MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-22 plasmid pAPA22-010

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017117	GCTGG	2	10	272	281	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017117	GGAAA	2	10	1869	1878	60 %	0 %	40 %	0 %	384055708
3	NC_017117	GGCTC	2	10	2132	2141	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017117	TGCCA	2	10	3100	3109	20 %	20 %	20 %	40 %	384055709
5	NC_017117	CGATC	2	10	3215	3224	20 %	20 %	20 %	40 %	384055709
6	NC_017117	GAGCT	2	10	3806	3815	20 %	20 %	40 %	20 %	384055710
7	NC_017117	CTGTG	2	10	5534	5543	0 %	40 %	40 %	20 %	384055712
8	NC_017117	ATGTG	2	10	7497	7506	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017117	ATCCG	2	10	8722	8731	20 %	20 %	20 %	40 %	384055715
10	NC_017117	AAGCC	2	10	9063	9072	40 %	0 %	20 %	40 %	384055716
11	NC_017117	TACGC	2	10	11257	11266	20 %	20 %	20 %	40 %	384055716
12	NC_017117	GGACA	2	10	18664	18673	40 %	0 %	40 %	20 %	384055721
13	NC_017117	TTTCT	2	10	19997	20006	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017117	ACCAC	2	10	20504	20513	40 %	0 %	0 %	60 %	384055722
15	NC_017117	CCAGC	2	10	20973	20982	20 %	0 %	20 %	60 %	384055724
16	NC_017117	CTGGC	2	10	22804	22813	0 %	20 %	40 %	40 %	384055726
17	NC_017117	TGCAA	2	10	23370	23379	40 %	20 %	20 %	20 %	384055726
18	NC_017117	CTGGT	2	10	23661	23670	0 %	40 %	40 %	20 %	384055726
19	NC_017117	AGAAA	2	10	28206	28215	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017117	TGTCC	2	10	29539	29548	0 %	40 %	20 %	40 %	384055731
21	NC_017117	CACCT	2	10	32507	32516	20 %	20 %	0 %	60 %	384055734
22	NC_017117	GCTCC	2	10	34090	34099	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017117	GCAGG	2	10	36224	36233	20 %	0 %	60 %	20 %	384055737
24	NC_017117	GCTGT	2	10	37273	37282	0 %	40 %	40 %	20 %	384055738
25	NC_017117	CATGC	2	10	39458	39467	20 %	20 %	20 %	40 %	384055741
26	NC_017117	AGAAA	2	10	40188	40197	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017117	TGTCC	2	10	41521	41530	0 %	40 %	20 %	40 %	384055743
28	NC_017117	AGAAA	2	10	41857	41866	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017117	TGTCC	2	10	43190	43199	0 %	40 %	20 %	40 %	384055744
30	NC_017117	ATGGC	2	10	45892	45901	20 %	20 %	40 %	20 %	384055747
31	NC_017117	CCTGA	2	10	46426	46435	20 %	20 %	20 %	40 %	384055747
32	NC_017117	TTATT	2	10	50878	50887	20 %	80 %	0 %	0 %	384055752
33	NC_017117	CGTTC	2	10	51425	51434	0 %	40 %	20 %	40 %	384055753
34	NC_017117	CGGTC	2	10	53171	53180	0 %	20 %	40 %	40 %	384055754
35	NC_017117	GAAGC	2	10	56315	56324	40 %	0 %	40 %	20 %	384055755
36	NC_017117	TCAAG	2	10	57353	57362	40 %	20 %	20 %	20 %	384055756
37	NC_017117	CAGGA	2	10	58473	58482	40 %	0 %	40 %	20 %	384055757
38	NC_017117	CGGAC	2	10	59327	59336	20 %	0 %	40 %	40 %	384055757
39	NC_017117	CACAT	2	10	62762	62771	40 %	20 %	0 %	40 %	384055760
40	NC_017117	ACACA	2	10	65526	65535	60 %	0 %	0 %	40 %	384055762
41	NC_017117	TTACA	2	10	68924	68933	40 %	40 %	0 %	20 %	384055764
42	NC_017117	ACTGT	2	10	69029	69038	20 %	40 %	20 %	20 %	384055764
43	NC_017117	CAACG	2	10	70441	70450	40 %	0 %	20 %	40 %	384055765
44	NC_017117	CCGTC	2	10	71426	71435	0 %	20 %	20 %	60 %	384055766
45	NC_017117	AGCAG	2	10	73839	73848	40 %	0 %	40 %	20 %	384055768
46	NC_017117	GGACA	2	10	75241	75250	40 %	0 %	40 %	20 %	384055770
47	NC_017117	CACAC	2	10	77055	77064	40 %	0 %	0 %	60 %	384055771
48	NC_017117	ACGCC	2	10	81206	81215	20 %	0 %	20 %	60 %	384055773
49	NC_017117	CTTGC	2	10	81753	81762	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017117	CCGCG	2	10	82121	82130	0 %	0 %	40 %	60 %	384055774
51	NC_017117	GCACA	2	10	83016	83025	40 %	0 %	20 %	40 %	384055775
52	NC_017117	TTTCT	2	10	83703	83712	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017117	GCTGT	2	10	84542	84551	0 %	40 %	40 %	20 %	384055777
54	NC_017117	CCAGA	2	10	86644	86653	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017117	CCGAG	2	10	86957	86966	20 %	0 %	40 %	40 %	384055779
56	NC_017117	GGACA	2	10	88631	88640	40 %	0 %	40 %	20 %	384055780
57	NC_017117	TTTCT	2	10	89964	89973	0 %	80 %	0 %	20 %	384055781
58	NC_017117	TCACT	2	10	91086	91095	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017117	AATCA	2	10	91117	91126	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017117	CTGAG	2	10	91134	91143	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017117	TCCTC	2	10	92018	92027	0 %	40 %	0 %	60 %	384055783
62	NC_017117	TTTAC	2	10	92328	92337	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017117	TGTCC	2	10	94417	94426	0 %	40 %	20 %	40 %	384055785
64	NC_017117	ATGCA	2	10	97985	97994	40 %	20 %	20 %	20 %	384055789
65	NC_017117	TTATG	2	10	99884	99893	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017117	CCTGA	2	10	100412	100421	20 %	20 %	20 %	40 %	384055791
67	NC_017117	CATTG	2	10	100452	100461	20 %	40 %	20 %	20 %	384055791
68	NC_017117	CAAGG	2	10	101510	101519	40 %	0 %	40 %	20 %	384055791
69	NC_017117	CTGGG	2	10	101756	101765	0 %	20 %	60 %	20 %	384055791
70	NC_017117	AGGGG	2	10	102000	102009	20 %	0 %	80 %	0 %	384055791
71	NC_017117	GACAT	2	10	103750	103759	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017117	CTATT	2	10	105164	105173	20 %	60 %	0 %	20 %	384055795
73	NC_017117	GTATT	2	10	111048	111057	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017117	GTCAC	2	10	114532	114541	20 %	20 %	20 %	40 %	384055807
75	NC_017117	TTGGA	2	10	117884	117893	20 %	40 %	40 %	0 %	384055808
76	NC_017117	CGGTT	2	10	118992	119001	0 %	40 %	40 %	20 %	384055809
77	NC_017117	CGTCC	2	10	125739	125748	0 %	20 %	20 %	60 %	384055817
78	NC_017117	TTTCA	2	10	125980	125989	20 %	60 %	0 %	20 %	384055817
79	NC_017117	TTATT	2	10	128712	128721	20 %	80 %	0 %	0 %	384055821
80	NC_017117	GGACA	2	10	129741	129750	40 %	0 %	40 %	20 %	384055823
81	NC_017117	TTTCT	2	10	131074	131083	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017117	GCCCT	2	10	131732	131741	0 %	20 %	20 %	60 %	384055825
83	NC_017117	GCCAC	2	10	133334	133343	20 %	0 %	20 %	60 %	384055827
84	NC_017117	GCTGG	2	10	133843	133852	0 %	20 %	60 %	20 %	384055827
85	NC_017117	AGCGA	2	10	134278	134287	40 %	0 %	40 %	20 %	384055829
86	NC_017117	ATAGT	2	10	135483	135492	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017117	TCCGT	2	10	136931	136940	0 %	40 %	20 %	40 %	384055833
88	NC_017117	CTGCG	2	10	137659	137668	0 %	20 %	40 %	40 %	384055833
89	NC_017117	TCGCG	2	10	138194	138203	0 %	20 %	40 %	40 %	384055833
90	NC_017117	CGTCC	2	10	140341	140350	0 %	20 %	20 %	60 %	384055835
91	NC_017117	GGACA	2	10	140843	140852	40 %	0 %	40 %	20 %	384055836
92	NC_017117	TTTCT	2	10	142176	142185	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017117	CATGG	2	10	142960	142969	20 %	20 %	40 %	20 %	384055838
94	NC_017117	AATTA	2	10	143125	143134	60 %	40 %	0 %	0 %	384055838
95	NC_017117	CTTTT	2	10	144088	144097	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017117	ATGAC	2	10	144228	144237	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017117	AGAAA	2	10	144539	144548	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017117	TGTCC	2	10	145872	145881	0 %	40 %	20 %	40 %	384055839
99	NC_017117	TGATC	2	10	146221	146230	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017117	CAGAT	2	10	146425	146434	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017117	ACCGT	2	10	146974	146983	20 %	20 %	20 %	40 %	384055840
102	NC_017117	GATCA	2	10	147606	147615	40 %	20 %	20 %	20 %	384055840
103	NC_017117	TGGGG	2	10	149552	149561	0 %	20 %	80 %	0 %	384055842
104	NC_017117	GGCAC	2	10	151674	151683	20 %	0 %	40 %	40 %	384055844
105	NC_017117	AAACA	2	10	153828	153837	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017117	CTTCC	2	10	154431	154440	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_017117	CTGCC	2	10	156003	156012	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_017117	CCAAC	2	10	157572	157581	40 %	0 %	0 %	60 %	384055851
109	NC_017117	CTGCC	2	10	158689	158698	0 %	20 %	20 %	60 %	384055855
110	NC_017117	GCCAT	2	10	159041	159050	20 %	20 %	20 %	40 %	384055856
111	NC_017117	GCCAC	2	10	159863	159872	20 %	0 %	20 %	60 %	384055857
112	NC_017117	AGAAA	2	10	159993	160002	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017117	TGTCC	2	10	161326	161335	0 %	40 %	20 %	40 %	384055858
114	NC_017117	TCTAT	2	10	162190	162199	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017117	TGCCC	2	10	162875	162884	0 %	20 %	20 %	60 %	384055860
116	NC_017117	GGACA	2	10	164112	164121	40 %	0 %	40 %	20 %	384055862
117	NC_017117	TTTCT	2	10	165445	165454	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017117	CATCT	2	10	165605	165614	20 %	40 %	0 %	40 %	384055863
119	NC_017117	ATCGC	2	10	165864	165873	20 %	20 %	20 %	40 %	384055863
120	NC_017117	CCAAC	2	10	166064	166073	40 %	0 %	0 %	60 %	384055864
121	NC_017117	TCCGG	2	10	167303	167312	0 %	20 %	40 %	40 %	384055864
122	NC_017117	CTGCT	2	10	169091	169100	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017117	CCGGA	2	10	169207	169216	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017117	TCCGG	2	10	171792	171801	0 %	20 %	40 %	40 %	384055868
125	NC_017117	TCGCG	2	10	171852	171861	0 %	20 %	40 %	40 %	384055868
126	NC_017117	CCCGG	2	10	172059	172068	0 %	0 %	40 %	60 %	384055869
127	NC_017117	GTCCG	2	10	172663	172672	0 %	20 %	40 %	40 %	384055869
128	NC_017117	TGATC	2	10	173413	173422	20 %	40 %	20 %	20 %	384055870
129	NC_017117	ACACC	2	10	174986	174995	40 %	0 %	0 %	60 %	384055872
130	NC_017117	AGTAG	2	10	175619	175628	40 %	20 %	40 %	0 %	384055872
131	NC_017117	ATGCA	2	10	176400	176409	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017117	CGATG	2	10	177197	177206	20 %	20 %	40 %	20 %	384055873
133	NC_017117	GGAAA	2	10	178085	178094	60 %	0 %	40 %	0 %	384055874
134	NC_017117	AGAAA	2	10	180601	180610	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017117	TGTCC	2	10	181934	181943	0 %	40 %	20 %	40 %	384055877
136	NC_017117	AGAAA	2	10	182282	182291	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017117	TGTCC	2	10	183615	183624	0 %	40 %	20 %	40 %	384055878
138	NC_017117	GCCCA	2	10	184918	184927	20 %	0 %	20 %	60 %	384055880
139	NC_017117	TGCTC	2	10	185727	185736	0 %	40 %	20 %	40 %	384055880
140	NC_017117	CCGAG	2	10	186324	186333	20 %	0 %	40 %	40 %	384055880
141	NC_017117	CATGC	2	10	186871	186880	20 %	20 %	20 %	40 %	384055881
142	NC_017117	CCTGC	2	10	187451	187460	0 %	20 %	20 %	60 %	384055881
143	NC_017117	ACGAC	2	10	190011	190020	40 %	0 %	20 %	40 %	384055882
144	NC_017117	CCAGC	2	10	190361	190370	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_017117	GCCAC	2	10	191190	191199	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.