MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-22 plasmid pAPA22-010

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017117	GCTGG	2	10	272	281	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017117	GGCTC	2	10	2132	2141	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017117	ATGTG	2	10	7497	7506	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017117	TTTCT	2	10	19997	20006	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017117	AGAAA	2	10	28206	28215	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017117	GCTCC	2	10	34090	34099	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_017117	AGAAA	2	10	40188	40197	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017117	AGAAA	2	10	41857	41866	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017117	CTTGC	2	10	81753	81762	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017117	TTTCT	2	10	83703	83712	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017117	CCAGA	2	10	86644	86653	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017117	TCACT	2	10	91086	91095	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017117	AATCA	2	10	91117	91126	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017117	CTGAG	2	10	91134	91143	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017117	TTTAC	2	10	92328	92337	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017117	TTATG	2	10	99884	99893	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017117	GACAT	2	10	103750	103759	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017117	GTATT	2	10	111048	111057	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017117	TTTCT	2	10	131074	131083	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017117	ATAGT	2	10	135483	135492	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017117	TTTCT	2	10	142176	142185	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017117	CTTTT	2	10	144088	144097	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017117	ATGAC	2	10	144228	144237	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017117	AGAAA	2	10	144539	144548	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017117	TGATC	2	10	146221	146230	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017117	CAGAT	2	10	146425	146434	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017117	AAACA	2	10	153828	153837	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017117	CTTCC	2	10	154431	154440	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017117	CTGCC	2	10	156003	156012	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017117	AGAAA	2	10	159993	160002	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017117	TCTAT	2	10	162190	162199	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017117	TTTCT	2	10	165445	165454	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017117	CTGCT	2	10	169091	169100	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017117	CCGGA	2	10	169207	169216	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017117	ATGCA	2	10	176400	176409	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017117	AGAAA	2	10	180601	180610	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017117	AGAAA	2	10	182282	182291	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017117	CCAGC	2	10	190361	190370	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_017117	GCCAC	2	10	191190	191199	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.