MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-22 plasmid pAPA22-010

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017117	GGAAA	2	10	1869	1878	60 %	0 %	40 %	0 %	384055708
2	NC_017117	TGCCA	2	10	3100	3109	20 %	20 %	20 %	40 %	384055709
3	NC_017117	CGATC	2	10	3215	3224	20 %	20 %	20 %	40 %	384055709
4	NC_017117	GAGCT	2	10	3806	3815	20 %	20 %	40 %	20 %	384055710
5	NC_017117	CTGTG	2	10	5534	5543	0 %	40 %	40 %	20 %	384055712
6	NC_017117	ATCCG	2	10	8722	8731	20 %	20 %	20 %	40 %	384055715
7	NC_017117	AAGCC	2	10	9063	9072	40 %	0 %	20 %	40 %	384055716
8	NC_017117	TACGC	2	10	11257	11266	20 %	20 %	20 %	40 %	384055716
9	NC_017117	GGACA	2	10	18664	18673	40 %	0 %	40 %	20 %	384055721
10	NC_017117	ACCAC	2	10	20504	20513	40 %	0 %	0 %	60 %	384055722
11	NC_017117	CCAGC	2	10	20973	20982	20 %	0 %	20 %	60 %	384055724
12	NC_017117	CTGGC	2	10	22804	22813	0 %	20 %	40 %	40 %	384055726
13	NC_017117	TGCAA	2	10	23370	23379	40 %	20 %	20 %	20 %	384055726
14	NC_017117	CTGGT	2	10	23661	23670	0 %	40 %	40 %	20 %	384055726
15	NC_017117	TGTCC	2	10	29539	29548	0 %	40 %	20 %	40 %	384055731
16	NC_017117	CACCT	2	10	32507	32516	20 %	20 %	0 %	60 %	384055734
17	NC_017117	GCAGG	2	10	36224	36233	20 %	0 %	60 %	20 %	384055737
18	NC_017117	GCTGT	2	10	37273	37282	0 %	40 %	40 %	20 %	384055738
19	NC_017117	CATGC	2	10	39458	39467	20 %	20 %	20 %	40 %	384055741
20	NC_017117	TGTCC	2	10	41521	41530	0 %	40 %	20 %	40 %	384055743
21	NC_017117	TGTCC	2	10	43190	43199	0 %	40 %	20 %	40 %	384055744
22	NC_017117	ATGGC	2	10	45892	45901	20 %	20 %	40 %	20 %	384055747
23	NC_017117	CCTGA	2	10	46426	46435	20 %	20 %	20 %	40 %	384055747
24	NC_017117	TTATT	2	10	50878	50887	20 %	80 %	0 %	0 %	384055752
25	NC_017117	CGTTC	2	10	51425	51434	0 %	40 %	20 %	40 %	384055753
26	NC_017117	CGGTC	2	10	53171	53180	0 %	20 %	40 %	40 %	384055754
27	NC_017117	GAAGC	2	10	56315	56324	40 %	0 %	40 %	20 %	384055755
28	NC_017117	TCAAG	2	10	57353	57362	40 %	20 %	20 %	20 %	384055756
29	NC_017117	CAGGA	2	10	58473	58482	40 %	0 %	40 %	20 %	384055757
30	NC_017117	CGGAC	2	10	59327	59336	20 %	0 %	40 %	40 %	384055757
31	NC_017117	CACAT	2	10	62762	62771	40 %	20 %	0 %	40 %	384055760
32	NC_017117	ACACA	2	10	65526	65535	60 %	0 %	0 %	40 %	384055762
33	NC_017117	TTACA	2	10	68924	68933	40 %	40 %	0 %	20 %	384055764
34	NC_017117	ACTGT	2	10	69029	69038	20 %	40 %	20 %	20 %	384055764
35	NC_017117	CAACG	2	10	70441	70450	40 %	0 %	20 %	40 %	384055765
36	NC_017117	CCGTC	2	10	71426	71435	0 %	20 %	20 %	60 %	384055766
37	NC_017117	AGCAG	2	10	73839	73848	40 %	0 %	40 %	20 %	384055768
38	NC_017117	GGACA	2	10	75241	75250	40 %	0 %	40 %	20 %	384055770
39	NC_017117	CACAC	2	10	77055	77064	40 %	0 %	0 %	60 %	384055771
40	NC_017117	ACGCC	2	10	81206	81215	20 %	0 %	20 %	60 %	384055773
41	NC_017117	CCGCG	2	10	82121	82130	0 %	0 %	40 %	60 %	384055774
42	NC_017117	GCACA	2	10	83016	83025	40 %	0 %	20 %	40 %	384055775
43	NC_017117	GCTGT	2	10	84542	84551	0 %	40 %	40 %	20 %	384055777
44	NC_017117	CCGAG	2	10	86957	86966	20 %	0 %	40 %	40 %	384055779
45	NC_017117	GGACA	2	10	88631	88640	40 %	0 %	40 %	20 %	384055780
46	NC_017117	TTTCT	2	10	89964	89973	0 %	80 %	0 %	20 %	384055781
47	NC_017117	TCCTC	2	10	92018	92027	0 %	40 %	0 %	60 %	384055783
48	NC_017117	TGTCC	2	10	94417	94426	0 %	40 %	20 %	40 %	384055785
49	NC_017117	ATGCA	2	10	97985	97994	40 %	20 %	20 %	20 %	384055789
50	NC_017117	CCTGA	2	10	100412	100421	20 %	20 %	20 %	40 %	384055791
51	NC_017117	CATTG	2	10	100452	100461	20 %	40 %	20 %	20 %	384055791
52	NC_017117	CAAGG	2	10	101510	101519	40 %	0 %	40 %	20 %	384055791
53	NC_017117	CTGGG	2	10	101756	101765	0 %	20 %	60 %	20 %	384055791
54	NC_017117	AGGGG	2	10	102000	102009	20 %	0 %	80 %	0 %	384055791
55	NC_017117	CTATT	2	10	105164	105173	20 %	60 %	0 %	20 %	384055795
56	NC_017117	GTCAC	2	10	114532	114541	20 %	20 %	20 %	40 %	384055807
57	NC_017117	TTGGA	2	10	117884	117893	20 %	40 %	40 %	0 %	384055808
58	NC_017117	CGGTT	2	10	118992	119001	0 %	40 %	40 %	20 %	384055809
59	NC_017117	CGTCC	2	10	125739	125748	0 %	20 %	20 %	60 %	384055817
60	NC_017117	TTTCA	2	10	125980	125989	20 %	60 %	0 %	20 %	384055817
61	NC_017117	TTATT	2	10	128712	128721	20 %	80 %	0 %	0 %	384055821
62	NC_017117	GGACA	2	10	129741	129750	40 %	0 %	40 %	20 %	384055823
63	NC_017117	GCCCT	2	10	131732	131741	0 %	20 %	20 %	60 %	384055825
64	NC_017117	GCCAC	2	10	133334	133343	20 %	0 %	20 %	60 %	384055827
65	NC_017117	GCTGG	2	10	133843	133852	0 %	20 %	60 %	20 %	384055827
66	NC_017117	AGCGA	2	10	134278	134287	40 %	0 %	40 %	20 %	384055829
67	NC_017117	TCCGT	2	10	136931	136940	0 %	40 %	20 %	40 %	384055833
68	NC_017117	CTGCG	2	10	137659	137668	0 %	20 %	40 %	40 %	384055833
69	NC_017117	TCGCG	2	10	138194	138203	0 %	20 %	40 %	40 %	384055833
70	NC_017117	CGTCC	2	10	140341	140350	0 %	20 %	20 %	60 %	384055835
71	NC_017117	GGACA	2	10	140843	140852	40 %	0 %	40 %	20 %	384055836
72	NC_017117	CATGG	2	10	142960	142969	20 %	20 %	40 %	20 %	384055838
73	NC_017117	AATTA	2	10	143125	143134	60 %	40 %	0 %	0 %	384055838
74	NC_017117	TGTCC	2	10	145872	145881	0 %	40 %	20 %	40 %	384055839
75	NC_017117	ACCGT	2	10	146974	146983	20 %	20 %	20 %	40 %	384055840
76	NC_017117	GATCA	2	10	147606	147615	40 %	20 %	20 %	20 %	384055840
77	NC_017117	TGGGG	2	10	149552	149561	0 %	20 %	80 %	0 %	384055842
78	NC_017117	GGCAC	2	10	151674	151683	20 %	0 %	40 %	40 %	384055844
79	NC_017117	CCAAC	2	10	157572	157581	40 %	0 %	0 %	60 %	384055851
80	NC_017117	CTGCC	2	10	158689	158698	0 %	20 %	20 %	60 %	384055855
81	NC_017117	GCCAT	2	10	159041	159050	20 %	20 %	20 %	40 %	384055856
82	NC_017117	GCCAC	2	10	159863	159872	20 %	0 %	20 %	60 %	384055857
83	NC_017117	TGTCC	2	10	161326	161335	0 %	40 %	20 %	40 %	384055858
84	NC_017117	TGCCC	2	10	162875	162884	0 %	20 %	20 %	60 %	384055860
85	NC_017117	GGACA	2	10	164112	164121	40 %	0 %	40 %	20 %	384055862
86	NC_017117	CATCT	2	10	165605	165614	20 %	40 %	0 %	40 %	384055863
87	NC_017117	ATCGC	2	10	165864	165873	20 %	20 %	20 %	40 %	384055863
88	NC_017117	CCAAC	2	10	166064	166073	40 %	0 %	0 %	60 %	384055864
89	NC_017117	TCCGG	2	10	167303	167312	0 %	20 %	40 %	40 %	384055864
90	NC_017117	TCCGG	2	10	171792	171801	0 %	20 %	40 %	40 %	384055868
91	NC_017117	TCGCG	2	10	171852	171861	0 %	20 %	40 %	40 %	384055868
92	NC_017117	CCCGG	2	10	172059	172068	0 %	0 %	40 %	60 %	384055869
93	NC_017117	GTCCG	2	10	172663	172672	0 %	20 %	40 %	40 %	384055869
94	NC_017117	TGATC	2	10	173413	173422	20 %	40 %	20 %	20 %	384055870
95	NC_017117	ACACC	2	10	174986	174995	40 %	0 %	0 %	60 %	384055872
96	NC_017117	AGTAG	2	10	175619	175628	40 %	20 %	40 %	0 %	384055872
97	NC_017117	CGATG	2	10	177197	177206	20 %	20 %	40 %	20 %	384055873
98	NC_017117	GGAAA	2	10	178085	178094	60 %	0 %	40 %	0 %	384055874
99	NC_017117	TGTCC	2	10	181934	181943	0 %	40 %	20 %	40 %	384055877
100	NC_017117	TGTCC	2	10	183615	183624	0 %	40 %	20 %	40 %	384055878
101	NC_017117	GCCCA	2	10	184918	184927	20 %	0 %	20 %	60 %	384055880
102	NC_017117	TGCTC	2	10	185727	185736	0 %	40 %	20 %	40 %	384055880
103	NC_017117	CCGAG	2	10	186324	186333	20 %	0 %	40 %	40 %	384055880
104	NC_017117	CATGC	2	10	186871	186880	20 %	20 %	20 %	40 %	384055881
105	NC_017117	CCTGC	2	10	187451	187460	0 %	20 %	20 %	60 %	384055881
106	NC_017117	ACGAC	2	10	190011	190020	40 %	0 %	20 %	40 %	384055882

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.