MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-030

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017114	TTGT	2	8	685	692	0 %	75 %	25 %	0 %	384043828
2	NC_017114	AGAA	2	8	889	896	75 %	0 %	25 %	0 %	384043828
3	NC_017114	TGAA	2	8	1399	1406	50 %	25 %	25 %	0 %	384043829
4	NC_017114	GGCG	2	8	1515	1522	0 %	0 %	75 %	25 %	384043830
5	NC_017114	CGAT	2	8	1595	1602	25 %	25 %	25 %	25 %	384043830
6	NC_017114	TTGA	2	8	1848	1855	25 %	50 %	25 %	0 %	384043830
7	NC_017114	GTAA	2	8	2733	2740	50 %	25 %	25 %	0 %	384043832
8	NC_017114	TCTG	2	8	3038	3045	0 %	50 %	25 %	25 %	384043832
9	NC_017114	CTCA	2	8	3269	3276	25 %	25 %	0 %	50 %	384043833
10	NC_017114	GATG	2	8	3378	3385	25 %	25 %	50 %	0 %	384043833
11	NC_017114	GTCC	2	8	4177	4184	0 %	25 %	25 %	50 %	384043835
12	NC_017114	GCCA	2	8	4893	4900	25 %	0 %	25 %	50 %	384043835
13	NC_017114	ACCC	2	8	4945	4952	25 %	0 %	0 %	75 %	384043835
14	NC_017114	AGAA	2	8	5068	5075	75 %	0 %	25 %	0 %	384043835
15	NC_017114	AACT	2	8	6159	6166	50 %	25 %	0 %	25 %	384043835
16	NC_017114	TGGC	2	8	6952	6959	0 %	25 %	50 %	25 %	384043837
17	NC_017114	AGCG	2	8	7805	7812	25 %	0 %	50 %	25 %	384043839
18	NC_017114	TGAC	2	8	8169	8176	25 %	25 %	25 %	25 %	384043840
19	NC_017114	TCCA	2	8	8342	8349	25 %	25 %	0 %	50 %	384043840
20	NC_017114	CTTC	2	8	8757	8764	0 %	50 %	0 %	50 %	384043841
21	NC_017114	CTGA	2	8	8839	8846	25 %	25 %	25 %	25 %	384043841
22	NC_017114	TGCT	2	8	9217	9224	0 %	50 %	25 %	25 %	384043842
23	NC_017114	TGTC	2	8	10276	10283	0 %	50 %	25 %	25 %	384043843
24	NC_017114	TGAT	2	8	10540	10547	25 %	50 %	25 %	0 %	384043844
25	NC_017114	AATC	2	8	10835	10842	50 %	25 %	0 %	25 %	384043844
26	NC_017114	CTCG	2	8	11087	11094	0 %	25 %	25 %	50 %	384043844
27	NC_017114	GATG	2	8	11472	11479	25 %	25 %	50 %	0 %	384043844
28	NC_017114	AGAA	2	8	11792	11799	75 %	0 %	25 %	0 %	384043844
29	NC_017114	CAGC	2	8	11847	11854	25 %	0 %	25 %	50 %	384043844
30	NC_017114	TCGA	2	8	12399	12406	25 %	25 %	25 %	25 %	384043845
31	NC_017114	AGCG	2	8	13231	13238	25 %	0 %	50 %	25 %	384043846
32	NC_017114	ATTG	2	8	14735	14742	25 %	50 %	25 %	0 %	384043849
33	NC_017114	CATT	2	8	15015	15022	25 %	50 %	0 %	25 %	384043849
34	NC_017114	ACTC	2	8	17141	17148	25 %	25 %	0 %	50 %	384043851
35	NC_017114	GCCG	3	12	17947	17958	0 %	0 %	50 %	50 %	384043853
36	NC_017114	CCAG	2	8	18331	18338	25 %	0 %	25 %	50 %	384043854
37	NC_017114	AGGG	2	8	19143	19150	25 %	0 %	75 %	0 %	384043857
38	NC_017114	TTGC	2	8	19234	19241	0 %	50 %	25 %	25 %	384043857
39	NC_017114	GCCT	2	8	20095	20102	0 %	25 %	25 %	50 %	384043860
40	NC_017114	TCGA	2	8	20198	20205	25 %	25 %	25 %	25 %	384043860
41	NC_017114	CCGG	2	8	20534	20541	0 %	0 %	50 %	50 %	384043861
42	NC_017114	GGAC	2	8	20880	20887	25 %	0 %	50 %	25 %	384043861
43	NC_017114	GATC	2	8	21054	21061	25 %	25 %	25 %	25 %	384043861
44	NC_017114	CCGG	2	8	21115	21122	0 %	0 %	50 %	50 %	384043861
45	NC_017114	TCGC	2	8	21439	21446	0 %	25 %	25 %	50 %	384043861
46	NC_017114	TCTG	2	8	21834	21841	0 %	50 %	25 %	25 %	384043861
47	NC_017114	CAGG	2	8	22806	22813	25 %	0 %	50 %	25 %	384043861
48	NC_017114	GCCG	2	8	23034	23041	0 %	0 %	50 %	50 %	384043861
49	NC_017114	GCGG	2	8	23226	23233	0 %	0 %	75 %	25 %	384043861
50	NC_017114	GCGG	2	8	23352	23359	0 %	0 %	75 %	25 %	384043861
51	NC_017114	GATC	2	8	23962	23969	25 %	25 %	25 %	25 %	384043863
52	NC_017114	GGGC	2	8	24179	24186	0 %	0 %	75 %	25 %	384043863
53	NC_017114	GACG	2	8	24775	24782	25 %	0 %	50 %	25 %	384043865
54	NC_017114	GCGG	2	8	25583	25590	0 %	0 %	75 %	25 %	384043865
55	NC_017114	GCCA	2	8	25718	25725	25 %	0 %	25 %	50 %	384043865
56	NC_017114	TCTG	2	8	26058	26065	0 %	50 %	25 %	25 %	384043865
57	NC_017114	CCTT	2	8	26190	26197	0 %	50 %	0 %	50 %	384043866
58	NC_017114	GAAT	2	8	26259	26266	50 %	25 %	25 %	0 %	384043866
59	NC_017114	ACTG	2	8	26316	26323	25 %	25 %	25 %	25 %	384043866
60	NC_017114	AGCA	2	8	28629	28636	50 %	0 %	25 %	25 %	384043869
61	NC_017114	GCTG	2	8	29049	29056	0 %	25 %	50 %	25 %	384043870
62	NC_017114	CCCA	2	8	29411	29418	25 %	0 %	0 %	75 %	384043871
63	NC_017114	GGCA	2	8	30017	30024	25 %	0 %	50 %	25 %	384043871
64	NC_017114	TGAC	2	8	30386	30393	25 %	25 %	25 %	25 %	384043872
65	NC_017114	TCCA	2	8	30559	30566	25 %	25 %	0 %	50 %	384043872
66	NC_017114	CTTC	2	8	30974	30981	0 %	50 %	0 %	50 %	384043873
67	NC_017114	CTGA	2	8	31056	31063	25 %	25 %	25 %	25 %	384043873
68	NC_017114	ATCA	2	8	32777	32784	50 %	25 %	0 %	25 %	384043875
69	NC_017114	CTGC	2	8	32875	32882	0 %	25 %	25 %	50 %	384043875
70	NC_017114	CCTT	2	8	33525	33532	0 %	50 %	0 %	50 %	384043875
71	NC_017114	GGAC	2	8	33727	33734	25 %	0 %	50 %	25 %	384043875
72	NC_017114	GTTC	2	8	34324	34331	0 %	50 %	25 %	25 %	384043875
73	NC_017114	CCGA	2	8	34703	34710	25 %	0 %	25 %	50 %	384043876
74	NC_017114	TTGT	2	8	35031	35038	0 %	75 %	25 %	0 %	384043876
75	NC_017114	AGGA	2	8	35054	35061	50 %	0 %	50 %	0 %	384043876
76	NC_017114	TTTC	2	8	35344	35351	0 %	75 %	0 %	25 %	384043876
77	NC_017114	CCGC	2	8	36163	36170	0 %	0 %	25 %	75 %	384043876
78	NC_017114	GCCT	2	8	36320	36327	0 %	25 %	25 %	50 %	384043876
79	NC_017114	GATG	2	8	37126	37133	25 %	25 %	50 %	0 %	384043876
80	NC_017114	TCCG	2	8	37575	37582	0 %	25 %	25 %	50 %	384043877
81	NC_017114	GATG	2	8	37855	37862	25 %	25 %	50 %	0 %	384043877
82	NC_017114	CCCG	2	8	37969	37976	0 %	0 %	25 %	75 %	384043877
83	NC_017114	ATCA	2	8	38288	38295	50 %	25 %	0 %	25 %	384043877
84	NC_017114	ATGA	2	8	39916	39923	50 %	25 %	25 %	0 %	384043879
85	NC_017114	CCAA	2	8	40274	40281	50 %	0 %	0 %	50 %	384043880
86	NC_017114	ACCG	2	8	40628	40635	25 %	0 %	25 %	50 %	384043880
87	NC_017114	CGCT	2	8	40801	40808	0 %	25 %	25 %	50 %	384043881
88	NC_017114	GACG	2	8	41845	41852	25 %	0 %	50 %	25 %	384043883
89	NC_017114	CTTC	2	8	42484	42491	0 %	50 %	0 %	50 %	384043883
90	NC_017114	CGGG	2	8	42654	42661	0 %	0 %	75 %	25 %	384043883
91	NC_017114	CTGC	2	8	42745	42752	0 %	25 %	25 %	50 %	384043883
92	NC_017114	GCCA	2	8	42788	42795	25 %	0 %	25 %	50 %	384043883
93	NC_017114	TCTG	2	8	43128	43135	0 %	50 %	25 %	25 %	384043883
94	NC_017114	AGGA	2	8	43290	43297	50 %	0 %	50 %	0 %	384043884
95	NC_017114	GTCC	2	8	43959	43966	0 %	25 %	25 %	50 %	384043885
96	NC_017114	GCCA	2	8	44675	44682	25 %	0 %	25 %	50 %	384043885
97	NC_017114	ACCC	2	8	44727	44734	25 %	0 %	0 %	75 %	384043885
98	NC_017114	AGAA	2	8	44850	44857	75 %	0 %	25 %	0 %	384043885
99	NC_017114	GAAG	2	8	46552	46559	50 %	0 %	50 %	0 %	384043886
100	NC_017114	TGGA	2	8	46967	46974	25 %	25 %	50 %	0 %	384043887
101	NC_017114	GTCA	2	8	47140	47147	25 %	25 %	25 %	25 %	384043887

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.