MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-22 plasmid pAPA22-010

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017117	GGCGCG	2	12	1810	1821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384055708
2	NC_017117	GGCTGG	2	12	1834	1845	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384055708
3	NC_017117	ATTGTC	2	12	12564	12575	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384055716
4	NC_017117	CCTGTC	2	12	12584	12595	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384055716
5	NC_017117	TGGATG	2	12	14493	14504	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384055717
6	NC_017117	CATCCA	2	12	19467	19478	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384055721
7	NC_017117	GGAACT	2	12	21233	21244	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384055724
8	NC_017117	CATGCT	2	12	24243	24254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384055726
9	NC_017117	TAAGGG	2	12	27320	27331	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384055729
10	NC_017117	TGGATG	2	12	28734	28745	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384055731
11	NC_017117	AACAAG	2	12	29979	29990	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384055732
12	NC_017117	TCCTGA	2	12	39121	39132	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384055741
13	NC_017117	TGGATG	2	12	40716	40727	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384055743
14	NC_017117	TGGATG	2	12	42385	42396	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384055744
15	NC_017117	GTGCTT	2	12	45366	45377	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384055747
16	NC_017117	GGCATC	2	12	50296	50307	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384055751
17	NC_017117	CGTCAG	2	12	52349	52360	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384055753
18	NC_017117	GGCGTG	2	12	61662	61673	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384055759
19	NC_017117	CATCCA	2	12	64476	64487	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384055761
20	NC_017117	CATTAT	2	12	69429	69440	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384055764
21	NC_017117	GAGGAC	2	12	73109	73120	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384055768
22	NC_017117	CATCCA	2	12	76044	76055	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384055770
23	NC_017117	AACCAG	2	12	77379	77390	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384055771
24	NC_017117	CATCCA	2	12	89434	89445	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384055780
25	NC_017117	TGGATG	2	12	93612	93623	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384055785
26	NC_017117	GAATAA	2	12	96102	96113	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384055788
27	NC_017117	TCTTAA	2	12	96355	96366	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384055788
28	NC_017117	TTTGCC	2	12	102638	102649	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384055793
29	NC_017117	GGCATC	2	12	108418	108429	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384055799
30	NC_017117	CAGCCG	2	12	109468	109479	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384055800
31	NC_017117	CTTCCT	2	12	113562	113573	0 %	50 %	0 %	50 %	384055805
32	NC_017117	AGCGGA	2	12	114298	114309	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384055807
33	NC_017117	GGGCCA	2	12	117318	117329	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384055808
34	NC_017117	TGCAGG	2	12	119871	119882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384055810
35	NC_017117	CATCCA	2	12	130544	130555	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384055823
36	NC_017117	CCCCCT	2	12	131984	131995	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	384055825
37	NC_017117	CCAGAA	2	12	138846	138857	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384055834
38	NC_017117	GAGGAA	2	12	139891	139902	50 %	0 %	50 %	0 %	384055835
39	NC_017117	CATCCA	2	12	141646	141657	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384055836
40	NC_017117	TGGATG	2	12	145067	145078	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384055839
41	NC_017117	CCCACG	2	12	148847	148858	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384055840
42	NC_017117	GATGCC	2	12	151115	151126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384055844
43	NC_017117	CTTCCT	2	12	153522	153533	0 %	50 %	0 %	50 %	384055845
44	NC_017117	TGGATG	2	12	160521	160532	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384055858
45	NC_017117	GATGCC	2	12	163524	163535	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384055861
46	NC_017117	CATCCA	2	12	164915	164926	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384055862
47	NC_017117	GCCATC	2	12	171296	171307	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384055867
48	NC_017117	TGGATG	2	12	181129	181140	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384055877
49	NC_017117	TGGATG	2	12	182810	182821	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384055878
50	NC_017117	TCCAGC	2	12	185807	185818	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384055880
51	NC_017117	ATTCTG	2	12	186617	186628	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384055880
52	NC_017117	ATACCG	2	12	187931	187942	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384055881
53	NC_017117	TCAGTT	2	12	188098	188109	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384055881

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.