MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-22 plasmid pAPA22-010

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017117	CTTC	2	8	1004	1011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017117	ACGG	2	8	2378	2385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017117	GATC	3	12	2574	2585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017117	TCGT	2	8	4285	4292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017117	AGCC	2	8	4843	4850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017117	CGGT	2	8	8484	8491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017117	TTGC	2	8	13240	13247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017117	CGAT	2	8	13374	13381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017117	GACT	2	8	13488	13495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017117	ACAG	2	8	15390	15397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017117	TAAC	2	8	17996	18003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017117	TTTG	2	8	18031	18038	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017117	CTGT	2	8	18574	18581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017117	TCTT	2	8	25386	25393	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017117	ACTG	2	8	27856	27863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017117	ACAG	2	8	29631	29638	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017117	GACT	2	8	30431	30438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017117	CCAC	2	8	34123	34130	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_017117	CCAT	2	8	37118	37125	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017117	CCGT	2	8	38351	38358	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017117	ATCC	2	8	38488	38495	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017117	ATCC	2	8	38675	38682	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017117	ACAG	2	8	41613	41620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017117	ACAG	2	8	43282	43289	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017117	AATA	2	8	45221	45228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017117	AGGC	2	8	48111	48118	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017117	CTTC	2	8	49117	49124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017117	GTGA	2	8	49213	49220	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017117	GGTA	2	8	50601	50608	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017117	AAAT	2	8	60924	60931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017117	CTGT	2	8	63583	63590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017117	GGAA	2	8	65126	65133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017117	CTGA	2	8	67454	67461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017117	TTTA	2	8	67566	67573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017117	GTCA	2	8	69881	69888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017117	CTTA	2	8	74563	74570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017117	CCAG	2	8	74773	74780	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017117	GATA	2	8	74810	74817	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017117	CTGT	2	8	75151	75158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017117	CCTG	2	8	80578	80585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017117	GTGG	2	8	81642	81649	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017117	CAGG	2	8	81740	81747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017117	GAAT	2	8	84262	84269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017117	CCAT	2	8	84387	84394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017117	CAAG	2	8	85540	85547	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017117	CCGG	2	8	86631	86638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017117	ATTG	2	8	86676	86683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017117	CCAG	2	8	87707	87714	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017117	CGTC	2	8	87907	87914	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017117	AACT	2	8	88078	88085	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017117	CTGT	2	8	88541	88548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017117	GTTC	2	8	91049	91056	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017117	AAAG	2	8	91185	91192	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017117	ACTT	2	8	92342	92349	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017117	TACC	2	8	92376	92383	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017117	ACAG	2	8	94509	94516	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017117	CTTT	2	8	95753	95760	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017117	TGTT	2	8	95788	95795	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017117	AGTA	2	8	95928	95935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017117	AAAT	2	8	96015	96022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017117	GATG	2	8	100314	100321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017117	ATTG	2	8	103513	103520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017117	GTAA	2	8	103724	103731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017117	GGTA	2	8	104332	104339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017117	AGAT	2	8	104535	104542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017117	TTCT	2	8	104867	104874	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017117	TATT	2	8	105415	105422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017117	CTTG	2	8	105446	105453	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017117	GTGA	2	8	107335	107342	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017117	CAAT	2	8	111071	111078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017117	GTGC	2	8	126500	126507	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017117	TGGA	2	8	128468	128475	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017117	CTGT	2	8	129651	129658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017117	TTGA	2	8	132047	132054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017117	TTGA	2	8	132089	132096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017117	AGCA	2	8	135513	135520	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017117	GCCG	2	8	136622	136629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017117	GGCG	2	8	138671	138678	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017117	ACGA	2	8	139658	139665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017117	CTGT	2	8	140753	140760	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017117	GAAC	2	8	144038	144045	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017117	ACAG	2	8	145964	145971	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017117	GCAG	2	8	146649	146656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017117	CTGT	2	8	149517	149524	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017117	CTCA	2	8	152201	152208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017117	TCAA	2	8	153624	153631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017117	CAAC	2	8	153667	153674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017117	GATA	2	8	157329	157336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017117	ACAG	2	8	161418	161425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017117	TGCT	2	8	161743	161750	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017117	ATTC	2	8	162292	162299	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017117	CTGT	2	8	164022	164029	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017117	TCGC	2	8	169163	169170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017117	ACGC	2	8	169294	169301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017117	TCCT	2	8	174101	174108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017117	CCAG	2	8	174625	174632	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017117	TGTA	2	8	174695	174702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017117	GATA	2	8	180034	180041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017117	TGAG	2	8	180171	180178	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017117	GTGA	2	8	180237	180244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017117	ACAG	2	8	182026	182033	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017117	ACAG	2	8	183707	183714	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017117	GCCA	2	8	188997	189004	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017117	GACA	2	8	189416	189423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017117	CGGG	2	8	189784	189791	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017117	GAAG	2	8	190331	190338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017117	TGGA	2	8	190746	190753	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017117	CAAA	2	8	191009	191016	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017117	TGAC	2	8	191143	191150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017117	TCCA	2	8	191316	191323	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.