAPA03-020

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017118	TGTCC	2	10	886	895	0 %	40 %	20 %	40 %	384052172
2	NC_017118	CCAAT	2	10	4003	4012	40 %	20 %	0 %	40 %	384052178
3	NC_017118	GCGGA	2	10	4420	4429	20 %	0 %	60 %	20 %	384052179
4	NC_017118	TGAGA	2	10	5929	5938	40 %	20 %	40 %	0 %	384052180
5	NC_017118	GGCAC	2	10	8920	8929	20 %	0 %	40 %	40 %	384052182
6	NC_017118	CACCC	2	10	9786	9795	20 %	0 %	0 %	80 %	384052183
7	NC_017118	TGATA	2	10	9944	9953	40 %	40 %	20 %	0 %	384052183
8	NC_017118	GGACA	2	10	10765	10774	40 %	0 %	40 %	20 %	384052184
9	NC_017118	AAAAG	2	10	13311	13320	80 %	0 %	20 %	0 %	384052186
10	NC_017118	TTTTA	2	10	13991	14000	20 %	80 %	0 %	0 %	384052187
11	NC_017118	GGAAA	2	10	15512	15521	60 %	0 %	40 %	0 %	384052188
12	NC_017118	CAATG	2	10	17635	17644	40 %	20 %	20 %	20 %	384052189
13	NC_017118	CCTGC	2	10	19626	19635	0 %	20 %	20 %	60 %	384052191
14	NC_017118	CAGCA	2	10	20035	20044	40 %	0 %	20 %	40 %	384052191
15	NC_017118	ATAGG	2	10	20290	20299	40 %	20 %	40 %	0 %	384052191
16	NC_017118	CATGC	2	10	21389	21398	20 %	20 %	20 %	40 %	384052192
17	NC_017118	CACAC	2	10	21974	21983	40 %	0 %	0 %	60 %	384052193
18	NC_017118	CCAGC	2	10	23410	23419	20 %	0 %	20 %	60 %	384052195
19	NC_017118	GTGGC	2	10	23919	23928	0 %	20 %	60 %	20 %	384052195
20	NC_017118	AAGGC	2	10	27123	27132	40 %	0 %	40 %	20 %	384052198
21	NC_017118	CATTC	2	10	27215	27224	20 %	40 %	0 %	40 %	384052198
22	NC_017118	GGCCC	2	10	28995	29004	0 %	0 %	40 %	60 %	384052198
23	NC_017118	AGGAT	2	10	30340	30349	40 %	20 %	40 %	0 %	384052201
24	NC_017118	TGTGG	2	10	33958	33967	0 %	40 %	60 %	0 %	384052204
25	NC_017118	GGAAA	2	10	34169	34178	60 %	0 %	40 %	0 %	384052204
26	NC_017118	GAAAA	2	10	35455	35464	80 %	0 %	20 %	0 %	384052204
27	NC_017118	CTGAT	2	10	39730	39739	20 %	40 %	20 %	20 %	384052209
28	NC_017118	AGGCA	2	10	40730	40739	40 %	0 %	40 %	20 %	384052210
29	NC_017118	GTTGG	2	10	43343	43352	0 %	40 %	60 %	0 %	384052211
30	NC_017118	GCCAT	2	10	43394	43403	20 %	20 %	20 %	40 %	384052211
31	NC_017118	ACCAT	2	10	43592	43601	40 %	20 %	0 %	40 %	384052211
32	NC_017118	CCCTG	2	10	45133	45142	0 %	20 %	20 %	60 %	384052212
33	NC_017118	AAATC	2	10	49246	49255	60 %	20 %	0 %	20 %	384052217
34	NC_017118	TGCGC	2	10	50463	50472	0 %	20 %	40 %	40 %	384052218
35	NC_017118	AGGCA	2	10	51467	51476	40 %	0 %	40 %	20 %	384052219
36	NC_017118	ACGAC	2	10	53050	53059	40 %	0 %	20 %	40 %	384052221
37	NC_017118	CGGGT	2	10	55158	55167	0 %	20 %	60 %	20 %	384052224
38	NC_017118	TGCCG	2	10	55770	55779	0 %	20 %	40 %	40 %	384052225
39	NC_017118	GGTCG	2	10	55882	55891	0 %	20 %	60 %	20 %	384052225
40	NC_017118	GCGCC	2	10	57008	57017	0 %	0 %	40 %	60 %	384052226
41	NC_017118	CCATC	2	10	58345	58354	20 %	20 %	0 %	60 %	384052228
42	NC_017118	GCGTT	2	10	58683	58692	0 %	40 %	40 %	20 %	384052228
43	NC_017118	GCAGG	2	10	60057	60066	20 %	0 %	60 %	20 %	384052229
44	NC_017118	CCGTC	2	10	60828	60837	0 %	20 %	20 %	60 %	384052229
45	NC_017118	ATTTT	2	10	63376	63385	20 %	80 %	0 %	0 %	384052230
46	NC_017118	GCTGG	2	10	65314	65323	0 %	20 %	60 %	20 %	384052232
47	NC_017118	GTCCA	2	10	65541	65550	20 %	20 %	20 %	40 %	384052232
48	NC_017118	GCCAC	2	10	66228	66237	20 %	0 %	20 %	60 %	384052233
49	NC_017118	GCTGG	2	10	66737	66746	0 %	20 %	60 %	20 %	384052233
50	NC_017118	GGCGC	2	10	68688	68697	0 %	0 %	60 %	40 %	384052237
51	NC_017118	CATGA	2	10	71467	71476	40 %	20 %	20 %	20 %	384052241
52	NC_017118	GCATT	2	10	71970	71979	20 %	40 %	20 %	20 %	384052241
53	NC_017118	GACTG	2	10	72835	72844	20 %	20 %	40 %	20 %	384052242
54	NC_017118	GTCCT	2	10	74718	74727	0 %	40 %	20 %	40 %	384052244
55	NC_017118	TGATC	2	10	75423	75432	20 %	40 %	20 %	20 %	384052245
56	NC_017118	TGCTC	2	10	76204	76213	0 %	40 %	20 %	40 %	384052246
57	NC_017118	TATTG	2	10	76431	76440	20 %	60 %	20 %	0 %	384052246
58	NC_017118	CCAGC	2	10	79259	79268	20 %	0 %	20 %	60 %	384052250
59	NC_017118	TTTCC	2	10	80722	80731	0 %	60 %	0 %	40 %	384052251
60	NC_017118	GCTGG	2	10	82687	82696	0 %	20 %	60 %	20 %	384052252
61	NC_017118	GCCCG	2	10	83988	83997	0 %	0 %	40 %	60 %	384052255
62	NC_017118	TGAGG	2	10	85064	85073	20 %	20 %	60 %	0 %	384052256
63	NC_017118	TGTCC	2	10	87302	87311	0 %	40 %	20 %	40 %	384052258
64	NC_017118	GGACA	2	10	89046	89055	40 %	0 %	40 %	20 %	384052261
65	NC_017118	AGCGG	2	10	90658	90667	20 %	0 %	60 %	20 %	384052262
66	NC_017118	TCGCC	2	10	90767	90776	0 %	20 %	20 %	60 %	384052262
67	NC_017118	GCATG	2	10	90953	90962	20 %	20 %	40 %	20 %	384052262
68	NC_017118	ATTCC	2	10	91458	91467	20 %	40 %	0 %	40 %	384052262
69	NC_017118	AGCGA	2	10	93876	93885	40 %	0 %	40 %	20 %	384052264
70	NC_017118	CAAAG	2	10	96047	96056	60 %	0 %	20 %	20 %	384052267
71	NC_017118	CAGCC	2	10	96867	96876	20 %	0 %	20 %	60 %	384052268
72	NC_017118	GTTGG	2	10	100432	100441	0 %	40 %	60 %	0 %	384052272
73	NC_017118	TTTTC	2	10	101545	101554	0 %	80 %	0 %	20 %	384052272
74	NC_017118	GTGCC	2	10	102071	102080	0 %	20 %	40 %	40 %	384052272
75	NC_017118	CCAGC	2	10	102558	102567	20 %	0 %	20 %	60 %	384052274
76	NC_017118	GTGGC	2	10	103067	103076	0 %	20 %	60 %	20 %	384052274
77	NC_017118	CACTG	2	10	103983	103992	20 %	20 %	20 %	40 %	384052276
78	NC_017118	TGGAC	2	10	104346	104355	20 %	20 %	40 %	20 %	384052276
79	NC_017118	GGACA	2	10	105552	105561	40 %	0 %	40 %	20 %	384052278
80	NC_017118	TGCGC	2	10	110147	110156	0 %	20 %	40 %	40 %	384052283
81	NC_017118	GGACA	2	10	112712	112721	40 %	0 %	40 %	20 %	384052285
82	NC_017118	CCATG	2	10	114613	114622	20 %	20 %	20 %	40 %	384052286
83	NC_017118	GATAC	2	10	116689	116698	40 %	20 %	20 %	20 %	384052288
84	NC_017118	GCTGG	2	10	117551	117560	0 %	20 %	60 %	20 %	384052289
85	NC_017118	CTGAC	2	10	118186	118195	20 %	20 %	20 %	40 %	384052292
86	NC_017118	TTTTC	2	10	118980	118989	0 %	80 %	0 %	20 %	384052293
87	NC_017118	CGTTT	2	10	119631	119640	0 %	60 %	20 %	20 %	384052294
88	NC_017118	CACTG	2	10	121386	121395	20 %	20 %	20 %	40 %	384052294
89	NC_017118	TTATT	2	10	126656	126665	20 %	80 %	0 %	0 %	384052299
90	NC_017118	CGTTC	2	10	127203	127212	0 %	40 %	20 %	40 %	384052300
91	NC_017118	CGGTC	2	10	128949	128958	0 %	20 %	40 %	40 %	384052301
92	NC_017118	GAAGC	2	10	132093	132102	40 %	0 %	40 %	20 %	384052302
93	NC_017118	TCAAG	2	10	133131	133140	40 %	20 %	20 %	20 %	384052303
94	NC_017118	CAGGA	2	10	134251	134260	40 %	0 %	40 %	20 %	384052304
95	NC_017118	CGGAC	2	10	135105	135114	20 %	0 %	40 %	40 %	384052304
96	NC_017118	GAGCA	2	10	137241	137250	40 %	0 %	40 %	20 %	384052306
97	NC_017118	GACAG	2	10	138415	138424	40 %	0 %	40 %	20 %	384052308
98	NC_017118	AGCGG	2	10	142650	142659	20 %	0 %	60 %	20 %	384052310
99	NC_017118	AGGTC	2	10	147737	147746	20 %	20 %	40 %	20 %	384052314
100	NC_017118	CATCG	2	10	149288	149297	20 %	20 %	20 %	40 %	384052315
101	NC_017118	GGCAG	2	10	149790	149799	20 %	0 %	60 %	20 %	384052316
102	NC_017118	CGGCA	2	10	150231	150240	20 %	0 %	40 %	40 %	384052316
103	NC_017118	CCTCA	2	10	152774	152783	20 %	20 %	0 %	60 %	384052319
104	NC_017118	CCGGG	2	10	153849	153858	0 %	0 %	60 %	40 %	384052320
105	NC_017118	CGTTT	2	10	154790	154799	0 %	60 %	20 %	20 %	384052322
106	NC_017118	TGTCC	2	10	156969	156978	0 %	40 %	20 %	40 %	384052324
107	NC_017118	GCCAT	2	10	159119	159128	20 %	20 %	20 %	40 %	384052326
108	NC_017118	AGCTG	2	10	160166	160175	20 %	20 %	40 %	20 %	384052327
109	NC_017118	CGTTC	2	10	162714	162723	0 %	40 %	20 %	40 %	384052331
110	NC_017118	CCCTG	2	10	166572	166581	0 %	20 %	20 %	60 %	384052332
111	NC_017118	CTGCT	2	10	168244	168253	0 %	40 %	20 %	40 %	384052332
112	NC_017118	GAGGG	2	10	168396	168405	20 %	0 %	80 %	0 %	384052332
113	NC_017118	TTGAA	2	10	172596	172605	40 %	40 %	20 %	0 %	384052335
114	NC_017118	GCGTT	2	10	172737	172746	0 %	40 %	40 %	20 %	384052335
115	NC_017118	GGGCA	2	10	174165	174174	20 %	0 %	60 %	20 %	384052336
116	NC_017118	GGCAC	2	10	175804	175813	20 %	0 %	40 %	40 %	384052337

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.