MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-040

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017115	CAT	2	6	114	119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044073
2	NC_017115	TAA	2	6	131	136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384044073
3	NC_017115	CAG	2	6	283	288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044073
4	NC_017115	GAT	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044073
5	NC_017115	TCA	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044074
6	NC_017115	CAC	2	6	950	955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044074
7	NC_017115	CAG	2	6	1047	1052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044074
8	NC_017115	CGG	2	6	1094	1099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384044074
9	NC_017115	AGC	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044074
10	NC_017115	TTC	2	6	1170	1175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384044074
11	NC_017115	ACA	2	6	1183	1188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384044074
12	NC_017115	AAG	2	6	1215	1220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044074
13	NC_017115	AGA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044074
14	NC_017115	AGC	2	6	1310	1315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044074
15	NC_017115	CAT	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384044074
16	NC_017115	GAA	2	6	1538	1543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044074
17	NC_017115	GCC	2	6	1578	1583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044074
18	NC_017115	CGC	2	6	1602	1607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384044074
19	NC_017115	GGC	2	6	1693	1698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384044074
20	NC_017115	AGC	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044074
21	NC_017115	GAG	2	6	1749	1754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384044074
22	NC_017115	AGG	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384044074
23	NC_017115	TGA	2	6	1796	1801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044074
24	NC_017115	CAG	3	9	1804	1812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044074
25	NC_017115	AAG	2	6	1836	1841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384044074
26	NC_017115	GAC	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384044074
27	NC_017115	AGG	2	6	1936	1941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384044074
28	NC_017115	GGC	2	6	2090	2095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384044074
29	NC_017115	TGA	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384044075
30	NC_017115	TGC	2	6	2778	2783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044075
31	NC_017115	GCT	2	6	2785	2790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384044075
32	NC_017115	CCA	2	6	2871	2876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044075
33	NC_017115	GGA	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384044075
34	NC_017115	ACC	2	6	2998	3003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384044075

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.